116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3269 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3269  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  100 
 
 		 419 aa  851    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  51.44 
 
 		 461 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  41.75 
 
 		 480 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  40.41 
 
 		 479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10667  dioxygenase  39.52 
 
 		 501 aa  294  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.181912  normal  0.435726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1698  carotenoid oxygenase  41.19 
 
 		 480 aa  283  5.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.459113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  39.6 
 
 		 451 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  39.16 
 
 		 451 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  39.16 
 
 		 451 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  40.62 
 
 		 444 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  38.16 
 
 		 469 aa  270  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  40.83 
 
 		 459 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  40.87 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6035  carotenoid oxygenase  37.69 
 
 		 479 aa  249  5e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.96012  normal  0.0939223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  34.85 
 
 		 463 aa  242  9e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  34.55 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  30.32 
 
 		 765 aa  217  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  31.18 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  36.36 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  36.36 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  35.16 
 
 		 445 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  35.16 
 
 		 445 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  36.36 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  36.36 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  36.36 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  36.36 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  35.78 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  31.06 
 
 		 487 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  32.98 
 
 		 464 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  30.62 
 
 		 487 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  35.02 
 
 		 445 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  35.41 
 
 		 445 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  35.25 
 
 		 443 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1428  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  35.92 
 
 		 443 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  33.2 
 
 		 483 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  32.84 
 
 		 460 aa  186  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  33.91 
 
 		 467 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  31.01 
 
 		 477 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  34.04 
 
 		 466 aa  180  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  32.55 
 
 		 467 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  31.86 
 
 		 487 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  32.05 
 
 		 467 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  31.91 
 
 		 467 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  32.28 
 
 		 478 aa  170  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  33.19 
 
 		 473 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10931  dioxygenase  30.33 
 
 		 502 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  31.69 
 
 		 467 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  28.01 
 
 		 498 aa  160  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  31.29 
 
 		 481 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  30.98 
 
 		 496 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  31.26 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  31.26 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  27.99 
 
 		 488 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3050  predicted protein  29.4 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  27.66 
 
 		 495 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  27.45 
 
 		 495 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  27.31 
 
 		 510 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1807  carotenoid oxygenase  29.61 
 
 		 512 aa  142  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4940  carotenoid oxygenase  28.68 
 
 		 537 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97423  normal  0.0157069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4537  carotenoid oxygenase  32.44 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.368379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6365  Carotenoid oxygenase  32.4 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259005 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  25.43 
 
 		 489 aa  136  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  26.98 
 
 		 914 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  26.95 
 
 		 514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  25.11 
 
 		 491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  28.9 
 
 		 517 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  29.8 
 
 		 464 aa  126  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01643  lignostilbene dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01500)  28.51 
 
 		 480 aa  119  7e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  27.41 
 
 		 493 aa  119  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  26.1 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  27.9 
 
 		 555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  24.78 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  24.78 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  26.92 
 
 		 501 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4862  Beta-carotene 15,15'-monooxygenase  28.78 
 
 		 470 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  26.81 
 
 		 486 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  28.69 
 
 		 509 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1036  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase  22.52 
 
 		 470 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  26.94 
 
 		 488 aa  106  9e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  27.74 
 
 		 489 aa  99.8  7e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3688  carotenoid oxygenase  24.63 
 
 		 485 aa  99.8  8e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25111  retinal pigment epithelial membrane protein  25.62 
 
 		 507 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  27.65 
 
 		 481 aa  95.5  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  25.9 
 
 		 502 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  24.17 
 
 		 472 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.123356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5321  Carotenoid oxygenase  24.25 
 
 		 477 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48352  predicted protein  24.95 
 
 		 551 aa  88.2  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03031  retinal pigment epithelial membrane protein  23.77 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0282  retinal pigment epithelial membrane protein  22.75 
 
 		 494 aa  80.1  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0182948  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30717  predicted protein  25.05 
 
 		 533 aa  79.7  0.00000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.990452 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2809  carotenoid oxygenase  25.71 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3952  Carotenoid oxygenase  24.35 
 
 		 499 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273513  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03041  retinal pigment epithelial membrane protein  23.16 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  24.84 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03131  retinal pigment epithelial membrane protein  23.01 
 
 		 495 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  24.24 
 
 		 508 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  24.24 
 
 		 508 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4083  Carotenoid oxygenase  25.16 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03071  retinal pigment epithelial membrane protein  22.57 
 
 		 495 aa  76.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43374  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  24.42 
 
 		 617 aa  73.6  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0989754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>