66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3535 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  353  5e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  38.46 
 
 		 189 aa  88.6  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  36.84 
 
 		 182 aa  87  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  37.3 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  31.65 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  41.54 
 
 		 181 aa  85.5  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  34.04 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  31.85 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  34.39 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  37.14 
 
 		 182 aa  73.9  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  32.43 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  34.31 
 
 		 358 aa  72.4  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  35.34 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  35.67 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  26.58 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  35.07 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1786  hypothetical protein  35.77 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.257268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  28.76 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  31.52 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  29.29 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  30.5 
 
 		 450 aa  62  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  29.09 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  31.5 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  30.57 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  30.57 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  29.93 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2183  hypothetical protein  26.09 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  34.15 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1771  hypothetical protein  30.26 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  32.84 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  32.84 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  32.84 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  32.84 
 
 		 140 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3656  hypothetical protein  32.58 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  26.92 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  26.92 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  26.92 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0320  hypothetical protein  41.67 
 
 		 63 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.581982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  30.43 
 
 		 143 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  25.64 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  34.38 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  34.38 
 
 		 135 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  34.38 
 
 		 135 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  23.91 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2879  hypothetical protein  31.33 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1484  hypothetical protein  28.17 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  31.34 
 
 		 142 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  25.37 
 
 		 221 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2450  PEP2-like protein  23.61 
 
 		 222 aa  47.8  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.865841  normal  0.196938 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  29.2 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0753  hypothetical protein  27.98 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  32.95 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  30.38 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  32.23 
 
 		 133 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4230  PEP2 protein-like  26.92 
 
 		 201 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  29.01 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3720  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  29.92 
 
 		 274 aa  45.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81836  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  34.57 
 
 		 145 aa  44.7  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  25.35 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  27.82 
 
 		 146 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  28.06 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  25.58 
 
 		 138 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  28.89 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3860  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  34.88 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.705611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>