More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1923 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
331 aa  688    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  84.59 
 
 
333 aa  608  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  70.69 
 
 
331 aa  499  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  66.47 
 
 
334 aa  456  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  66.16 
 
 
330 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  62.24 
 
 
332 aa  435  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  62.2 
 
 
328 aa  430  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  60.55 
 
 
328 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  58.61 
 
 
330 aa  419  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  58.61 
 
 
330 aa  419  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  60.49 
 
 
326 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  60.18 
 
 
328 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  55.62 
 
 
327 aa  404  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  59.09 
 
 
328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  58.79 
 
 
328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  57.14 
 
 
330 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  59.39 
 
 
329 aa  394  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  56.19 
 
 
354 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  53.8 
 
 
330 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  53.8 
 
 
330 aa  371  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  53.8 
 
 
330 aa  372  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  55.32 
 
 
328 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  53.8 
 
 
330 aa  372  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  53.8 
 
 
330 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  53.8 
 
 
330 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  53.5 
 
 
330 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  53.19 
 
 
330 aa  368  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  50.76 
 
 
330 aa  366  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  53.4 
 
 
332 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  51.06 
 
 
327 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  51.67 
 
 
329 aa  353  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  50.77 
 
 
329 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  52.48 
 
 
328 aa  348  7e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  52.48 
 
 
328 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 
330 aa  346  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  50.77 
 
 
332 aa  342  5.999999999999999e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  50.15 
 
 
333 aa  342  7e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  52.13 
 
 
324 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  51.07 
 
 
333 aa  340  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  50.77 
 
 
332 aa  340  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 
337 aa  338  5e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 
337 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  50.3 
 
 
329 aa  334  1e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  48.34 
 
 
328 aa  334  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 
320 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  47.43 
 
 
330 aa  329  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  51.56 
 
 
331 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 
332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  49.55 
 
 
326 aa  326  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  49.24 
 
 
329 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 
323 aa  324  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  51.71 
 
 
327 aa  323  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  48.76 
 
 
332 aa  323  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 
321 aa  322  4e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  49.24 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 
325 aa  319  5e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  49.85 
 
 
331 aa  317  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 
324 aa  317  2e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  46.5 
 
 
327 aa  316  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  46.93 
 
 
334 aa  315  7e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  48.76 
 
 
330 aa  315  8e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  47.37 
 
 
332 aa  314  9.999999999999999e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  48.33 
 
 
328 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  49.38 
 
 
332 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  44.95 
 
 
351 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  45.51 
 
 
329 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  48.91 
 
 
337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  47.02 
 
 
338 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 
326 aa  308  6.999999999999999e-83  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 
324 aa  306  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  46.2 
 
 
327 aa  306  4.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  47.11 
 
 
328 aa  305  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  47.02 
 
 
328 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  46.77 
 
 
324 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  46.5 
 
 
328 aa  299  4e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 
330 aa  299  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  48 
 
 
323 aa  298  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  45.45 
 
 
327 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  47.52 
 
 
329 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  45.79 
 
 
329 aa  295  8e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  45.48 
 
 
337 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  45.82 
 
 
339 aa  294  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 
350 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 
321 aa  292  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 
327 aa  293  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  43.83 
 
 
330 aa  292  7e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  45.09 
 
 
331 aa  292  7e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  49.08 
 
 
324 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  45.17 
 
 
326 aa  291  8e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 
321 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  45.89 
 
 
328 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  46.11 
 
 
337 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  46.58 
 
 
327 aa  291  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  46.25 
 
 
330 aa  290  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 
329 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  45.09 
 
 
325 aa  290  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  48.59 
 
 
320 aa  289  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 
324 aa  289  5.0000000000000004e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  45.37 
 
 
334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  44.51 
 
 
327 aa  288  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>