More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1222 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  100 
 
 		 393 aa  788    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  41.25 
 
 		 405 aa  301  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  38.77 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  41.53 
 
 		 403 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  40.31 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  41.27 
 
 		 403 aa  296  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  40.67 
 
 		 390 aa  295  9e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  39.12 
 
 		 415 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  40.93 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0621  amidohydrolase  39.37 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  37.11 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4597  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.63 
 
 		 391 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00088705  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0616  aminoacylase (N-acyl-L-amino acid amidohydrolase)  39.95 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00306425  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  40.67 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  40.37 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5405  amidohydrolase  40.66 
 
 		 396 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  41.18 
 
 		 408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0775  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase, degenerate  39.43 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0834  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.16 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3340  amidohydrolase  40.11 
 
 		 394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0594  amidohydrolase  38.76 
 
 		 391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0740  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.11 
 
 		 391 aa  282  9e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0672  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.16 
 
 		 391 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0616  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase (aminoacylase)  39.16 
 
 		 391 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0706  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.16 
 
 		 391 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  42.51 
 
 		 389 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  40.85 
 
 		 404 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  44.24 
 
 		 400 aa  280  4e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3677  amidohydrolase  42.16 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  40.46 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1729  peptidase M20D, amidohydrolase  44.53 
 
 		 390 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0022862 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26260  putative hydrolase  42.56 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.474103  normal  0.713071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1734  peptidase M20D, amidohydrolase  42.67 
 
 		 389 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.169236  normal  0.0172136 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2910  metal-dependent amidase/aminoacylase/carboxypeptidase  42.16 
 
 		 388 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1555  amidohydrolase  42.16 
 
 		 388 aa  276  5e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2379  amidohydrolase  41.97 
 
 		 402 aa  276  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2262  peptidase M20D, amidohydrolase  43.32 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.891111  normal  0.0931897 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4094  peptidase M20D, amidohydrolase  43.13 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.665516  normal  0.883146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2671  peptidase M20D, amidohydrolase  40.92 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00976662  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  40.59 
 
 		 405 aa  273  4.0000000000000004e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0760  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  39.69 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000492942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3565  peptidase M20D, amidohydrolase  42.31 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  40.63 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4250  amidohydrolase  42.37 
 
 		 390 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.456638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4012  amidohydrolase  42.01 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873821 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  42.33 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  38.61 
 
 		 394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  38.5 
 
 		 401 aa  270  4e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2982  putative amidohydrolase family protein  41.65 
 
 		 389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1887  amidohydrolase  44.5 
 
 		 389 aa  269  7e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5562  amidohydrolase  40 
 
 		 399 aa  268  8e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.596197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  39.04 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  40.22 
 
 		 407 aa  266  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4728  amidohydrolase  37.5 
 
 		 393 aa  266  5.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.848291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  39.57 
 
 		 388 aa  266  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3159  peptidase M20D, amidohydrolase  39.79 
 
 		 397 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3897  amidohydrolase  40.27 
 
 		 387 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0071  peptidase M20D, amidohydrolase  40.21 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1813  peptidase M20D, amidohydrolase  38.8 
 
 		 388 aa  265  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.301487  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0208  peptidase M20D, amidohydrolase  40 
 
 		 397 aa  264  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  41.95 
 
 		 399 aa  263  3e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  41.51 
 
 		 396 aa  263  3e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  43.21 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2762  amidohydrolase  37.66 
 
 		 395 aa  263  4e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.65096  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5222  hippurate hydrolase  41.45 
 
 		 398 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.22678 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  38.26 
 
 		 398 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  38.75 
 
 		 449 aa  263  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  40.16 
 
 		 396 aa  263  6e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2919  amidohydrolase  40.16 
 
 		 388 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54348  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0152  amidohydrolase  38.44 
 
 		 396 aa  262  6e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  42.08 
 
 		 396 aa  261  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  40.67 
 
 		 391 aa  262  1e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4523  peptidase M20D, amidohydrolase  40.58 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3609  amidohydrolase  39.73 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  39.53 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  40.94 
 
 		 410 aa  261  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  37.97 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5073  amidohydrolase  40.42 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.546308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  37.99 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  39.95 
 
 		 394 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4882  amidohydrolase  36.8 
 
 		 404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  39.79 
 
 		 389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1110  amidohydrolase  42.47 
 
 		 388 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0143187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3007  peptidase M20D, amidohydrolase  39.01 
 
 		 397 aa  259  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3872  hippurate hydrolase  39.69 
 
 		 387 aa  259  8e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4102  amidohydrolase  39.84 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  36.79 
 
 		 400 aa  258  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  37.8 
 
 		 387 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0021  peptidase M20D, amidohydrolase  39.63 
 
 		 425 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  38.25 
 
 		 480 aa  257  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4300  peptidase M20D, amidohydrolase  41.25 
 
 		 412 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6019  amidohydrolase  39.84 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2343  peptidase M20D, amidohydrolase  39.01 
 
 		 386 aa  257  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0732987  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2466  amidohydrolase  41.71 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2111  peptidase M20D, amidohydrolase  35.73 
 
 		 398 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.959227  normal  0.0805645 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1330  amidohydrolase  38.42 
 
 		 407 aa  256  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  37.21 
 
 		 400 aa  256  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  39.1 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  40.63 
 
 		 389 aa  256  6e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5757  amidohydrolase  40.11 
 
 		 394 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0761322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>