95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0018 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0018  pyroglutamyl-peptidase I  100 
 
 		 217 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1260  pyrrolidone-carboxylate peptidase  57.82 
 
 		 214 aa  264  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.541603  normal  0.56502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4364  pyrrolidone-carboxylate peptidase  58.22 
 
 		 219 aa  263  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0067  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.22 
 
 		 222 aa  257  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1219  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.87 
 
 		 214 aa  257  8e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0711595 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3594  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.13 
 
 		 215 aa  254  5e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1120  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.13 
 
 		 215 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.195219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1172  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.13 
 
 		 215 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0112085  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0871  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.54 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.223672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3116  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.3 
 
 		 215 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.974119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3115  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.3 
 
 		 215 aa  251  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00102651  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0092  pyrrolidone-carboxylate peptidase  56.07 
 
 		 216 aa  251  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3090  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.3 
 
 		 215 aa  251  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2875  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.3 
 
 		 215 aa  251  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2844  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.3 
 
 		 215 aa  249  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.399025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3096  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.3 
 
 		 215 aa  249  3e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2153  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.3 
 
 		 215 aa  248  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2805  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.83 
 
 		 215 aa  246  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3083  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.36 
 
 		 215 aa  246  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.553169  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1229  pyrrolidone-carboxylate peptidase  55.19 
 
 		 215 aa  244  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2056  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.36 
 
 		 215 aa  244  8e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2869  pyrrolidone-carboxylate peptidase  51.42 
 
 		 215 aa  243  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.113526  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2368  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.49 
 
 		 215 aa  243  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.176358  normal  0.622476 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3107  pyrrolidone-carboxylate peptidase  54.72 
 
 		 215 aa  241  6e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.47692  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1968  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.02 
 
 		 215 aa  241  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2165  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.02 
 
 		 215 aa  239  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.206195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5729  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.78 
 
 		 222 aa  236  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.350775  normal  0.668276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2568  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.63 
 
 		 215 aa  234  7e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6277  Pyroglutamyl-peptidase I  53.77 
 
 		 206 aa  234  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0324946  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0259  pyrrolidone-carboxylate peptidase protein  51.42 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.295559  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0336  pyrrolidone-carboxylate peptidase  53.74 
 
 		 214 aa  229  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130815  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37410  pyroglutamyl-peptidase I  51.4 
 
 		 213 aa  227  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119765  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3959  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.58 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.946575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4072  pyrrolidone-carboxylate peptidase  48.58 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.63729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1512  pyroglutamyl-peptidase I  51.39 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.416265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1486  pyroglutamyl-peptidase I  48.21 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001503  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.38 
 
 		 212 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00834803  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0175  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.3 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.329547  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0439  pyrrolidone-carboxylate peptidase  52.71 
 
 		 215 aa  214  9e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000083875  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05437  pyrrolidone-carboxylate peptidase  49.52 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0340  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.93 
 
 		 216 aa  208  4e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0762  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50.53 
 
 		 202 aa  207  7e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2993  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.7 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2057  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.41 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.327905  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1678  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.48 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1374  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50.26 
 
 		 203 aa  198  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.06476  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1413  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.01 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0080  pyrrolidone-carboxylate peptidase  50.5 
 
 		 212 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1832  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.2 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.248884 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1235  pyrrolidone-carboxylate peptidase  46.48 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2317  pyrrolidone-carboxylate peptidase  47.37 
 
 		 212 aa  185  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2071  pyroglutamyl-peptidase I  44.9 
 
 		 207 aa  184  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.330947 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C27  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.93 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2771  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.54 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.121473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2714  pyrrolidone-carboxylate peptidase  45.54 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000301131  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1274  pyrrolidone-carboxylate peptidase  42.79 
 
 		 231 aa  168  5e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130816  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0030  Pyroglutamyl-peptidase I  44.21 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1230  Pyroglutamyl-peptidase I  42.72 
 
 		 208 aa  161  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.156659 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2286  pyrrolidone-carboxylate peptidase  41.9 
 
 		 226 aa  158  6e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02130  pyroglutamyl-peptidase I  41.01 
 
 		 209 aa  154  9e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2191  Pyroglutamyl-peptidase I  40.57 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.570056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1273  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.75 
 
 		 211 aa  152  5e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2740  pyrrolidone-carboxylate peptidase  40.72 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10324  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.39 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2052  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.23 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.976039 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0563  putative pyroglutamyl-peptidase I  38.89 
 
 		 201 aa  141  9e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1774  pyrrolidone-carboxylate peptidase  43.59 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.159334  normal  0.0692412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14510  pyroglutamyl-peptidase I  40.28 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.580197  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1586  pyrrolidone-carboxylate peptidase  37.68 
 
 		 208 aa  137  7.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0441  pyrrolidone-carboxylate peptidase  38.61 
 
 		 211 aa  131  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.219563  normal  0.125179 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2307  Pyroglutamyl-peptidase I  33.66 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5705  Pyroglutamyl-peptidase I  35.27 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.990746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0885  pyroglutamyl-peptidase I  37.44 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0998  pyroglutamyl-peptidase I  33.51 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.440461  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1081  pyrrolidone-carboxylate peptidase  28.95 
 
 		 225 aa  95.5  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3440  pyroglutamyl-peptidase I  40 
 
 		 146 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1658  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  29.31 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.372459  normal  0.0564936 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3435  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  35.05 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0373  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  31.58 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2489  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  31.61 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3018  putative pyrrolidone-carboxylate peptidase  26.17 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.44949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0181  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  27.81 
 
 		 167 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1530  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  27.91 
 
 		 171 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0341  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  29.05 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1503  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  27.33 
 
 		 171 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3543  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  26 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.532513  normal  0.704301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0297  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  28.49 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1921  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  25 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4590  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  27.87 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743005  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1074  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  26.43 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.254638 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1753  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  27.13 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.144316 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43368  predicted protein  24.37 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2644  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  27.96 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.808303  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2241  peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I  24.61 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0830949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2032  peptidase C15 pyroglutamyl peptidase I  24.74 
 
 		 216 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>