74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0033 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0033  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  486  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2566  transcriptional regulator, MarR family  54.51 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460606  normal  0.11891 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0501  transcriptional regulator, MarR family  55.36 
 
 		 253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6466  hypothetical protein  55.86 
 
 		 316 aa  226  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.893622  normal  0.0778626 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2741  hypothetical protein  58.47 
 
 		 232 aa  221  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0457955  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5015  hypothetical protein  56.28 
 
 		 244 aa  218  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0614805 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0456  transcriptional regulator, MarR family  56.22 
 
 		 251 aa  214  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.169685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3324  transcriptional regulator, MarR family  55.41 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0275415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1076  hypothetical protein  49.14 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5388  hypothetical protein  42.96 
 
 		 172 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5391  hypothetical protein  42.95 
 
 		 155 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36940  predicted transcriptional regulator  36.67 
 
 		 169 aa  99  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.830889  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1000  hypothetical protein  36.42 
 
 		 169 aa  95.5  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.642132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2203  hypothetical protein  41.61 
 
 		 150 aa  95.1  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5635  hypothetical protein  39.29 
 
 		 193 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0365755 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2190  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 159 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.235216  normal  0.0245413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2247  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 159 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2201  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 159 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0777  transcriptional regulator, TrmB  32.62 
 
 		 153 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162484  normal  0.537638 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0102  hypothetical protein  30.71 
 
 		 161 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.870138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0088  regulatory protein, MarR  32.89 
 
 		 158 aa  64.3  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4698  hypothetical protein  31.21 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0959  hypothetical protein  51.47 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.498536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2558  transcriptional regulator TrmB  34.56 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2900  MarR regulatory protein  33.11 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  0.115809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1433  integrase catalytic subunit  39.33 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3959  integrase catalytic subunit  39.33 
 
 		 386 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1238  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 386 aa  55.1  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2225  integrase catalytic subunit  50 
 
 		 370 aa  55.1  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1562  regulatory protein, MarR  23.24 
 
 		 159 aa  54.7  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1754  integrase catalytic region  44.44 
 
 		 386 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22920  transposase, IS30 family  49.23 
 
 		 385 aa  53.1  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.200558 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15120  transposase, IS30 family  49.23 
 
 		 385 aa  53.1  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0851499  normal  0.892726 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1529  integrase catalytic subunit  28.86 
 
 		 342 aa  52.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00474191 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4463  transposase IS1088  28.86 
 
 		 342 aa  52.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985118  normal  0.0492126 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1592  integrase catalytic subunit  28.86 
 
 		 342 aa  52.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  normal  0.214322 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2382  integrase catalytic subunit  28.86 
 
 		 342 aa  52.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000024142  hitchhiker  0.0000200818 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5718  transposase IS1088  28.86 
 
 		 342 aa  52.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5755  transposase IS1088  28.86 
 
 		 342 aa  52.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.335377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4418  transposase IS1088  28.86 
 
 		 342 aa  52.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182446  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4207  transposase IS1088  28.86 
 
 		 342 aa  52.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4122  transposase IS1088  28.86 
 
 		 342 aa  52.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.618296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4684  regulatory protein, MarR  26.57 
 
 		 157 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.261368  normal  0.0600861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3656  regulatory protein, MarR  27.98 
 
 		 179 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1836  integrase catalytic subunit  39.71 
 
 		 380 aa  49.7  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4580  regulatory protein, MarR  29.77 
 
 		 157 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3640  integrase  30.71 
 
 		 343 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1692  integrase catalytic subunit  39.71 
 
 		 380 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4334  Fis family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 386 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0382  integrase catalytic subunit  31.65 
 
 		 401 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0329218 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 166 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3419  integrase catalytic region  40.98 
 
 		 386 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0492382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5901  transcriptional regulator, ArsR family  32 
 
 		 180 aa  45.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.660241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0481  integrase catalytic subunit  30.32 
 
 		 401 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.103123 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6587  integrase catalytic region  43.1 
 
 		 385 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6641  integrase catalytic region  43.1 
 
 		 385 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0741  putative transposase IS30  43.75 
 
 		 385 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18405  normal  0.376382 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2074  transcriptional regulator, TrmB  38.57 
 
 		 127 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0492265  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3059  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0490355 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2765  integrase catalytic subunit  39.68 
 
 		 386 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.936307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1190  integrase  44.44 
 
 		 386 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4465  regulatory protein, MarR  25.36 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0736  Integrase catalytic region  47.92 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  35.44 
 
 		 177 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2452  hypothetical protein  26.45 
 
 		 168 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000738344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4930  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 		 192 aa  42.4  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.653338  hitchhiker  0.000469457 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4419  Integrase catalytic region  41.27 
 
 		 315 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000630887  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1240  integrase catalytic subunit  37.5 
 
 		 317 aa  42.4  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.04127  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3440  integrase catalytic subunit  41.27 
 
 		 315 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2850  integrase catalytic subunit  41.27 
 
 		 315 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0884338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1266  integrase catalytic subunit  41.27 
 
 		 315 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.705785  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0176  hypothetical protein  24.46 
 
 		 153 aa  42  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.750866  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1249  integrase, catalytic region  37.5 
 
 		 246 aa  42  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0925898  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2926  regulatory protein, MarR  24.66 
 
 		 163 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>