53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3910 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  440  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  91.98 
 
 
212 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  92.45 
 
 
212 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  92.45 
 
 
212 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.31362e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  91.98 
 
 
212 aa  406  1e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  4.96851e-12 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  83.96 
 
 
212 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  82.55 
 
 
212 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  82.55 
 
 
212 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  82.08 
 
 
212 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  66.04 
 
 
220 aa  295  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  60.85 
 
 
220 aa  275  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  58.49 
 
 
232 aa  273  1e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  8.60939e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  60.85 
 
 
222 aa  270  9e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  62.44 
 
 
222 aa  266  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  56.6 
 
 
226 aa  251  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  8.69669e-05  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  53.02 
 
 
223 aa  221  9e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  35.81 
 
 
222 aa  147  8e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  37.04 
 
 
214 aa  146  2e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
212 aa  145  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  36.97 
 
 
225 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  35.38 
 
 
233 aa  142  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  33.18 
 
 
212 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  32.23 
 
 
212 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  34.6 
 
 
215 aa  133  2e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
257 aa  129  4e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
217 aa  127  1e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
213 aa  125  4e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 
216 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  34.13 
 
 
223 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  34.27 
 
 
212 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  34.58 
 
 
222 aa  122  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  33.18 
 
 
212 aa  122  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  32.86 
 
 
212 aa  120  2e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
212 aa  118  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  30.52 
 
 
215 aa  117  1e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  30.62 
 
 
230 aa  117  2e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
223 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  30.99 
 
 
212 aa  115  7e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  30.33 
 
 
211 aa  114  9e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  34.6 
 
 
214 aa  113  2e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  31.78 
 
 
217 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  29.44 
 
 
211 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  30.7 
 
 
211 aa  104  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  29.11 
 
 
215 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  30.54 
 
 
214 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  29.05 
 
 
211 aa  95.9  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 
217 aa  95.5  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  28.44 
 
 
213 aa  80.5  2e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  27.51 
 
 
214 aa  77.8  1e-13  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  22.12 
 
 
214 aa  71.2  1e-11  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  21.88 
 
 
286 aa  48.9  5e-05  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  24.32 
 
 
336 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  27.78 
 
 
746 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>