More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2334 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  100 
 
 		 446 aa  867    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  43.19 
 
 		 477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  42.69 
 
 		 480 aa  351  2e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  42.37 
 
 		 492 aa  346  4e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  42.89 
 
 		 468 aa  331  1e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  38.88 
 
 		 484 aa  318  2e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  40.53 
 
 		 474 aa  314  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  38.85 
 
 		 458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  36.72 
 
 		 468 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  37.44 
 
 		 480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  38.67 
 
 		 468 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  39.42 
 
 		 516 aa  300  4e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  36.59 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  37.33 
 
 		 497 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  39.77 
 
 		 447 aa  298  2e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  38.19 
 
 		 471 aa  297  3e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  39.19 
 
 		 459 aa  295  8e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0118  sugar transporter  36.61 
 
 		 480 aa  287  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  39.23 
 
 		 464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  36.04 
 
 		 482 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  35.96 
 
 		 533 aa  283  3.0000000000000004e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  39.23 
 
 		 464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  39.23 
 
 		 464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  39.23 
 
 		 464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  39.23 
 
 		 464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  39.23 
 
 		 464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  39.23 
 
 		 464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  39.23 
 
 		 464 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  39.23 
 
 		 464 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  36.59 
 
 		 490 aa  282  7.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  36.11 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  37.12 
 
 		 475 aa  281  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  39 
 
 		 464 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  39 
 
 		 464 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  39 
 
 		 464 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  39 
 
 		 464 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  39 
 
 		 464 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1681  D-xylose proton-symporter  38.77 
 
 		 464 aa  278  1e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.142267  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  34.79 
 
 		 480 aa  277  2e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  36.04 
 
 		 507 aa  278  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  35.7 
 
 		 448 aa  276  6e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  37.87 
 
 		 465 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  36.53 
 
 		 477 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  34.09 
 
 		 450 aa  269  5.9999999999999995e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  36.57 
 
 		 476 aa  269  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  36.79 
 
 		 463 aa  269  8.999999999999999e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  36.57 
 
 		 463 aa  268  1e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  33.11 
 
 		 466 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  33.86 
 
 		 466 aa  266  5e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  33.04 
 
 		 468 aa  266  5.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  35.76 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  35.17 
 
 		 452 aa  260  4e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  34.58 
 
 		 478 aa  260  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  33.41 
 
 		 473 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  36.01 
 
 		 452 aa  259  8e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  36.01 
 
 		 452 aa  259  8e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  32.82 
 
 		 473 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  34.19 
 
 		 472 aa  257  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  34.88 
 
 		 482 aa  256  8e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  35.16 
 
 		 473 aa  256  8e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  34.29 
 
 		 464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  34.93 
 
 		 473 aa  253  7e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  33.56 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  36.4 
 
 		 475 aa  249  5e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  34.09 
 
 		 482 aa  249  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  33.93 
 
 		 457 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  33.69 
 
 		 468 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  34.34 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  34.33 
 
 		 457 aa  246  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  35.01 
 
 		 482 aa  246  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  35.01 
 
 		 497 aa  245  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  33.49 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  35.62 
 
 		 504 aa  242  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  35 
 
 		 474 aa  242  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  34.62 
 
 		 480 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  32.48 
 
 		 485 aa  239  6.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  33.18 
 
 		 491 aa  239  8e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  33.26 
 
 		 487 aa  239  8e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  33.12 
 
 		 493 aa  238  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  35.41 
 
 		 475 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  34.51 
 
 		 469 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  33.05 
 
 		 544 aa  236  7e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3729  sugar transporter  32.65 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  32.65 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  32.42 
 
 		 471 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  35.16 
 
 		 479 aa  233  7.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  32.66 
 
 		 445 aa  233  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  32.87 
 
 		 472 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  32.14 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  32.87 
 
 		 472 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  31.31 
 
 		 485 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  34.1 
 
 		 438 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  33.41 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  33.69 
 
 		 499 aa  231  3e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  30.77 
 
 		 491 aa  230  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  32.87 
 
 		 472 aa  230  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  32.87 
 
 		 472 aa  230  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  30.38 
 
 		 475 aa  230  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  32.87 
 
 		 472 aa  230  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  32.87 
 
 		 472 aa  230  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>