106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2094 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2094  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  263  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  40.94 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  29.69 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2821  hypothetical protein  38.76 
 
 		 315 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.875118  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2015  hypothetical protein  38 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  28.91 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  36.36 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0902  hypothetical protein  32 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  34.4 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  29.46 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  26.77 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  32.14 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  26.56 
 
 		 137 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  35.63 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2623  hypothetical protein  37.21 
 
 		 305 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.140164  normal  0.486862 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2366  hypothetical protein  38.93 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  28 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  32.8 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000546433  hitchhiker  0.00000644081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0060  protein of unknown function DUF35  34.52 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  29.46 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  30.53 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  30.85 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  36.46 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  27.56 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  24.6 
 
 		 321 aa  57.4  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  32.58 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  31.46 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  31.5 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  28.8 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  31.5 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  31.5 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  32.56 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  25.81 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  26.52 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  35.56 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  31.4 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3856  protein of unknown function DUF35  33.07 
 
 		 322 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.343505  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0340  protein of unknown function DUF35  27.43 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000262786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  35.23 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  29.7 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  29.85 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0436  protein of unknown function DUF35  25.51 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.686015  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  30.34 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  29.55 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  24.35 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  25.2 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  27.2 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  25.93 
 
 		 550 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  25.93 
 
 		 550 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  25.93 
 
 		 550 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13575  hypothetical protein  28.68 
 
 		 311 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328171 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5644  hypothetical protein  27.56 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0836  hypothetical protein  29.11 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2360  hypothetical protein  43.14 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.116484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6833  hypothetical protein  33.68 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1648  hypothetical protein  30.17 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0377  hypothetical protein  27.52 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.253705  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0023  hypothetical protein  26.61 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1609  protein of unknown function DUF35  30.12 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5255  hypothetical protein  30.95 
 
 		 324 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338508 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0397  hypothetical protein  25.32 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  28.8 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  23.48 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  30.7 
 
 		 417 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0387  hypothetical protein  27.06 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.448785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  30.95 
 
 		 312 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5453  hypothetical protein  32.14 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0654575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  32.14 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  25.69 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  22.4 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1625  hypothetical protein  28.83 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0155  hypothetical protein  26.5 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0460  hypothetical protein  26.61 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0490887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5539  hypothetical protein  29.31 
 
 		 141 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5059  hypothetical protein  31.76 
 
 		 317 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.945383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  23.93 
 
 		 132 aa  42.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  22.61 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  32.5 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  24.73 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4674  hypothetical protein  28.57 
 
 		 318 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4760  hypothetical protein  28.57 
 
 		 318 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  31.25 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  25 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  20.91 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1459  hypothetical protein  26.61 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  24.35 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  30.95 
 
 		 152 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  30.95 
 
 		 152 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  30.95 
 
 		 152 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  30.95 
 
 		 152 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  26.5 
 
 		 141 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0553  hypothetical protein  30.95 
 
 		 152 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0635  hypothetical protein  30.95 
 
 		 152 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  32.69 
 
 		 417 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  27.87 
 
 		 120 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  26.72 
 
 		 548 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  33.33 
 
 		 541 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  26.5 
 
 		 548 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0458  hypothetical protein  25.32 
 
 		 182 aa  40.4  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>