226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2055 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2055  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  902    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.655381  normal  0.223767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  47.4 
 
 		 504 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  54.07 
 
 		 445 aa  411  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  43.07 
 
 		 525 aa  306  4.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  49.26 
 
 		 431 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3259  DNA recombination protein RmuC, putative  42.94 
 
 		 486 aa  278  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2859  protein of unknown function DUF195  36.86 
 
 		 512 aa  276  8e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1860  hypothetical protein  41.78 
 
 		 448 aa  276  8e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5536  hypothetical protein  45.1 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.183542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  40.81 
 
 		 503 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  36.82 
 
 		 459 aa  272  9e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0324522 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2404  hypothetical protein  37.9 
 
 		 462 aa  271  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0053  protein of unknown function DUF195  40.37 
 
 		 531 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.783995  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1528  hypothetical protein  37.7 
 
 		 417 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1103  protein of unknown function DUF195  37.69 
 
 		 523 aa  270  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1509  protein of unknown function DUF195  40.77 
 
 		 442 aa  269  8e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  0.015225 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3697  protein of unknown function DUF195  44.06 
 
 		 364 aa  266  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.111371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0527  hypothetical protein  43.14 
 
 		 428 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.946618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26410  hypothetical protein  41.81 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0823467  normal  0.277767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  41.04 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3872  hypothetical protein  40.31 
 
 		 493 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1093  protein of unknown function DUF195  42.52 
 
 		 501 aa  265  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.193289  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3063  hypothetical protein  42.15 
 
 		 443 aa  264  3e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1288  hypothetical protein  40.45 
 
 		 554 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.624866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0942  protein of unknown function DUF195  38.52 
 
 		 494 aa  260  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0882  hypothetical protein  43.87 
 
 		 386 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0130  protein of unknown function DUF195  38.43 
 
 		 474 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4385  protein of unknown function DUF195  41.16 
 
 		 398 aa  250  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0827  hypothetical protein  45.74 
 
 		 403 aa  246  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208315  normal  0.172585 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1210  hypothetical protein  40.81 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0396  hypothetical protein  38.53 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8270  protein of unknown function DUF195  42.52 
 
 		 366 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8478  hypothetical protein  39.75 
 
 		 434 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0251  hypothetical protein  35.47 
 
 		 443 aa  239  6.999999999999999e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0178  protein of unknown function DUF195  36.04 
 
 		 417 aa  239  8e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.309141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0132  hypothetical protein  36.11 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.326041 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0097  RmuC domain protein  42.91 
 
 		 446 aa  238  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.186787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1010  protein of unknown function DUF195  41.12 
 
 		 387 aa  233  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1078  hypothetical protein  44.93 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  38.36 
 
 		 473 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22950  hypothetical protein  40.48 
 
 		 399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20260  hypothetical protein  36.25 
 
 		 390 aa  216  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140887  normal  0.2743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3397  protein of unknown function DUF195  38.72 
 
 		 391 aa  211  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.648521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3111  protein of unknown function DUF195  40.92 
 
 		 361 aa  210  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294839  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16280  hypothetical protein  38.37 
 
 		 419 aa  207  4e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2547  protein of unknown function DUF195  36.29 
 
 		 428 aa  206  6e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000236422 
 
 
-
 
NC_002620  TC0212  hypothetical protein  30.98 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.828645  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  31.82 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  31.82 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  31.82 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  31.82 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  31.82 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  31.82 
 
 		 475 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  31.82 
 
 		 475 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  31.82 
 
 		 475 aa  196  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  31.82 
 
 		 475 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  33.02 
 
 		 527 aa  196  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  34.98 
 
 		 548 aa  193  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01951  RmuC  29.95 
 
 		 429 aa  190  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  34.19 
 
 		 495 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2832  hypothetical protein  35.47 
 
 		 403 aa  189  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  32.83 
 
 		 485 aa  189  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  33.16 
 
 		 640 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  35.65 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  31.96 
 
 		 515 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  35.95 
 
 		 504 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  32.43 
 
 		 453 aa  187  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  32.01 
 
 		 510 aa  186  6e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  32.85 
 
 		 492 aa  186  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  32.01 
 
 		 495 aa  186  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  31.2 
 
 		 522 aa  186  9e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  35.44 
 
 		 495 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  35.8 
 
 		 492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  34.21 
 
 		 500 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  34.02 
 
 		 495 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  27.61 
 
 		 470 aa  184  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  31.84 
 
 		 518 aa  184  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12181  hypothetical protein  28.45 
 
 		 531 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.282455  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  29.36 
 
 		 448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1035  protein of unknown function DUF195  31.63 
 
 		 612 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000597215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0033  RmuC domain-containing protein  31.2 
 
 		 432 aa  183  6e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0691  hypothetical protein  31.47 
 
 		 532 aa  182  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  30.19 
 
 		 498 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  28.38 
 
 		 520 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1614  hypothetical protein  34.44 
 
 		 494 aa  180  4e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0228591  normal  0.73372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  31.96 
 
 		 476 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  31.96 
 
 		 476 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  31.96 
 
 		 476 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  31.74 
 
 		 476 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  32.12 
 
 		 476 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  27.98 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  28.93 
 
 		 535 aa  177  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  29.12 
 
 		 519 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  29.82 
 
 		 480 aa  176  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  29.12 
 
 		 519 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1321  hypothetical protein  28.65 
 
 		 427 aa  176  5e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  29.12 
 
 		 518 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  32.34 
 
 		 424 aa  176  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  32.1 
 
 		 530 aa  176  9e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3642  RmuC domain-containing protein  30.81 
 
 		 501 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>