233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2570 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 
472 aa  941    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  57.95 
 
 
451 aa  463  1e-129  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  58.31 
 
 
436 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  47.25 
 
 
455 aa  385  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  44.27 
 
 
444 aa  360  4e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  44.8 
 
 
464 aa  360  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  49.06 
 
 
438 aa  341  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  45.2 
 
 
450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  45.56 
 
 
455 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  44.58 
 
 
438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  49.16 
 
 
445 aa  324  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  42.26 
 
 
406 aa  318  9e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  41.18 
 
 
395 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  43.79 
 
 
457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.47 
 
 
390 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.65 
 
 
394 aa  309  6.999999999999999e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.37 
 
 
391 aa  309  8e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2989  Na+/H+ antiporter NhaA  46.19 
 
 
460 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  43.49 
 
 
391 aa  306  7e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  41.76 
 
 
452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  37.69 
 
 
450 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  44.58 
 
 
402 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  43.57 
 
 
468 aa  300  4e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  41.19 
 
 
465 aa  300  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.34 
 
 
430 aa  300  4e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  42.01 
 
 
451 aa  300  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.18 
 
 
399 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  43.19 
 
 
408 aa  295  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.11 
 
 
389 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.11 
 
 
389 aa  294  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  40.42 
 
 
435 aa  293  3e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.88 
 
 
389 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  42.01 
 
 
453 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.88 
 
 
389 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.37 
 
 
391 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  41.78 
 
 
453 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.94 
 
 
391 aa  290  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.61 
 
 
389 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.61 
 
 
389 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  40.19 
 
 
391 aa  289  6e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.13 
 
 
389 aa  289  8e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.37 
 
 
389 aa  288  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  41.84 
 
 
404 aa  288  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  40.42 
 
 
470 aa  287  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0407  Na+/H+ antiporter NhaA  41.82 
 
 
425 aa  287  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  41.71 
 
 
444 aa  286  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  39.46 
 
 
456 aa  286  7e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.13 
 
 
391 aa  286  8e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  42.95 
 
 
398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.87 
 
 
421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4144  Na+/H+ antiporter NhaA  38.53 
 
 
472 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.375457  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0222  Na+/H+ antiporter NhaA  36.62 
 
 
475 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2773  Na+/H+ antiporter NhaA  40.65 
 
 
612 aa  285  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.461609 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  39.24 
 
 
449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  41.09 
 
 
514 aa  284  3.0000000000000004e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  39.41 
 
 
424 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  38.43 
 
 
446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  41.3 
 
 
389 aa  283  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.81 
 
 
391 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.22 
 
 
399 aa  282  9e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.88 
 
 
399 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.75 
 
 
388 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.75 
 
 
388 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.75 
 
 
388 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.75 
 
 
388 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.75 
 
 
388 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1537  Na+/H+ antiporter NhaA  39.95 
 
 
624 aa  280  5e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192352  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  39.24 
 
 
386 aa  278  1e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2568  Na+/H+ antiporter NhaA  43.08 
 
 
424 aa  279  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.44 
 
 
388 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.44 
 
 
388 aa  278  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.44 
 
 
388 aa  278  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  45.1 
 
 
399 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  40.83 
 
 
876 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  40.05 
 
 
379 aa  277  2e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.44 
 
 
388 aa  278  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.44 
 
 
388 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.44 
 
 
388 aa  278  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.44 
 
 
388 aa  278  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  42.44 
 
 
388 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0544  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.22 
 
 
401 aa  276  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  37.12 
 
 
427 aa  276  5e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1876  Na+/H+ antiporter  38.88 
 
 
387 aa  276  5e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1827  Na+/H+ antiporter NhaA  40.14 
 
 
382 aa  276  7e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  42.44 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1646  Na+/H+ antiporter NhaA  40.14 
 
 
382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.8 
 
 
391 aa  274  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  41.9 
 
 
392 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  41.49 
 
 
396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2016  Na+/H+ antiporter NhaA  39.9 
 
 
382 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  39.3 
 
 
455 aa  272  9e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4598  Na+/H+ antiporter NhaA  41.97 
 
 
408 aa  272  9e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  40 
 
 
395 aa  271  1e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  39.86 
 
 
383 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3347  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.96 
 
 
407 aa  269  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.24 
 
 
398 aa  269  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.28 
 
 
392 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.69 
 
 
409 aa  268  1e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.18 
 
 
398 aa  267  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.05 
 
 
382 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000535639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>