42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2695 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  100 
 
 		 366 aa  726    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  37.24 
 
 		 819 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  38.91 
 
 		 638 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  34.15 
 
 		 826 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  36.2 
 
 		 676 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  32.5 
 
 		 834 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  32.5 
 
 		 836 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  32.46 
 
 		 851 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  31.99 
 
 		 843 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  33.63 
 
 		 821 aa  139  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  34.04 
 
 		 837 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  33.93 
 
 		 807 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  32.5 
 
 		 836 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  33.43 
 
 		 840 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  36.65 
 
 		 851 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  32.05 
 
 		 826 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  33.86 
 
 		 811 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  32.46 
 
 		 829 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  33.88 
 
 		 817 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  32.13 
 
 		 829 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  32.13 
 
 		 829 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  31.58 
 
 		 851 aa  126  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  33.54 
 
 		 818 aa  124  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  30.23 
 
 		 830 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  34.06 
 
 		 820 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  28.87 
 
 		 1209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  28.24 
 
 		 476 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  27.94 
 
 		 1209 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  30.56 
 
 		 651 aa  105  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  28.65 
 
 		 878 aa  102  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  30.67 
 
 		 837 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  31.85 
 
 		 835 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  30.89 
 
 		 838 aa  99.8  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  28.86 
 
 		 1224 aa  96.7  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  28.86 
 
 		 1224 aa  96.7  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  32.03 
 
 		 638 aa  96.3  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  28.35 
 
 		 1237 aa  94  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  28.65 
 
 		 1224 aa  93.6  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  50.67 
 
 		 951 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3639  LigA  50.67 
 
 		 948 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3780  LigA  46.67 
 
 		 948 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  30.39 
 
 		 498 aa  69.7  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>