165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1620 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_1631  porin  98.01 
 
 
403 aa  808  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.33613e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2723  porin Gram-negative type  98.01 
 
 
403 aa  809  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  8.66519e-09  hitchhiker  8.18773e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2536  porin  83.87 
 
 
402 aa  686  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000566311  unclonable  3.00208e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3084  porin  76.05 
 
 
402 aa  639  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  6.11786e-07  decreased coverage  2.68212e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1251  outer membrane porin, putative  76.67 
 
 
402 aa  647  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  4.29036e-08  hitchhiker  0.000137517 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1515  porin  86.85 
 
 
402 aa  722  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  3.37456e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2628  porin  83.37 
 
 
402 aa  680  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.06502e-07  hitchhiker  8.92589e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3603  porin  77.92 
 
 
402 aa  663  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  9.08733e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2468  porin  84.12 
 
 
402 aa  687  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  2.93387e-08  hitchhiker  0.000118178 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1620  porin  100 
 
 
403 aa  820  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.07941e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1654  porin  99.5 
 
 
403 aa  817  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  7.30706e-07  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1821  outer membrane porin, putative  80.15 
 
 
398 aa  639  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2557  porin  72.84 
 
 
402 aa  609  1e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40328  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2481  porin  69.61 
 
 
403 aa  588  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  2.11873e-07  hitchhiker  5.58993e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2654  porin  63.97 
 
 
403 aa  526  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1568  porin  62.8 
 
 
403 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  4.03403e-07  hitchhiker  1.52354e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0680  porin  54.57 
 
 
388 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.424836  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2229  porin  47.89 
 
 
382 aa  357  2e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.218103  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3681  porin  34.55 
 
 
384 aa  236  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0276  porin  34.79 
 
 
384 aa  236  7e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3873  porin  34.79 
 
 
384 aa  236  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0642035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0312  outer membrane porin, putative  34.31 
 
 
384 aa  235  1e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3669  porin  34.55 
 
 
384 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4086  porin  34.14 
 
 
384 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1487  porin  34.77 
 
 
389 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.911374 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4055  porin  34.14 
 
 
384 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4173  porin  34.62 
 
 
384 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3977  porin Gram-negative type  34.62 
 
 
384 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3060  outer membrane porin, putative  33.57 
 
 
389 aa  225  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2283  porin  35.84 
 
 
385 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3366  porin  34.38 
 
 
385 aa  223  5e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2434  porin  32.85 
 
 
389 aa  220  4e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.775403  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3336  outer membrane porin, putative  36.32 
 
 
384 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04813  hypothetical protein  27.74 
 
 
365 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0427  putative outer membrane pore protein  28.4 
 
 
340 aa  93.2  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0666  porin  34.29 
 
 
324 aa  89  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00111405  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06284  hypothetical protein  28.62 
 
 
352 aa  85.1  2e-15  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001437  non-specific porin  25.43 
 
 
352 aa  84.7  2e-15  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.524484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1444  outer membrane porin protein C  25.78 
 
 
371 aa  75.5  1e-12  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000996913  normal  0.640308 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2761  outer membrane porin protein C  25.78 
 
 
371 aa  75.5  1e-12  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.9147e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2839  outer membrane porin protein C  25.78 
 
 
371 aa  75.5  1e-12  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1458  porin  24.24 
 
 
365 aa  67.8  4e-10  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2197  outer membrane protein  24.88 
 
 
357 aa  67  6e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1679  porin  24.88 
 
 
357 aa  66.2  1e-09  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.512961  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3264  outer membrane porin protein C  25 
 
 
370 aa  64.7  3e-09  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00668257  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2354  outer membrane porin protein C  23.8 
 
 
368 aa  62.8  9e-09  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00268594  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2493  outer membrane porin protein C  23.6 
 
 
378 aa  62.4  1e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0824  outer membrane porin protein LC  23.35 
 
 
360 aa  62.8  1e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.166078  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1124  outer membrane protein N  23.89 
 
 
403 aa  61.2  3e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181987  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1443  porin Gram-negative type  24.16 
 
 
367 aa  61.2  3e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00990421  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3353  outer membrane porin protein C  22.95 
 
 
367 aa  61.2  3e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.128498  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  34.75 
 
 
380 aa  60.8  4e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1221  porin family protein  23.81 
 
 
387 aa  60.8  4e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263748  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2403  outer membrane porin protein C  23.36 
 
 
378 aa  60.5  5e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00624536  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2451  outer membrane porin protein C  23.36 
 
 
378 aa  59.3  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487875 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2507  outer membrane porin protein C  23.36 
 
 
378 aa  59.3  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0209108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2610  outer membrane porin protein C  23.36 
 
 
378 aa  59.3  1e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.440954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2649  porin  24.64 
 
 
360 aa  58.5  2e-07  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  4.0387e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1435  outer membrane porin protein C  23.8 
 
 
376 aa  58.2  2e-07  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.974185  normal  0.210914 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0724  outer membrane porin protein C  22.89 
 
 
376 aa  58.9  2e-07  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140015  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2514  outer membrane porin protein C  22.71 
 
 
363 aa  58.2  3e-07  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.92905e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1641  outer membrane protein N  24.64 
 
 
383 aa  57.8  3e-07  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.150346  normal  0.976453 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000832  outer membrane protein C precursor  30.32 
 
 
331 aa  56.6  8e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0331596  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06741  hypothetical protein  28.75 
 
 
330 aa  55.8  1e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1968  porin  23.56 
 
 
378 aa  56.2  1e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2364  outer membrane porin protein C  23.56 
 
 
364 aa  55.1  2e-06  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0333811  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1979  outer membrane protein F  23.93 
 
 
360 aa  54.7  3e-06  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  2.61923e-05  normal  0.629044 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2155  outer membrane protein F  23.65 
 
 
400 aa  54.3  4e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.977291  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2559  outer membrane protein F  24.11 
 
 
360 aa  53.1  9e-06  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.7634e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2212  outer membrane protein N  24.59 
 
 
398 aa  52.8  1e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466216  normal  0.580794 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  32.62 
 
 
380 aa  52.8  1e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  31.48 
 
 
365 aa  52.8  1e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1032  outer membrane protein F  24.22 
 
 
363 aa  51.6  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.847393  normal  0.0115184 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02142  outer membrane porin protein C  25.35 
 
 
311 aa  51.6  2e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2159  outer membrane protein N  24.3 
 
 
398 aa  52  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.142593 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1064  outer membrane protein F  24.22 
 
 
363 aa  51.6  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219898 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2795  outer membrane porin protein C  22.38 
 
 
372 aa  52  2e-05  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00922509  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1006  outer membrane protein F  24.22 
 
 
363 aa  51.6  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00715949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02101  hypothetical protein  25.35 
 
 
329 aa  51.6  2e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1114  outer membrane protein F  24.22 
 
 
363 aa  51.6  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0339552  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1582  outer membrane protein N  24.53 
 
 
383 aa  51.2  3e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.640646  normal  0.720278 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0588  major outer membrane protein OmpU  26.07 
 
 
333 aa  51.2  3e-05  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116995  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2514  outer membrane protein N  22.89 
 
 
360 aa  50.8  4e-05  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.127891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1097  outer membrane protein F  24.22 
 
 
363 aa  50.8  4e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.918744 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2115  outer membrane protein N  22.89 
 
 
360 aa  50.8  4e-05  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.829511  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2224  porin  22.89 
 
 
360 aa  50.8  4e-05  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0575083  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  26.5 
 
 
381 aa  50.1  6e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  5.10275e-08  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1702  porin family protein  23 
 
 
366 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0189246  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2839  porin  22.3 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1870  outer membrane protein N  24.53 
 
 
383 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.098119  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0767  outer membrane phosphoporin protein E  23.66 
 
 
350 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0774266 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1701  outer membrane protein N  24.3 
 
 
388 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.265921  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1770  outer membrane porin protein LC  23.92 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0295  outer membrane phosphoporin protein E  22.98 
 
 
351 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372368 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1090  outer membrane protein F  23.99 
 
 
362 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  2.11589e-05  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2083  gram-negative porin family protein  22.56 
 
 
366 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0286  outer membrane phosphoporin protein E  22.74 
 
 
351 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172379  normal  0.530203 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  31.21 
 
 
380 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1689  outer membrane porin protein LC  23.88 
 
 
362 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1750  outer membrane porin protein LC  23.88 
 
 
362 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.778273  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>