More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1480 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1480  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.453748  normal  0.0388864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1439  hypothetical protein  98.23 
 
 		 282 aa  570  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.553076  normal  0.0119632 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1848  hypothetical protein  89.72 
 
 		 277 aa  517  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.111284 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1767  hypothetical protein  91.79 
 
 		 268 aa  508  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.546797  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1413  hypothetical protein  87.59 
 
 		 281 aa  494  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0310  hypothetical protein  64.68 
 
 		 253 aa  349  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5988  class II aldolase/adducin family protein  55.35 
 
 		 271 aa  309  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  63.05 
 
 		 263 aa  308  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3283  hypothetical protein  58.54 
 
 		 260 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.347419  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2788  hypothetical protein  62.04 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2661  class II aldolase/adducin family protein  53.57 
 
 		 280 aa  285  4e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2693  hypothetical protein  53.6 
 
 		 259 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1979  hypothetical protein  54.62 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08496  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01330)  54.48 
 
 		 301 aa  279  4e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.795367 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  51.6 
 
 		 274 aa  278  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5234  hypothetical protein  57.55 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379746  normal  0.233824 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1547  hypothetical protein  56.15 
 
 		 274 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0795  hypothetical protein  49.29 
 
 		 271 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3679  hypothetical protein  56.63 
 
 		 281 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.299985  normal  0.942836 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4335  hypothetical protein  57.03 
 
 		 279 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal  0.36527 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10226  conserved hypothetical protein  56.54 
 
 		 301 aa  267  1e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000482899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4152  hypothetical protein  56.22 
 
 		 281 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208443 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4460  hypothetical protein  51.44 
 
 		 279 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.236851  normal  0.370588 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4594  hypothetical protein  51.44 
 
 		 279 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3262  hypothetical protein  55.82 
 
 		 279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4111  hypothetical protein  55.82 
 
 		 279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4255  hypothetical protein  55.82 
 
 		 279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00200389  normal  0.282334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1756  hypothetical protein  55.02 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.719747  normal  0.0346427 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2332  hypothetical protein  49.03 
 
 		 268 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4082  hypothetical protein  50.39 
 
 		 280 aa  258  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32146  aldolase  50.2 
 
 		 298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.943174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3892  hypothetical protein  48.63 
 
 		 286 aa  250  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4868  hypothetical protein  45.58 
 
 		 287 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  0.305277 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1545  hypothetical protein  46.85 
 
 		 279 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.245275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2516  hypothetical protein  52.31 
 
 		 326 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05007  class II aldolase/adducin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G09800)  49.59 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2655  class II aldolase/adducin family protein  42.15 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43970  class II aldolase protein  45.35 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.748623  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0233  hypothetical protein  41.96 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  41.86 
 
 		 256 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  37.45 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  36.03 
 
 		 268 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  36.89 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  38.12 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  39.72 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  37.02 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  38.79 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  37.3 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  34.5 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04605  conserved hypothetical protein  47.09 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  42.23 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  33.58 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  37.61 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  38.96 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  35.62 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  34.69 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  39.9 
 
 		 261 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  42.02 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  37.33 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  41.18 
 
 		 263 aa  145  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  35.06 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  34.68 
 
 		 263 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  34.68 
 
 		 263 aa  145  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  42.02 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  35.42 
 
 		 262 aa  143  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  36.49 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  38.92 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  37.76 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  37.92 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  35.06 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  37.44 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  35.47 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  37.61 
 
 		 257 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  37.45 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  36.12 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  41.18 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  36.47 
 
 		 258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  37.24 
 
 		 251 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  37.01 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  35.81 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  33.58 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  33.2 
 
 		 256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  37.5 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  35.02 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  35.25 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  34.15 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  39.44 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  32.63 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  36.97 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  32.22 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  37.61 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  34.84 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  34.84 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  37.44 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  35.59 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  36.49 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  36.49 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  34.15 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  34.15 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  31.74 
 
 		 254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>