More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2068 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 212 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  69.5 
 
 		 201 aa  267  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  69.5 
 
 		 201 aa  266  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.5 
 
 		 208 aa  237  8e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  57 
 
 		 201 aa  230  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.5 
 
 		 201 aa  229  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 203 aa  228  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  56 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  61.58 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  53 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  60 
 
 		 201 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  58 
 
 		 201 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  53.5 
 
 		 197 aa  207  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  54.5 
 
 		 227 aa  205  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  54.23 
 
 		 202 aa  204  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  53.92 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  46.5 
 
 		 200 aa  197  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  48 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  47 
 
 		 200 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  48 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  48 
 
 		 200 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  47.5 
 
 		 200 aa  195  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.5 
 
 		 200 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  48 
 
 		 200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  48 
 
 		 200 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 197 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  54.5 
 
 		 201 aa  194  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  47.5 
 
 		 200 aa  194  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  52.5 
 
 		 201 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  50.25 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  47 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  47 
 
 		 200 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  57.71 
 
 		 200 aa  192  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.74 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.5 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  49 
 
 		 200 aa  188  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.5 
 
 		 201 aa  188  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  50 
 
 		 204 aa  187  7e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.5 
 
 		 205 aa  186  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.5 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.78 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.5 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.99 
 
 		 201 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.53 
 
 		 190 aa  181  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.51 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  51 
 
 		 201 aa  177  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3506  two component LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  51.01 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.5 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 200 aa  174  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  45.73 
 
 		 198 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0357  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  47.8 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.81 
 
 		 211 aa  168  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.76 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.5 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 198 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 198 aa  157  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  44.98 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.71 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0355  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 198 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.881439  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3621  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 198 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3818  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 198 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0351  LuxR family DNA-binding response regulator  43.78 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  40.5 
 
 		 205 aa  154  9e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0889  LuxR family DNA-binding response regulator  36 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000916195  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  39.9 
 
 		 200 aa  151  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2610  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.55 
 
 		 144 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000438854  normal  0.0112001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  46.5 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  48 
 
 		 201 aa  147  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.08 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1383  two component LuxR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000320378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1410  response regulator receiver  37.19 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000440417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1897  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.5 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5262  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.72 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4244  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.84 
 
 		 206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0412084 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 223 aa  137  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.39 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1820  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.9 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.677493  normal  0.0923177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.71 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7316  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 201 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0782  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.32 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3219  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.09 
 
 		 208 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 303 aa  132  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3614  two component transcriptional regulator, LuxR family  41 
 
 		 201 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.765091  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.76 
 
 		 224 aa  131  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  37.44 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>