More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0074 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0074  aminotransferase  100 
 
 		 405 aa  807    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1002  aminotransferase class I and II  47.67 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3830  succinyldiaminopimelate aminotransferase  56.35 
 
 		 383 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3971  aminotransferase class I and II  55.97 
 
 		 396 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.661843  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3944  aminotransferase class I and II  56.42 
 
 		 388 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3893  aminotransferase class I and II  54.52 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  39.78 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  37.87 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.4 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.95 
 
 		 390 aa  235  8e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.47 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  35.31 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  37.43 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.34 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  38.7 
 
 		 382 aa  227  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.85 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  37.77 
 
 		 388 aa  226  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  37.05 
 
 		 387 aa  225  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  35.39 
 
 		 402 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.44 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  37.2 
 
 		 391 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  36.12 
 
 		 403 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.64 
 
 		 388 aa  222  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  36.97 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  34.85 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  37.23 
 
 		 382 aa  221  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  33.25 
 
 		 392 aa  220  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  34.58 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  35.7 
 
 		 401 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.16 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  37.63 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0044  succinyldiaminopimelate transaminase  35.53 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.32 
 
 		 388 aa  212  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.29 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1221  succinyldiaminopimelate transaminase  35.79 
 
 		 398 aa  210  3e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  35.22 
 
 		 384 aa  209  8e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  34.64 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1807  succinyldiaminopimelate transaminase  36.71 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1469  aminotransferase, class I and II  38.9 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0492  N-succinyldiaminopimelate aminotransferase  39.04 
 
 		 370 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.711349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  34.63 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  32.29 
 
 		 390 aa  202  9e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2485  succinyldiaminopimelate transaminase  36.55 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.354726  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1386  succinyldiaminopimelate transaminase  35.19 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0560  succinyldiaminopimelate transaminase  36.73 
 
 		 399 aa  199  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.370858  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0274  succinyldiaminopimelate transaminase  35.53 
 
 		 409 aa  199  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8434  aminotransferase class I and II  38.52 
 
 		 359 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  34.22 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  34.5 
 
 		 392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  33.77 
 
 		 389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  35.85 
 
 		 390 aa  195  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3027  aminotransferase class I and II  39.34 
 
 		 359 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.396849 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2603  succinyldiaminopimelate transaminase  31.58 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1150  aminotransferase class I and II  38.71 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0584766  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1758  aminotransferase, class I and II  39.23 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0491  aminotransferase class I and II  33.33 
 
 		 376 aa  193  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1143  succinyldiaminopimelate transaminase  34.26 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385883  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3902  succinyldiaminopimelate transaminase  36.36 
 
 		 368 aa  193  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.116371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2551  aminotransferase, class I and II  34.85 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.138065  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1394  succinyldiaminopimelate transaminase  32.93 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3016  aminotransferase  32.12 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562115  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3617  succinyldiaminopimelate transaminase  35.2 
 
 		 401 aa  190  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115899  normal  0.0503817 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  33.42 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1588  succinyldiaminopimelate transaminase  33.75 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133702  normal  0.347765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1531  aminotransferase, classes I and II  35.36 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1340  succinyldiaminopimelate transaminase  35.73 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.313049 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0082  aminotransferase, class I and II  36.84 
 
 		 423 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.61 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1267  succinyldiaminopimelate transaminase  32.65 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589506  normal  0.362674 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1032  succinyldiaminopimelate transaminase  34.51 
 
 		 397 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4189  succinyldiaminopimelate transaminase  33.5 
 
 		 398 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.199864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  34.32 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  34.32 
 
 		 406 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1331  succinyldiaminopimelate transaminase  32.4 
 
 		 399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1866  succinyldiaminopimelate transaminase  35.29 
 
 		 396 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  33.69 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1738  aminotransferase  34.22 
 
 		 405 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.990718  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0644  aminotransferase  33.96 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439805  normal  0.145502 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1491  succinyldiaminopimelate transaminase  34.61 
 
 		 398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.997861  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1916  aminotransferase  34.32 
 
 		 407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4085  succinyldiaminopimelate transaminase  33.33 
 
 		 398 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.930262 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1850  succinyldiaminopimelate transaminase  32.24 
 
 		 397 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0598613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  30.83 
 
 		 388 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  33.51 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2047  succinyldiaminopimelate transaminase  32.51 
 
 		 409 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  34.9 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  31.15 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1098  succinyldiaminopimelate transaminase  35.46 
 
 		 399 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  34.64 
 
 		 390 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1153  succinyldiaminopimelate transaminase  33.84 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1889  succinyldiaminopimelate transaminase  36.94 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2066  succinyldiaminopimelate transaminase  36.94 
 
 		 404 aa  179  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.595829 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3056  succinyldiaminopimelate transaminase  33.75 
 
 		 398 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.433541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0555  succinyldiaminopimelate transaminase  30.88 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147864 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1671  succinyldiaminopimelate transaminase  32.83 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1938  aminotransferase class I and II  29.43 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1891  succinyldiaminopimelate transaminase  32.99 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2310  aminotransferase  32.77 
 
 		 405 aa  176  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0059  aminotransferase  33.79 
 
 		 392 aa  176  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.419945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11140  aminotransferase  36.39 
 
 		 396 aa  176  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.197788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>