263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 164 aa  317  3.9999999999999996e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  56.49 
 
 		 132 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  52.8 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  49.26 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0832  large conductance mechanosensitive channel protein  47.76 
 
 		 201 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  46.04 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  49.6 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  52.42 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  52.42 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1924  Large-conductance mechanosensitive channel  49.24 
 
 		 168 aa  120  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.79206  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  47.69 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  64 
 
 		 145 aa  118  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  49.22 
 
 		 122 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13070  large conductance mechanosensitive channel protein  46.38 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00812185  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0090  large conductance mechanosensitive channel protein  43.97 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.343086  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  49.61 
 
 		 126 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  39.43 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3137  large conductance mechanosensitive channel protein  51.24 
 
 		 127 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  49.55 
 
 		 138 aa  109  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0038  large conductance mechanosensitive channel protein  52.94 
 
 		 136 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11003  large-conductance mechanosensitive channel  43.79 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.00405e-34  normal  0.629119 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  48.8 
 
 		 125 aa  107  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  48.36 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2915  large conductance mechanosensitive channel protein  44.53 
 
 		 130 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2624  large conductance mechanosensitive channel protein  44.96 
 
 		 129 aa  102  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.462758 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  43.08 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  45.97 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  43.07 
 
 		 134 aa  98.6  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4648  large conductance mechanosensitive channel protein  41.22 
 
 		 146 aa  97.1  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  46.55 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4838  large-conductance mechanosensitive channel  42.48 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619813 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0305  large conductance mechanosensitive channel protein  48.46 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0850  large-conductance mechanosensitive channel  55.68 
 
 		 129 aa  90.9  7e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1408  large conductance mechanosensitive channel protein  40.16 
 
 		 274 aa  90.9  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4672  large-conductance mechanosensitive channel  37.75 
 
 		 151 aa  90.5  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419542  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4294  large-conductance mechanosensitive channel  37.75 
 
 		 151 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  44.44 
 
 		 121 aa  90.5  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4380  large-conductance mechanosensitive channel  37.75 
 
 		 151 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.443969  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  42.45 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1428  large conductance mechanosensitive channel protein  37.9 
 
 		 126 aa  88.6  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  39.42 
 
 		 142 aa  87.8  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  40.8 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4049  large conductance mechanosensitive channel protein  39.87 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  38.89 
 
 		 126 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  39.42 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  42.86 
 
 		 145 aa  85.5  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  36.31 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  41.6 
 
 		 127 aa  85.1  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  46.4 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  39.85 
 
 		 139 aa  84  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  35.25 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  39.82 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2641  large-conductance mechanosensitive channel  38.69 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276841 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  40 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  37.14 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  36.72 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1595  large conductance mechanosensitive channel protein  43.59 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5645  large conductance mechanosensitive channel protein  45.83 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0366128  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  38.64 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  41.74 
 
 		 135 aa  81.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  36.22 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  38.28 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1956  large conductance mechanosensitive channel protein  42.19 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  36.72 
 
 		 132 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1436  large-conductance mechanosensitive channel  40.32 
 
 		 120 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000693237  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1409  large-conductance mechanosensitive channel  40.32 
 
 		 120 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000924927  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3527  large conductance mechanosensitive channel protein  37.14 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2962  large-conductance mechanosensitive channel  38.36 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  39.82 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  37.5 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  37.5 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  37.5 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  36.72 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23920  large conductance mechanosensitive channel protein  40.77 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.814868 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  37.5 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  41.13 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  36.23 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  40.87 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1319  large conductance mechanosensitive channel protein  42.15 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  35.04 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  35.04 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  35.04 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0166  large-conductance mechanosensitive channel  38.41 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.3696  normal  0.313526 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  35.16 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3512  large conductance mechanosensitive channel protein  37.31 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.178106  normal  0.287508 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  37.5 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1030  large conductance mechanosensitive channel protein  39.13 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184236  normal  0.070135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2630  large conductance mechanosensitive channel protein  40.58 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.425108  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0756  large conductance mechanosensitive channel protein  38.24 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0055  large conductance mechanosensitive channel protein  36.5 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  38.57 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  38.13 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0241  large conductance mechanosensitive channel protein  40.77 
 
 		 131 aa  77  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  39.13 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2455  large-conductance mechanosensitive channel  37.5 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  38.13 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0457  large-conductance mechanosensitive channel  38.19 
 
 		 163 aa  77  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  38.13 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  38.13 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  38.13 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>