190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5653 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
222 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.74 
 
 
218 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  53.52 
 
 
218 aa  224  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  49.77 
 
 
218 aa  208  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.35 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.57 
 
 
214 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  40.27 
 
 
219 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.45 
 
 
220 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  40.38 
 
 
215 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 
218 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  35.89 
 
 
214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  36.57 
 
 
219 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.88 
 
 
212 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  34.98 
 
 
227 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  37.44 
 
 
229 aa  106  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.19 
 
 
218 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.81 
 
 
215 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.03 
 
 
222 aa  102  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.09 
 
 
220 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.81 
 
 
213 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  30.45 
 
 
218 aa  102  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.51 
 
 
216 aa  101  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  31.05 
 
 
221 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  31.05 
 
 
221 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.87 
 
 
227 aa  99.8  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.38 
 
 
223 aa  99.4  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.2 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.2 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.2 
 
 
219 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.87 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.4 
 
 
230 aa  92.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.07 
 
 
211 aa  92  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  35 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 
211 aa  85.9  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  36.15 
 
 
216 aa  85.9  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
212 aa  85.5  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  29.63 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  31.8 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.56 
 
 
210 aa  82  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 
211 aa  82  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.7 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  27.98 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 
209 aa  78.2  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  31.6 
 
 
214 aa  77.4  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  30.73 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.19 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  31.19 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  31.19 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  29.05 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  34.43 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05989  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.264873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1761  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.48 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.761689  normal  0.659727 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
227 aa  71.6  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.44 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
209 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3052  hypothetical protein  39.09 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885422  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.55 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02532  hypothetical protein  26.53 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745456  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.68 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26382  predicted protein  28.64 
 
 
267 aa  63.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0549744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  25.49 
 
 
221 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0979  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.36 
 
 
211 aa  63.5  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  30.73 
 
 
216 aa  62.4  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  27.4 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_006686  CND00720  conserved protein  28.65 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10747  predicted protein  27.93 
 
 
246 aa  59.7  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095057  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.39 
 
 
270 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3799  NmrA family protein  26.67 
 
 
216 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00787812  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0652  hypothetical protein  26.67 
 
 
216 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.216659 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3887  NmrA family protein  26.67 
 
 
216 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0809  putative NADH-flavin reductase  24.64 
 
 
219 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0229953  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08621  putative NADH-flavin reductase  25 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.21 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0382  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.98 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2748  hypothetical protein  29.33 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.889964  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.44 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1521  hypothetical protein  28.02 
 
 
209 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.447986  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2224  hypothetical protein  26.83 
 
 
228 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.133127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2353  NmrA-like  29.32 
 
 
223 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.199904  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.88 
 
 
209 aa  55.1  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  25 
 
 
323 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08651  putative NADH-flavin reductase  23.56 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0142417  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08411  putative NADH-flavin reductase  27.31 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.40154  hitchhiker  0.00485134 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
306 aa  53.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.217032  normal  0.873139 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  25 
 
 
323 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1729  hypothetical protein  26.76 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>