229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2717 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04327  biofilm PGA synthesis lipoprotein PgaB  75.48 
 
 		 624 aa  973    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.215859  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2717  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 628 aa  1270    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4842  polysaccharide deacetylase  43.05 
 
 		 712 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3765  polysaccharide deacetylase  43.05 
 
 		 712 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2791  hypothetical protein  42.86 
 
 		 640 aa  497  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.291104  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0287  putative hemin storage signal peptide protein  42.36 
 
 		 724 aa  489  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.111967  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4483  polysaccharide deacetylase  41.5 
 
 		 695 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.367373  normal  0.863016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3514  polysaccharide deacetylase  41.16 
 
 		 697 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000898006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0136  hemin storage protein  41.46 
 
 		 684 aa  466  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.84788  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3420  polysaccharide deacetylase  40.83 
 
 		 698 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4263  polysaccharide deacetylase  40.94 
 
 		 697 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3997  polysaccharide deacetylase  40.37 
 
 		 697 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695216  normal  0.336374 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4103  polysaccharide deacetylase  40.94 
 
 		 697 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.871871  normal  0.778137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1941  polysaccharide deacetylase  40.09 
 
 		 697 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2240  outer membrane N-deacetylase  39.65 
 
 		 673 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2926  polysaccharide deacetylase  41.09 
 
 		 659 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2142  outer membrane N-deacetylase  39.65 
 
 		 673 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0474034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2130  outer membrane N-deacetylase  39.65 
 
 		 673 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3011  polysaccharide deacetylase  41.12 
 
 		 659 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245243  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3118  polysaccharide deacetylase  41.12 
 
 		 660 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0178  outer membrane N-deacetylase  40.1 
 
 		 665 aa  433  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.604403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4286  outer membrane N-deacetylase  38.25 
 
 		 671 aa  423  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4607  outer membrane N-deacetylase  39.37 
 
 		 671 aa  424  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0751  polysaccharide deacetylase  36.98 
 
 		 673 aa  422  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.442489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01025  predicted enzyme associated with biofilm formation  36.78 
 
 		 672 aa  405  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2620  polysaccharide deacetylase  36.78 
 
 		 672 aa  405  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01032  hypothetical protein  36.78 
 
 		 672 aa  405  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2573  outer membrane N-deacetylase  36.78 
 
 		 672 aa  405  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0269291 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1138  outer membrane N-deacetylase  36.78 
 
 		 672 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115575  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1265  outer membrane N-deacetylase  36.62 
 
 		 672 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.798831 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1143  outer membrane N-deacetylase  36.62 
 
 		 672 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0616  polysaccharide deacetylase  29.38 
 
 		 373 aa  114  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.638459  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0287  polysaccharide deacetylase  27.82 
 
 		 319 aa  108  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.316315  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0883  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 298 aa  104  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000351632  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2295  intercellular adhesion protein B  24.67 
 
 		 289 aa  100  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0572032  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2692  intercellular adhesion protein B  24.34 
 
 		 290 aa  98.6  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2749  intercellular adhesion protein B  24.34 
 
 		 290 aa  98.6  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0372  polysaccharide deacetylase family protein  25.09 
 
 		 306 aa  95.1  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0367  xylanase/chitin deacetilase  25.09 
 
 		 306 aa  94.7  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5605  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 		 357 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.221698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1828  polysaccharide deacetylase  28.05 
 
 		 278 aa  93.2  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2170  polysaccharide deacetylase family protein  28.05 
 
 		 256 aa  92.8  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2114  polysaccharide deacetylase  36.11 
 
 		 321 aa  89.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5057  polysaccharide deacetylase  30.38 
 
 		 645 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5874  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 		 296 aa  89.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  27.35 
 
 		 510 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3100  polysaccharide deacetylase  26.17 
 
 		 262 aa  88.2  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0897  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 		 264 aa  88.2  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000608973 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2105  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 296 aa  88.2  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0828766  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0846  polysaccharide deacetylase  29.34 
 
 		 280 aa  86.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1620  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 		 278 aa  86.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0020  polysaccharide deacetylase  24.57 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2543  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  27.24 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6214  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 		 264 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1782  polysaccharide deacetylase  23.18 
 
 		 305 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1178  polysaccharide deacetylase  26.07 
 
 		 370 aa  82.8  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3791  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 354 aa  82.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.000000112343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3994  polysaccharide deacetylase  26.39 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0976  polysaccharide deacetylase  26.04 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000769924  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4008  polysaccharide deacetylase  25 
 
 		 348 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2112  glycosy hydrolase family protein  25.97 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0895  polysaccharide deacetylase  35.33 
 
 		 615 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0313662  normal  0.429695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0869  polysaccharide deacetylase  35.33 
 
 		 615 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0273  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 627 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4616  polysaccharide deacetylase family protein  25.9 
 
 		 348 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4408  polysaccharide deacetylase  25.77 
 
 		 263 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1858  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 347 aa  79.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000052436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  27.2 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.568999  normal  0.212352 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2381  polysaccharide deacetylase  24.14 
 
 		 336 aa  79.7  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.437029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4541  polysaccharide deacetylase  25.77 
 
 		 263 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00515582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5025  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 548 aa  77.8  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.794076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0333  polysaccharide deacetylase family protein  26.61 
 
 		 273 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0332  polysaccharide deacetylase family protein  26.61 
 
 		 273 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.529836 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4730  polysaccharide deacetylase  28.04 
 
 		 548 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1196  polysaccharide deacetylase  23.79 
 
 		 224 aa  76.6  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.822308  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0140  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  25.36 
 
 		 409 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0132  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.68 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  33.81 
 
 		 274 aa  76.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1359  polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0134  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.68 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  24.11 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2052  polysaccharide deacetylase family protein  28.57 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0196  polysaccharide deacetylase domain protein  24.91 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2322  polysaccharide deacetylase family protein  28.41 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0204  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.91 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0199  polysaccharide deacetylase domain protein  24.91 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.37766  normal  0.364365 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1076  polysaccharide deacetylase family protein  28.52 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2342  polysaccharide deacetylase family protein  28.52 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.769381  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3791  polysaccharide deacetylase  25.1 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0475  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (glutamineamidotransferase; GMP synthetase)  24.7 
 
 		 265 aa  75.1  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0340  polysaccharide deacetylase family protein  26.8 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.059566 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0213  polysaccharide deacetylase  24.91 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.268611  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0195  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  24.91 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00129  predicted polysaccharide deacetylase lipoprotein  32.03 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.530219  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3472  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3529  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3874  polysaccharide deacetylase  24.3 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2698  polysaccharide deacetylase  25.09 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000289703  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00128  hypothetical protein  32.03 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.411127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1542  polysaccharide deacetylase  24.12 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.04781e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>