More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0224 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  92.64 
 
 
747 aa  1453  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  92.9 
 
 
747 aa  1456  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  92.64 
 
 
747 aa  1432  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  73.49 
 
 
703 aa  1096  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  58.52 
 
 
729 aa  855  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  99.46 
 
 
747 aa  1535  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  74.54 
 
 
729 aa  1148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  92.77 
 
 
747 aa  1454  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  100 
 
 
747 aa  1545  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  87.02 
 
 
752 aa  1348  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  74.14 
 
 
729 aa  1135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  73.49 
 
 
703 aa  1096  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  74.14 
 
 
729 aa  1137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  90.74 
 
 
747 aa  1419  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  92.64 
 
 
747 aa  1432  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  55.84 
 
 
729 aa  850  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  92.37 
 
 
745 aa  1442  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  40.49 
 
 
820 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  2.2757e-05 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  38.79 
 
 
740 aa  506  1e-142  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  39.77 
 
 
794 aa  506  1e-142  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  38.36 
 
 
833 aa  500  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  39.24 
 
 
828 aa  495  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  40.03 
 
 
714 aa  494  1e-138  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  38.95 
 
 
828 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  39.24 
 
 
828 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  37.96 
 
 
705 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  39.74 
 
 
736 aa  488  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 
701 aa  488  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  38.8 
 
 
797 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  39.47 
 
 
829 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  38.02 
 
 
717 aa  481  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  3.6194e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  40.62 
 
 
778 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  37.67 
 
 
735 aa  479  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  37.93 
 
 
696 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  38.41 
 
 
806 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  37.43 
 
 
696 aa  466  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  1.43872e-13 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  37.48 
 
 
698 aa  468  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  37.62 
 
 
696 aa  467  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  38.5 
 
 
808 aa  468  1e-130  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  37.62 
 
 
696 aa  469  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  7.66311e-13 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  37.62 
 
 
696 aa  468  1e-130  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.62521e-11 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  35.99 
 
 
753 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.89 
 
 
806 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  38.28 
 
 
748 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  39.49 
 
 
733 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  38.73 
 
 
723 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  35.94 
 
 
750 aa  447  1e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  38.01 
 
 
821 aa  447  1e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  35.89 
 
 
810 aa  447  1e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  37.22 
 
 
797 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  37.77 
 
 
789 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  39.51 
 
 
819 aa  445  1e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  38.66 
 
 
801 aa  441  1e-122  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  35.85 
 
 
810 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  35.15 
 
 
810 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  34.74 
 
 
808 aa  430  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  35.99 
 
 
810 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  36.86 
 
 
799 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  36.73 
 
 
828 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.86 
 
 
689 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4273  TonB-dependent receptor protein  37.32 
 
 
791 aa  419  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.12812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  37.29 
 
 
715 aa  417  1e-115  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  34.44 
 
 
705 aa  418  1e-115  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4121  TonB-dependent siderophore receptor  37.46 
 
 
791 aa  418  1e-115  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  34.78 
 
 
802 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1594  TonB-dependent siderophore receptor  35.24 
 
 
734 aa  412  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000849595  hitchhiker  0.00416618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  37.13 
 
 
831 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  35.54 
 
 
829 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  38.7 
 
 
812 aa  409  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  36.78 
 
 
771 aa  409  1e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2776  TonB-dependent siderophore receptor  36.78 
 
 
817 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.265415  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1541  TonB-dependent siderophore receptor  35.33 
 
 
750 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0957373  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  35.5 
 
 
738 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2867  TonB-dependent siderophore receptor  35.5 
 
 
733 aa  403  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132982  normal  0.0165927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  36.06 
 
 
771 aa  402  1e-110  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1562  TonB-dependent siderophore receptor  35.19 
 
 
753 aa  401  1e-110  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  4.16689e-05  normal  0.182143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  35.95 
 
 
799 aa  400  1e-110  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1644  TonB-dependent siderophore receptor  34.67 
 
 
754 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.107171  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 
752 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  34.35 
 
 
711 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 
741 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1164  TonB-dependent siderophore receptor  34.67 
 
 
754 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0408687  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  35.25 
 
 
769 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  35.25 
 
 
713 aa  396  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.08759e-07 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  34.63 
 
 
753 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  34.63 
 
 
753 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 
736 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  34.88 
 
 
745 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  35.04 
 
 
737 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 
736 aa  398  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1619  TonB-dependent siderophore receptor  34.54 
 
 
754 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  36.02 
 
 
747 aa  393  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  35.01 
 
 
701 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  35.33 
 
 
750 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4075  TonB-dependent siderophore receptor  34.84 
 
 
745 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  35.06 
 
 
757 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0434213 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1367  TonB-dependent siderophore receptor  34.64 
 
 
745 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0632202  normal  0.0485131 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  35.28 
 
 
721 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4790  TonB-dependent siderophore receptor  34.14 
 
 
750 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00609925  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1027  TonB-dependent siderophore receptor  34.75 
 
 
717 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.424895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>