More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3377 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3377  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 256 aa  511  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.189225  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0956  hypothetical protein  50.84 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.412658  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2092  hypothetical protein  50.21 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499722  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1720  hypothetical protein  47.97 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  49.34 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0384  hypothetical protein  47.84 
 
 		 254 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.72124  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2243  hypothetical protein  46.96 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0204  alpha/beta hydrolase fold  49.14 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2038  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.965886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0852  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  47.56 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0802  alpha/beta fold family hydrolase  43.03 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0169  hypothetical protein  45.67 
 
 		 265 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0042  conserved hypothetical protein, putative alpha/beta hydrolase superfamily  45.25 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1102  hypothetical protein  49.37 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0231031  normal  0.0560372 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0078  hypothetical protein  48.71 
 
 		 257 aa  202  5e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2193  hypothetical protein  49.37 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0195926  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0070  hypothetical protein  47.11 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.105753 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0804  hypothetical protein  42.74 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0067  hypothetical protein  44.94 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2116  hypothetical protein  42.69 
 
 		 263 aa  198  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2031  putative benzoate transport protein  43.24 
 
 		 647 aa  198  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0670  hypothetical protein  41.39 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0326  alpha/beta fold family hydrolase  35.29 
 
 		 260 aa  195  5.000000000000001e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0220  hypothetical protein  45.92 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0639  hypothetical protein  44.62 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0484381 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0679  Alpha/beta hydrolase  38.08 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0687  alpha/beta hydrolase fold  47.5 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1340  hypothetical protein  39.41 
 
 		 259 aa  188  8e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0340  hypothetical protein  43.93 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1622  hypothetical protein  43.37 
 
 		 271 aa  188  9e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0067083 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0208  alpha/beta hydrolase  46.38 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4230  hypothetical protein  45.38 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00845825 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1904  hypothetical protein  42.57 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.490792 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3482  hypothetical protein  39.32 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00930264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2757  hypothetical protein  44.67 
 
 		 244 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0472  putative hydrolase  41.87 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.465833  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0199  hypothetical protein  39.66 
 
 		 269 aa  178  9e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3160  hypothetical protein  40.49 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.254415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4740  hypothetical protein  46.67 
 
 		 252 aa  175  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.268463  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1614  alpha/beta hydrolase fold  46.05 
 
 		 265 aa  175  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0433205  decreased coverage  0.000315383 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4531  putative hydrolase protein  37.89 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213453 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4266  putative hydrolase protein  38.71 
 
 		 274 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  30.66 
 
 		 276 aa  98.6  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  30.66 
 
 		 276 aa  98.6  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  27.44 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5429  OsmC family protein  29.73 
 
 		 397 aa  65.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  26.72 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1777  OsmC-like protein  31.43 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0113862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.1 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5143  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3422  hydrolase-like protein  29.63 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1174  hypothetical protein  25.19 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  28.7 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3394  hypothetical protein  26.96 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.689408  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3182  alpha/beta hydrolase fold  32.46 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1347  putative lipase  29.06 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0453  hypothetical protein  28.57 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.629046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3452  hypothetical protein  26.32 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.281711  normal  0.0529388 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02720  conserved hypothetical protein  23.4 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.539212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7018  OsmC family protein  33.59 
 
 		 412 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716876 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  26.7 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  29.77 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.37 
 
 		 370 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0226  hypothetical protein  28.88 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  23.74 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2658  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  26.6 
 
 		 642 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55127  normal  0.367777 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.09 
 
 		 374 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  31.53 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  32.11 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000690683  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  32.11 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0929  putative hydrolase  28.23 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.08 
 
 		 369 aa  53.1  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0819  hypothetical protein  27.43 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  26.58 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  31.22 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  34.23 
 
 		 311 aa  53.1  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07233  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06650)  27.47 
 
 		 298 aa  52.8  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0390188  normal  0.0838788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 		 397 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 		 282 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.04 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 		 324 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0941  OsmC family protein  33.33 
 
 		 409 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.3755  normal  0.451532 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.04 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412012  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.04 
 
 		 371 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  25.52 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5068  hypothetical protein  26.39 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0775486  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  38.05 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1013  OsmC-like protein  29.86 
 
 		 423 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.325781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.38 
 
 		 371 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>