218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0497 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0497  Malate dehydrogenase (acceptor)  100 
 
 		 446 aa  923    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000529233  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0628  malate:quinone oxidoreductase  66.82 
 
 		 450 aa  628  1e-179  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1634  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  66.07 
 
 		 448 aa  628  1e-179  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1506  malate dehydrogenase (acceptor)  60.85 
 
 		 498 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0416  malate:quinone oxidoreductase, putative  61.92 
 
 		 448 aa  565  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0117382  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0442  malate:quinone oxidoreductase, putative  61.92 
 
 		 448 aa  564  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0434  acetyltransferase  58.74 
 
 		 448 aa  560  1e-158  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.722721  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1565  putative malate:quinone oxidoreductase  61.69 
 
 		 448 aa  561  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0480  malate:quinone oxidoreductase  59.91 
 
 		 448 aa  549  1e-155  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1243  malate:quinone oxidoreductase (malate dehydrogenase[acceptor]) (MQO)  58.48 
 
 		 451 aa  551  1e-155  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.69775  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1873  FAD dependent oxidoreductase  58.39 
 
 		 446 aa  524  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3629  Malate dehydrogenase (acceptor)  50.56 
 
 		 455 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2603  FAD dependent oxidoreductase  48.86 
 
 		 463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2986  FAD dependent oxidoreductase  42.25 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.193305  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0687  FAD dependent oxidoreductase  42.38 
 
 		 462 aa  354  1e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.261465  normal  0.13641 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3133  Malate dehydrogenase (acceptor)  43.15 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0428  FAD dependent oxidoreductase  41.78 
 
 		 470 aa  335  1e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106038  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2400  malate/quinone oxidoreductase  25.22 
 
 		 489 aa  90.5  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514412  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4539  malate:quinone oxidoreductase  25.56 
 
 		 508 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  26.24 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  25.06 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  25.64 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0349  malate:quinone oxidoreductase  26.58 
 
 		 576 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  25.18 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  24 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0797  malate:quinone oxidoreductase  24.36 
 
 		 512 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.64083  normal  0.0315045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2412  malate:quinone oxidoreductase  25.31 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3994  malate:quinone oxidoreductase  25.71 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  24.17 
 
 		 396 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  25.52 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2241  malate/quinone oxidoreductase  25.89 
 
 		 510 aa  79.7  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000570107  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1955  malate:quinone oxidoreductase  25.22 
 
 		 492 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2579  malate:quinone oxidoreductase  23.17 
 
 		 508 aa  79.7  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  27.59 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3093  malate:quinone oxidoreductase  23.83 
 
 		 561 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.397508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2389  malate:quinone oxidoreductase  25.82 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2435  malate:quinone oxidoreductase  25.82 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0851  malate:quinone oxidoreductase  25 
 
 		 519 aa  77.8  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  23.92 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2142  malate:quinone oxidoreductase  25.05 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2679  malate/quinone oxidoreductase  23.63 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0628359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2189  malate:quinone oxidoreductase  24 
 
 		 501 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2601  malate:quinone oxidoreductase  26 
 
 		 540 aa  76.6  0.0000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0636269  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1572  malate:quinone oxidoreductase  25.16 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  24.49 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2135  malate:quinone oxidoreductase  26.14 
 
 		 500 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2825  malate:quinone oxidoreductase  24.95 
 
 		 527 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0832763  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1753  malate:quinone oxidoreductase  22.15 
 
 		 500 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0381  malate:quinone oxidoreductase  24.59 
 
 		 498 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0155844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1433  malate:quinone oxidoreductase  23.86 
 
 		 509 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  23.42 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04721  malate:quinone oxidoreductase  22.15 
 
 		 508 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2378  malate:quinone oxidoreductase  23.81 
 
 		 495 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02137  malate:quinone oxidoreductase  23.24 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2509  malate:quinone oxidoreductase  23.24 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02096  hypothetical protein  23.24 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4141  malate:quinone oxidoreductase  27 
 
 		 545 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.981966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1440  malate:quinone oxidoreductase  23.24 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.629978 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2349  malate:quinone oxidoreductase  23.24 
 
 		 548 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1448  malate/quinone oxidoreductase  23.54 
 
 		 548 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1908  malate/quinone oxidoreductase  24.84 
 
 		 495 aa  73.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.266658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2359  malate:quinone oxidoreductase  23.54 
 
 		 548 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1509  malate:quinone oxidoreductase  27.73 
 
 		 550 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.223394  normal  0.79888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2851  malate:quinone oxidoreductase  25.11 
 
 		 521 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.944411  normal  0.050661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1279  malate:quinone oxidoreductase  27 
 
 		 545 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  25 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  26.08 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4992  malate:quinone oxidoreductase  24.44 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293492  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3168  malate:quinone oxidoreductase  24.44 
 
 		 553 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.366613 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3348  malate:quinone oxidoreductase  23.54 
 
 		 548 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20971  malate:quinone oxidoreductase  22.53 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2767  malate:quinone oxidoreductase  23.81 
 
 		 539 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1251  malate:quinone oxidoreductase  26.71 
 
 		 545 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0814  malate:quinone oxidoreductase  26.74 
 
 		 553 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00169357  normal  0.567964 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  23.67 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61400  malate:quinone oxidoreductase  25.49 
 
 		 507 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.546459 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0730  malate:quinone oxidoreductase  23.03 
 
 		 548 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4311  malate:quinone oxidoreductase  24.23 
 
 		 547 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0141568  hitchhiker  0.00000172101 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1337  malate:quinone oxidoreductase  26.85 
 
 		 523 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.66625  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  22.84 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  22.2 
 
 		 409 aa  71.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  23.28 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2529  malate:quinone oxidoreductase  22.06 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.521046  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04080  malate:quinone oxidoreductase  25.21 
 
 		 539 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00990069  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3251  malate:quinone oxidoreductase  24.02 
 
 		 547 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2925  malate:quinone oxidoreductase  23.6 
 
 		 539 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1438  malate:quinone oxidoreductase  25.1 
 
 		 527 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.520556  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5100  malate:quinone oxidoreductase  24.02 
 
 		 560 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0172507  hitchhiker  0.0081168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19470  malate:quinone oxidoreductase  24.58 
 
 		 523 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4052  malate:quinone oxidoreductase  25.78 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2102  malate:quinone oxidoreductase  24.52 
 
 		 549 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.798564  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0001  malate:quinone oxidoreductase  23.08 
 
 		 507 aa  70.9  0.00000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3677  malate:quinone oxidoreductase  23.17 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5289  malate:quinone oxidoreductase  25.27 
 
 		 507 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.283947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2387  malate:quinone oxidoreductase  24.62 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0382746  normal  0.138947 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2788  malate:quinone oxidoreductase  26.54 
 
 		 552 aa  70.5  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.772019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1853  malate:quinone oxidoreductase  23.63 
 
 		 562 aa  70.1  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>