More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2182 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1155  hypothetical protein  42.91 
 
 		 783 aa  655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2502  collagenase-like protein  49.69 
 
 		 746 aa  793    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.503721  normal  0.268664 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3754  peptidase U32  43.28 
 
 		 747 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2078  peptidase U32  44.31 
 
 		 746 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.292848  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2182  peptidase U32  100 
 
 		 805 aa  1666    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0246456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3218  peptidase U32  45.2 
 
 		 757 aa  685    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467027 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1301  peptidase U32  44.62 
 
 		 748 aa  688    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.506544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04781  peptidase  61.05 
 
 		 663 aa  438  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001056  peptidase U32  62.1 
 
 		 663 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  39.81 
 
 		 783 aa  243  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0176  peptidase U32  28.14 
 
 		 835 aa  241  5.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1637  peptidase U32  27.27 
 
 		 847 aa  238  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2086  peptidase U32  40.35 
 
 		 839 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0426  peptidase U32  43 
 
 		 767 aa  234  5e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0065  peptidase U32  37.47 
 
 		 822 aa  234  5e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0064  collagenase-like protease  39.49 
 
 		 790 aa  234  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  40.65 
 
 		 886 aa  229  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1374  peptidase U32  36.84 
 
 		 838 aa  226  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.466002  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1712  peptidase U32  39.61 
 
 		 862 aa  226  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000390003  normal  0.623925 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1622  proteinase  27.79 
 
 		 823 aa  224  6e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0350786 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0544  peptidase U32  32.88 
 
 		 835 aa  223  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.814985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  38.05 
 
 		 790 aa  221  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08360  collagenase-like protease  37.24 
 
 		 825 aa  220  7.999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.593453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0370  peptidase U32  35.5 
 
 		 818 aa  219  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0024  peptidase U32  40.69 
 
 		 792 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000675639  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1159  hypothetical protein  33.06 
 
 		 783 aa  217  8e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.904079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02320  collagenase-like protease  25.9 
 
 		 828 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.265597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  28.04 
 
 		 836 aa  214  3.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1336  peptidase U32  38.99 
 
 		 817 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0126233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0229  peptidase U32  36.98 
 
 		 872 aa  213  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.277324  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1861  peptidase U32  40.13 
 
 		 810 aa  211  3e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2136  U32 family peptidase  38.1 
 
 		 783 aa  210  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1848  U32 family peptidase  38.1 
 
 		 783 aa  210  7e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3552  peptidase U32  40.69 
 
 		 792 aa  209  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0040  peptidase U32  43.14 
 
 		 790 aa  209  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  27.58 
 
 		 878 aa  208  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3618  peptidase U32  31.1 
 
 		 790 aa  208  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3761  peptidase U32  39.93 
 
 		 835 aa  207  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0962396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2391  peptidase U32  32.85 
 
 		 848 aa  207  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.740262  normal  0.817298 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1459  peptidase U32  27.72 
 
 		 723 aa  204  5e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0917  peptidase U32  27.85 
 
 		 835 aa  203  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2268  peptidase U32  36.33 
 
 		 826 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0296  peptidase U32  29.21 
 
 		 837 aa  200  7e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0699  peptidase U32  27.6 
 
 		 722 aa  199  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  36.93 
 
 		 716 aa  198  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1237  putative peptidase U32 family protein  37.46 
 
 		 851 aa  197  6e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1474  peptidase U32  38.6 
 
 		 406 aa  194  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00296183  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  38.24 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0071  U32 family peptidase  39.48 
 
 		 746 aa  192  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2966  peptidase U32  38.56 
 
 		 877 aa  192  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.484686  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1293  peptidase U32  37.61 
 
 		 839 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.461857  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2165  peptidase U32  32.6 
 
 		 420 aa  190  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3097  peptidase U32  38.63 
 
 		 668 aa  189  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1649  peptidase U32  34.19 
 
 		 852 aa  189  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0411  U32 family peptidase  37.29 
 
 		 406 aa  189  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.52498e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0587  peptidase U32  35.65 
 
 		 840 aa  189  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.684095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0664  peptidase U32  41.73 
 
 		 696 aa  188  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0317421  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3259  peptidase, U32 family  39.41 
 
 		 668 aa  187  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104421  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1572  peptidase U32  36.79 
 
 		 832 aa  187  7e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.812702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0726  peptidase U32  37.54 
 
 		 667 aa  187  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1337  peptidase U32  34.01 
 
 		 736 aa  187  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1242  putative peptidase U32 family protein  27.91 
 
 		 843 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.648851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18310  Peptidase, U32 family  40.38 
 
 		 666 aa  186  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1084  collagenase  35.16 
 
 		 548 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.795762  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05840  peptidase U32  38.6 
 
 		 406 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000158903  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2414  peptidase U32  35.8 
 
 		 672 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215421  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1338  U32 family protease  37.7 
 
 		 621 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138533  normal  0.134167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0901  peptidase U32  32.53 
 
 		 407 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.451276  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0821  peptidase U32  37.85 
 
 		 644 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3558  peptidase U32  36.66 
 
 		 430 aa  185  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000993466  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3166  peptidase U32  39.03 
 
 		 669 aa  185  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749383  normal  0.18817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1739  U32 family peptidase  39.54 
 
 		 653 aa  185  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00264856  hitchhiker  0.0000000000000113195 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1732  peptidase U32  36.86 
 
 		 873 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0396  peptidase U32  29.96 
 
 		 640 aa  184  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2211  peptidase U32  39.16 
 
 		 653 aa  184  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.722535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2040  peptidase, U32 family  38.72 
 
 		 667 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0020805  hitchhiker  3.90569e-18 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2224  peptidase U32  39.16 
 
 		 667 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1614  U32 family peptidase  39.16 
 
 		 667 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1519  U32 family peptidase  39.16 
 
 		 667 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1793  peptidase U32  40.38 
 
 		 655 aa  183  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01393  predicted peptidase  39.16 
 
 		 653 aa  183  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01403  hypothetical protein  39.16 
 
 		 653 aa  183  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1782  peptidase, U32 family  35.94 
 
 		 654 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1718  peptidase, U32 family  35.94 
 
 		 654 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.378979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1721  peptidase, U32 family  35.94 
 
 		 654 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1033  collagenase  37.5 
 
 		 667 aa  182  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.771528  normal  0.0721423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1557  peptidase, U32 family  35.94 
 
 		 654 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1010  peptidase U32  35.9 
 
 		 411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1738  peptidase, U32 family  35.94 
 
 		 654 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0153  peptidase U32  36.86 
 
 		 805 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2008  peptidase U32  33.88 
 
 		 420 aa  181  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0547  collagenase  33.55 
 
 		 422 aa  181  5.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  35.64 
 
 		 408 aa  181  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3138  peptidase U32  36.83 
 
 		 638 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0828  peptidase U32  36.83 
 
 		 638 aa  181  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00452719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1983  peptidase U32  35.26 
 
 		 654 aa  180  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3086  peptidase U32  34.98 
 
 		 669 aa  180  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193528  normal  0.252382 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0818  peptidase U32  40.6 
 
 		 637 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1028  peptidase U32  37.95 
 
 		 834 aa  179  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2274  peptidase U32  38.29 
 
 		 666 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9196  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>