More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1061 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  100 
 
 		 291 aa  568  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  52.9 
 
 		 347 aa  281  8.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  55.52 
 
 		 328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  55.76 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  49.81 
 
 		 315 aa  258  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  47.87 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  48.39 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  49.46 
 
 		 316 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  43.82 
 
 		 342 aa  252  6e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  49.09 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  46.98 
 
 		 354 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  45.42 
 
 		 343 aa  250  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  53.43 
 
 		 317 aa  247  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  49.28 
 
 		 348 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  45.42 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  46.38 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  48.85 
 
 		 352 aa  241  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  44.1 
 
 		 337 aa  240  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  48.35 
 
 		 343 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  46.05 
 
 		 326 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  48.77 
 
 		 316 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  49.12 
 
 		 351 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  50.18 
 
 		 317 aa  232  6e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  44.8 
 
 		 354 aa  232  6e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  48.08 
 
 		 327 aa  232  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  48.77 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  45.77 
 
 		 343 aa  228  8e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  45.59 
 
 		 340 aa  226  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  47.55 
 
 		 349 aa  226  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  47.16 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  50.79 
 
 		 346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  40.5 
 
 		 358 aa  225  6e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  46.98 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  49.12 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  47.41 
 
 		 321 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  51.07 
 
 		 345 aa  222  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  44.57 
 
 		 321 aa  221  9e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  43.84 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  47.14 
 
 		 348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  44.09 
 
 		 343 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  42.05 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  46.18 
 
 		 343 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  46.01 
 
 		 351 aa  216  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  50 
 
 		 319 aa  215  5.9999999999999996e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  45.52 
 
 		 344 aa  215  7e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  46.62 
 
 		 354 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  47.43 
 
 		 351 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  49.41 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09630  selenophosphate synthase  52.82 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524935  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  44.04 
 
 		 347 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  43.66 
 
 		 357 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  40.5 
 
 		 340 aa  211  9e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  43.64 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  43.77 
 
 		 351 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  40.5 
 
 		 308 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  46.62 
 
 		 297 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  42.61 
 
 		 348 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  42.61 
 
 		 348 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  42.8 
 
 		 351 aa  209  6e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  45.36 
 
 		 352 aa  209  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2720  selenide, water dikinase  44.77 
 
 		 347 aa  208  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00388711 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  42.61 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  42.7 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  47.37 
 
 		 344 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  49.19 
 
 		 333 aa  208  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  47.72 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  41.37 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  44.41 
 
 		 355 aa  206  3e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  47.49 
 
 		 359 aa  206  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000499112  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2385  selenophosphate synthase  47.22 
 
 		 351 aa  206  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510286 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  43.68 
 
 		 352 aa  205  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04230  selenophosphate synthase  49.59 
 
 		 357 aa  205  8e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776099  normal  0.124051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  43.54 
 
 		 347 aa  205  8e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  43.75 
 
 		 359 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2455  selenophosphate synthetase  46.01 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5279  selenide, water dikinase  50.4 
 
 		 335 aa  203  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  43.87 
 
 		 362 aa  202  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  44.74 
 
 		 352 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  44.74 
 
 		 352 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  44.74 
 
 		 352 aa  202  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  42.71 
 
 		 347 aa  201  9e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0300  selenophosphate synthetase  47.12 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  44.09 
 
 		 356 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  44.93 
 
 		 345 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  45 
 
 		 671 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  42.44 
 
 		 352 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  45.88 
 
 		 353 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3578  selenide, water dikinase  45.42 
 
 		 331 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.319488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1054  selenophosphate synthetase  42.31 
 
 		 348 aa  199  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  43.73 
 
 		 356 aa  199  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  44.36 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  42.44 
 
 		 352 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0666  selenide, water dikinase  42.7 
 
 		 350 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  41.58 
 
 		 351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  40.59 
 
 		 346 aa  199  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1162  selenophosphate synthetase  41.99 
 
 		 343 aa  199  6e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.268491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  43.21 
 
 		 340 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  43.01 
 
 		 354 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  43.73 
 
 		 354 aa  198  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  43.01 
 
 		 357 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>