88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6365 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6365  Carotenoid oxygenase  100 
 
 		 408 aa  812    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259005 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3580  carotenoid oxygenase  32.07 
 
 		 469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2484  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  34.18 
 
 		 461 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.217647  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1698  carotenoid oxygenase  30.61 
 
 		 480 aa  153  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.459113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6035  carotenoid oxygenase  30.09 
 
 		 479 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.96012  normal  0.0939223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3269  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  32.4 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5460  carotenoid oxygenase  30.27 
 
 		 459 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645484 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3794  carotenoid oxygenase  26.71 
 
 		 464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0662225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0935  Carotenoid oxygenase  23.28 
 
 		 488 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1332  carotenoid oxygenase  31.4 
 
 		 444 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.447717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2047  retinal pigment epithelial membrane protein  26.87 
 
 		 765 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5950  crocetin dialdehyde  25.49 
 
 		 488 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5235  carotenoid oxygenase  28.57 
 
 		 451 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4956  carotenoid oxygenase  28.09 
 
 		 451 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4867  carotenoid oxygenase  28.09 
 
 		 451 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3710  retinal pigment epithelial membrane protein  25.69 
 
 		 463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0352  Carotenoid oxygenase  22.14 
 
 		 487 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0359  Carotenoid oxygenase  22.38 
 
 		 487 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.235865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2656  carotenoid oxygenase  25.73 
 
 		 477 aa  107  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5723  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  27.44 
 
 		 441 aa  106  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00560936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1317  carotenoid oxygenase  24.61 
 
 		 467 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4595  carotenoid oxygenase  35.03 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2111  carotenoid oxygenase  35.23 
 
 		 480 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.457029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1216  carotenoid oxygenase  24.89 
 
 		 467 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.548821 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0281  carotenoid oxygenase  27.36 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.772775  hitchhiker  0.000581153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2946  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  29.05 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000652034  hitchhiker  0.000168571 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10667  dioxygenase  35.47 
 
 		 501 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.181912  normal  0.435726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2806  carotenoid oxygenase  26.67 
 
 		 445 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0300  carotenoid oxygenase  26.67 
 
 		 445 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.473918  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3399  retinal pigment epithelial membrane protein  26.45 
 
 		 443 aa  93.6  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.452417  normal  0.802561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4841  Carotenoid oxygenase  22.68 
 
 		 464 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.659326 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3944  Carotenoid oxygenase  27.62 
 
 		 481 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0227  carotenoid oxygenase  25.75 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1401  Carotenoid oxygenase  23.71 
 
 		 467 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0219  carotenoid oxygenase  25.75 
 
 		 445 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5477  putative carotenoid oxygenase  26.15 
 
 		 467 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_3050  predicted protein  25.17 
 
 		 467 aa  87  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.601284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1536  carotenoid oxygenase  25.23 
 
 		 467 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0771367  normal  0.379655 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0441  carotenoid oxygenase  24.6 
 
 		 460 aa  83.2  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.786971  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01643  lignostilbene dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01500)  24.77 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.600702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5644  carotenoid oxygenase  25.32 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.427984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1236  retinal pigment epithelial membrane protein  24.72 
 
 		 510 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4222  Carotenoid oxygenase  24.68 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0865656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3212  carotenoid oxygenase  22.35 
 
 		 489 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.415925  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1233  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  24.94 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0130033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0635  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  24.94 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.617766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1459  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  24.94 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0518  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  24.94 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.615695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1562  putative dioxygenase  24.94 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3058  carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase, putative  24.94 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4537  carotenoid oxygenase  27.91 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.368379 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4340  Carotenoid oxygenase  21.98 
 
 		 495 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1428  putative carotenoid 9,10-9',10' cleavage dioxygenase  24.71 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4402  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  22.42 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371573 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07062  conserved hypothetical protein  21.46 
 
 		 555 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1272  carotenoid oxygenase  25.74 
 
 		 487 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261404  hitchhiker  0.00803245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4053  Carotenoid oxygenase  27.5 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3417  dioxygenase, putative  24.57 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05214  dioxygenase signal peptide protein  25.6 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0248  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  24.73 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0802  carotenoid oxygenase  21.78 
 
 		 494 aa  63.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.957651  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0611  carotenoid oxygenase  24.51 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.951978 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0221  lignostilbene-alpha,beta-dioxygenase and related enzyme-like  24.31 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0449  Carotenoid oxygenase  21.33 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1008  carotenoid oxygenase  22.95 
 
 		 498 aa  63.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0158946  normal  0.495511 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0196  Beta-carotene 15,15'-dioxygenase  24.83 
 
 		 493 aa  63.2  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1807  carotenoid oxygenase  23.4 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1535  9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase  24.89 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194369  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5459  Carotenoid oxygenase  25.45 
 
 		 514 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176097  normal  0.349671 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0203  carotenoid oxygenase  24.14 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.297924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3118  carotenoid oxygenase  22.96 
 
 		 496 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.704266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3098  carotenoid oxygenase  22.96 
 
 		 496 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3158  carotenoid oxygenase  22.96 
 
 		 496 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.350488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2446  twin-arginine translocation pathway signal  22.1 
 
 		 517 aa  53.1  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000341259  normal  0.858746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2824  carotenoid oxygenase  28.57 
 
 		 504 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119472  Carotenoid dioxygenase plastidic fusion protein, putative  21.67 
 
 		 914 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0452333  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10931  dioxygenase  22.03 
 
 		 502 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3359  carotenoid oxygenase  24.8 
 
 		 502 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3964  Carotenoid oxygenase  27.31 
 
 		 486 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.99286  normal  0.591573 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03601  retinal pigment epithelial membrane protein  21.41 
 
 		 497 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4940  carotenoid oxygenase  23.54 
 
 		 537 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.97423  normal  0.0157069 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1646  retinal pigment epithelial membrane protein  21.19 
 
 		 497 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4033  Carotenoid oxygenase  23.62 
 
 		 508 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3919  Carotenoid oxygenase  23.62 
 
 		 508 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0013  Carotenoid oxygenase  21.59 
 
 		 468 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0015  Carotenoid oxygenase  21.59 
 
 		 468 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2809  carotenoid oxygenase  22.13 
 
 		 497 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.220593  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2168  retinal pigment epithelial membrane protein  25 
 
 		 472 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.123356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>