More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3221 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  97.63 
 
 		 422 aa  839    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  97.39 
 
 		 422 aa  840    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  98.58 
 
 		 422 aa  864    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  87.2 
 
 		 422 aa  758    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  86.49 
 
 		 422 aa  751    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  97.39 
 
 		 422 aa  839    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  100 
 
 		 422 aa  875    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  87.44 
 
 		 422 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  97.87 
 
 		 422 aa  842    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  87.2 
 
 		 422 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  86.97 
 
 		 422 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  97.63 
 
 		 422 aa  839    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  98.34 
 
 		 422 aa  862    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  97.87 
 
 		 422 aa  842    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  70.94 
 
 		 416 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  70.94 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  70.94 
 
 		 416 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  71.83 
 
 		 425 aa  579  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  56.39 
 
 		 407 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  59.15 
 
 		 399 aa  463  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  56.33 
 
 		 410 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  56.19 
 
 		 408 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  57.47 
 
 		 403 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  57.83 
 
 		 416 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  55.61 
 
 		 397 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  53.81 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  54.08 
 
 		 398 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  53.69 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  50.64 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  52.42 
 
 		 403 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  52.04 
 
 		 409 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  53.44 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  47.98 
 
 		 402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  52.17 
 
 		 396 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  47.73 
 
 		 402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  51.15 
 
 		 406 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  51.15 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  49.87 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  46.82 
 
 		 407 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  46.31 
 
 		 404 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  46.73 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  47.12 
 
 		 399 aa  362  6e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  45.27 
 
 		 409 aa  360  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  45.34 
 
 		 400 aa  360  4e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  44.3 
 
 		 399 aa  339  5.9999999999999996e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  43.14 
 
 		 403 aa  335  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  42.67 
 
 		 398 aa  329  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  44.75 
 
 		 390 aa  319  6e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  43.11 
 
 		 406 aa  317  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  42.9 
 
 		 396 aa  317  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  44.41 
 
 		 395 aa  316  4e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  41.12 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  40.05 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  40.3 
 
 		 412 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  42.33 
 
 		 408 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  42.78 
 
 		 396 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  38.94 
 
 		 427 aa  302  8.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  39.72 
 
 		 442 aa  300  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  41.41 
 
 		 396 aa  292  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  40.05 
 
 		 625 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  38.06 
 
 		 398 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  39.84 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  40.11 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 		 399 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  56.02 
 
 		 245 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  39.74 
 
 		 403 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  38.42 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  32.07 
 
 		 403 aa  196  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  31.05 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 408 aa  182  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  30.79 
 
 		 409 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 437 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 399 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 399 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 371 aa  145  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 375 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  31.01 
 
 		 368 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 		 364 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  28.57 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 366 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  26.98 
 
 		 489 aa  133  6.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  29.25 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 378 aa  130  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.36 
 
 		 373 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.36 
 
 		 373 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.36 
 
 		 373 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  28.36 
 
 		 373 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 373 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4257  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 363 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000201073 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  26.09 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.09 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4703  predicted protein  24.32 
 
 		 373 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.629805  normal  0.0151489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>