More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1080 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 558 aa  1124    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  85.23 
 
 		 559 aa  963    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  85.23 
 
 		 559 aa  963    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  44.35 
 
 		 573 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  42.15 
 
 		 573 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  42.13 
 
 		 579 aa  429  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  43.08 
 
 		 579 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  42.13 
 
 		 579 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  41.61 
 
 		 579 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  42.13 
 
 		 579 aa  427  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  41.93 
 
 		 583 aa  423  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  41.78 
 
 		 579 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  41.78 
 
 		 583 aa  423  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  40.29 
 
 		 559 aa  423  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  41.78 
 
 		 579 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  41.78 
 
 		 579 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  41.96 
 
 		 579 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  39.68 
 
 		 566 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  39.03 
 
 		 554 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  37.55 
 
 		 555 aa  378  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  37.59 
 
 		 570 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  37.16 
 
 		 552 aa  371  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  36.92 
 
 		 556 aa  370  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  37.36 
 
 		 558 aa  364  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  36.38 
 
 		 567 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  35.87 
 
 		 555 aa  357  2.9999999999999997e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  36.94 
 
 		 565 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  38.96 
 
 		 553 aa  352  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  38.13 
 
 		 565 aa  352  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  35.29 
 
 		 554 aa  352  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  37.61 
 
 		 556 aa  352  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 553 aa  348  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  35.91 
 
 		 560 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  34.88 
 
 		 562 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  35.65 
 
 		 565 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  35.65 
 
 		 565 aa  342  8e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  36.62 
 
 		 551 aa  340  5e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  37.77 
 
 		 557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  35.61 
 
 		 555 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  35.08 
 
 		 578 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  34.74 
 
 		 572 aa  331  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  37.28 
 
 		 553 aa  331  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  34.3 
 
 		 561 aa  329  8e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1233  DNA repair ATPase  36.33 
 
 		 551 aa  328  2.0000000000000001e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.337705  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  32.75 
 
 		 580 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  33.04 
 
 		 556 aa  322  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  34.41 
 
 		 562 aa  320  3e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  34.11 
 
 		 560 aa  320  6e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  34.52 
 
 		 555 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  33.51 
 
 		 574 aa  319  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  35.45 
 
 		 569 aa  318  2e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  34.84 
 
 		 552 aa  317  5e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 572 aa  316  7e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  34.94 
 
 		 586 aa  316  7e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  35.94 
 
 		 577 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  33.99 
 
 		 555 aa  313  6.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  34.02 
 
 		 599 aa  310  6.999999999999999e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 558 aa  307  3e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1026  recombination and repair protein  33.45 
 
 		 554 aa  307  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0877  DNA repair protein RecN  32.79 
 
 		 552 aa  306  6e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  32.15 
 
 		 567 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  33.57 
 
 		 559 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  32.44 
 
 		 560 aa  305  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  32.2 
 
 		 557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  34.81 
 
 		 553 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  32.19 
 
 		 557 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 		 574 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3012  DNA repair protein  33.16 
 
 		 551 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  34.38 
 
 		 558 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  32.94 
 
 		 601 aa  303  6.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  32.88 
 
 		 587 aa  301  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  33.81 
 
 		 553 aa  299  8e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  33.81 
 
 		 553 aa  299  9e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  33.81 
 
 		 553 aa  299  9e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1169  recombination and repair protein  32.91 
 
 		 553 aa  298  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  30.65 
 
 		 588 aa  297  4e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  33.27 
 
 		 554 aa  296  5e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  31.64 
 
 		 588 aa  295  1e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  32.56 
 
 		 561 aa  295  1e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  30.7 
 
 		 588 aa  295  1e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  31.96 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  34.03 
 
 		 558 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.16 
 
 		 557 aa  295  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1385  DNA repair protein  33.75 
 
 		 608 aa  294  3e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276871  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  33.04 
 
 		 553 aa  292  9e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1446  DNA repair protein RecN  33.75 
 
 		 556 aa  292  9e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000211173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  34.73 
 
 		 558 aa  292  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  33.04 
 
 		 553 aa  292  1e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  32.32 
 
 		 552 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  32.81 
 
 		 572 aa  291  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0623  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 		 568 aa  291  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.72171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2771  recombination and repair protein  31.79 
 
 		 552 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.170925  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1714  DNA repair protein RecN  32.45 
 
 		 557 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0456  DNA repair protein RecN  32.27 
 
 		 553 aa  291  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  32.57 
 
 		 551 aa  290  4e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  34.41 
 
 		 557 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  30.85 
 
 		 559 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  34.59 
 
 		 557 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3298  recombination and repair protein  33.16 
 
 		 553 aa  289  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  32.8 
 
 		 553 aa  289  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>