More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4767 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0983  ABC transporter related  67.74 
 
 		 501 aa  691    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04097  predicted sugar transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  66.2 
 
 		 500 aa  680    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3765  ABC transporter related protein  66.2 
 
 		 500 aa  679    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4067  ABC transporter related  81.54 
 
 		 496 aa  827    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4228  ABC transporter related protein  78.67 
 
 		 506 aa  795    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4482  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  66.4 
 
 		 500 aa  681    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4706  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  66.6 
 
 		 500 aa  686    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.706122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4798  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  66.4 
 
 		 500 aa  681    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0969  ABC transporter related  66.87 
 
 		 500 aa  686    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4038  ABC transporter related  79.28 
 
 		 506 aa  803    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04061  hypothetical protein  66.2 
 
 		 500 aa  680    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3782  ABC transporter related  66.4 
 
 		 500 aa  683    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0476  putative sugar ABC transporter periplasmic sugar-binding protein  81.54 
 
 		 496 aa  827    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.251819  normal  0.0934917 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0148  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  81.34 
 
 		 496 aa  826    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361964  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0413  ABC transporter related  67.07 
 
 		 500 aa  681    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4767  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 503 aa  1002    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.883977 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1905  ABC transporter related  61.01 
 
 		 507 aa  622  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308353  normal  0.5938 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1721  ABC transporter related  60.61 
 
 		 507 aa  619  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0492105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2128  putative ABC transporter ATP-binding protein  61.18 
 
 		 516 aa  612  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4909  ABC transporter related  58.76 
 
 		 505 aa  598  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.368986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1417  ABC transporter related  58.94 
 
 		 515 aa  567  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.441776  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5049  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  56.57 
 
 		 512 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2119  ABC transporter related  55.14 
 
 		 504 aa  526  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.307687  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0767  putative sugar uptake ABC transporter ATP-binding protein  54.2 
 
 		 501 aa  525  1e-148  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.162932 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1987  ABC transporter related  52.42 
 
 		 500 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.063033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1987  ABC transporter related  52.42 
 
 		 499 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.479214  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2074  ABC transporter related  52.42 
 
 		 499 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.144534  hitchhiker  0.0000031172 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2058  ABC transporter related  51.01 
 
 		 499 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2148  ABC transporter related  50.6 
 
 		 499 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.123365  normal  0.259949 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3534  ABC transporter related  52.02 
 
 		 523 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.116696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6222  sugar ABC transporter ATP-binding protein  54.53 
 
 		 503 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.597291 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1224  ABC transporter related  48.61 
 
 		 510 aa  500  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0420  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 507 aa  496  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4096  ABC transporter related  52.13 
 
 		 525 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4208  ABC transporter related  52.13 
 
 		 525 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.577364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1854  ABC transporter related  50.92 
 
 		 505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.99038  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0279  ABC transporter related  49.7 
 
 		 526 aa  466  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.60123  normal  0.12609 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0046  sugar ABC transporter ATPase  47.82 
 
 		 513 aa  462  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0138528  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5517  ABC transporter related  50.2 
 
 		 516 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422457  normal  0.0683787 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6194  ABC transporter related  50.2 
 
 		 504 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5626  ABC transporter related  51.26 
 
 		 504 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000841006  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5991  ABC transporter related  51.26 
 
 		 504 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122815  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5925  ABC transporter related  49.8 
 
 		 504 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.737944  normal  0.893001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2251  ABC transporter-related protein  51.65 
 
 		 511 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.687423  hitchhiker  0.00000468234 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6482  ABC transporter related  50.74 
 
 		 504 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.611957  normal  0.251961 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5962  ABC transporter related  49.69 
 
 		 503 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0248969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4809  ABC transporter related  49.4 
 
 		 549 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0173038  hitchhiker  0.00297179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1048  ABC transporter related  49.7 
 
 		 506 aa  451  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3040  ABC transporter related protein  48.21 
 
 		 529 aa  443  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2343  ATP binding protein of ABC transporter  50.52 
 
 		 502 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0380  ABC transporter related  45.26 
 
 		 544 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01030  monosaccharide ABC transporter ATP-binding protein  46.63 
 
 		 522 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4739  ABC transporter related  46.88 
 
 		 497 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.383875  hitchhiker  0.00325994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4341  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  44.66 
 
 		 544 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2025  ABC transporter related  47.61 
 
 		 519 aa  425  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  45.42 
 
 		 499 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4365  ABC transporter related  43.32 
 
 		 585 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  0.0851247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2370  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43 
 
 		 518 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  41.55 
 
 		 506 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  42.6 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  42.05 
 
 		 513 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  41.91 
 
 		 495 aa  382  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  42.69 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  42.39 
 
 		 513 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  42.69 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  43.71 
 
 		 504 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  40.78 
 
 		 513 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 		 525 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.19 
 
 		 512 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  40.5 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  44.38 
 
 		 508 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  40.33 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  42.34 
 
 		 502 aa  378  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2238  ABC transporter related  42.42 
 
 		 504 aa  375  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  41.6 
 
 		 503 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  43.4 
 
 		 505 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  41.04 
 
 		 497 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  41.38 
 
 		 508 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  38.01 
 
 		 501 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  42.48 
 
 		 507 aa  373  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2215  ABC transporter related  42.42 
 
 		 509 aa  375  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0215537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  40.24 
 
 		 525 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  40.41 
 
 		 510 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  41.34 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.94 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  40.28 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  39.27 
 
 		 504 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  43.06 
 
 		 520 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  40.73 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  40.57 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  38.13 
 
 		 495 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  40.53 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  41.14 
 
 		 506 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  40.96 
 
 		 501 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  41.4 
 
 		 519 aa  365  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  40.77 
 
 		 512 aa  365  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  39.37 
 
 		 501 aa  365  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  42 
 
 		 861 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  39.1 
 
 		 494 aa  364  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  39.17 
 
 		 501 aa  363  3e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>