More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3742 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 496 aa  1008    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  62.88 
 
 		 501 aa  616  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  60.56 
 
 		 492 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  60.36 
 
 		 492 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  60.82 
 
 		 504 aa  600  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  59.27 
 
 		 491 aa  597  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  59.68 
 
 		 491 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  59.84 
 
 		 532 aa  595  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  59.55 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 		 494 aa  588  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  60.85 
 
 		 501 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 		 494 aa  586  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  57.78 
 
 		 503 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  58.7 
 
 		 503 aa  580  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 492 aa  580  1e-164  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 		 484 aa  558  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 511 aa  557  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39390  lysyl-tRNA synthetase  56.65 
 
 		 500 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 491 aa  535  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 		 499 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 496 aa  531  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 		 489 aa  533  1e-150  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 		 493 aa  533  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1496  lysyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 500 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1060  lysyl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 499 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.175669  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  54.38 
 
 		 490 aa  526  1e-148  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4226  lysyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 500 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.366371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3428  lysyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 509 aa  525  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1101  lysyl-tRNA synthetase  54.77 
 
 		 500 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1501  lysyl-tRNA synthetase  56.5 
 
 		 500 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1311  lysyl-tRNA synthetase  56.72 
 
 		 500 aa  523  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1438  lysyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 501 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 499 aa  521  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16530  lysyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 501 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4121  lysyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 		 500 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 488 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 510 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  51.62 
 
 		 505 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 505 aa  512  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 505 aa  512  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  51.62 
 
 		 505 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 		 494 aa  512  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 505 aa  514  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3370  lysyl-tRNA synthetase  54.08 
 
 		 505 aa  512  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 505 aa  512  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 505 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 505 aa  513  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  51.62 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3888  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 505 aa  508  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  53.32 
 
 		 496 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 505 aa  510  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 505 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 505 aa  511  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0480  lysyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 496 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 		 513 aa  509  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 		 505 aa  510  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  51.62 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 505 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1217  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  51.79 
 
 		 502 aa  509  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0640  lysyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 496 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 505 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 505 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 505 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 505 aa  509  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0924  lysyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 505 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 505 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  51.12 
 
 		 494 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  53.11 
 
 		 496 aa  508  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 505 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 494 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0883  lysyl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 505 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  51.91 
 
 		 518 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 505 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 508 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 		 524 aa  504  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 508 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  51.71 
 
 		 513 aa  502  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 496 aa  504  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 508 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 		 506 aa  504  1e-141  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 499 aa  504  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 508 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 		 508 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0649  lysyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 		 505 aa  502  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 503 aa  500  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 		 501 aa  498  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1132  lysyl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 500 aa  500  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1642  lysyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 498 aa  501  1e-140  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.573049  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 507 aa  501  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0538  lysyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 498 aa  501  1e-140  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000249001  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 501 aa  501  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 489 aa  501  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>