163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1219 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1219  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 355 aa  697    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000032504  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1276  acid membrane antigen A  32.87 
 
 		 347 aa  164  3e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0472  acid membrane antigen A  32.23 
 
 		 367 aa  160  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1921  acid membrane antigen A  31.1 
 
 		 348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0738  acid membrane antigen A  30.59 
 
 		 352 aa  153  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.444287  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1677  hypothetical protein  32.54 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.696772  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0399  protein of unknown function UPF0118  37.3 
 
 		 346 aa  149  8e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0286  hypothetical protein  34.27 
 
 		 347 aa  147  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0381  hypothetical protein  30.59 
 
 		 346 aa  146  5e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.519933  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1555  hypothetical protein  33.87 
 
 		 347 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1365  hypothetical protein  33.87 
 
 		 347 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1881  hypothetical protein  25.89 
 
 		 367 aa  90.5  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000322257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  26.13 
 
 		 352 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  26.05 
 
 		 356 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  26.35 
 
 		 352 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  26.55 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  25.49 
 
 		 360 aa  85.9  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  29.82 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  24.51 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  26 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  27.51 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  26.18 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  24.51 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  23.34 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  26.75 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  25.36 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  24.11 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  25.85 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  26.27 
 
 		 346 aa  79.3  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1042  protein of unknown function UPF0118  28.87 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.840746  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  27.64 
 
 		 346 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  26.11 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  25 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  25.34 
 
 		 356 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  23.33 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  27.59 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  27.22 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  27.24 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  24.86 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  27.3 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  27.3 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  25.88 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  27.32 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  25.87 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  26.04 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  26.33 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  28.71 
 
 		 358 aa  70.1  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  24.24 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  24.79 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  26.63 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  25.77 
 
 		 354 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  32.1 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  24.51 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  24.73 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  28.9 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  24.05 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  24.73 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  23.86 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  26.16 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  25.35 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  25.35 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  24.72 
 
 		 349 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  24.62 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  23.74 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  22.95 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  22.75 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  27.75 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  24.93 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  27.17 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  24.35 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  26.42 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  24.35 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  23.78 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  25.25 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  23.77 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  23.63 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  25.22 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  24.84 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  26.18 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  22.97 
 
 		 384 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  22.46 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  21.99 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  21.58 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  25.21 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  25.82 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  23.31 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  22.22 
 
 		 398 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  23.04 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  22.22 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  22.29 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  22.22 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  22.29 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  27.3 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  22.29 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  22.29 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  22.29 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  22.29 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  22.29 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  24.49 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  23.69 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>