241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4899 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  427  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  86.83 
 
 		 205 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  85.37 
 
 		 205 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  76.59 
 
 		 208 aa  338  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  69.8 
 
 		 207 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  66.18 
 
 		 205 aa  287  8e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  64.18 
 
 		 207 aa  284  7e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  63.68 
 
 		 209 aa  278  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  62.14 
 
 		 207 aa  274  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  61.65 
 
 		 207 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  62.56 
 
 		 209 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  62.38 
 
 		 206 aa  269  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  60.4 
 
 		 209 aa  265  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  59.7 
 
 		 230 aa  262  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  60.2 
 
 		 206 aa  262  3e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  61.69 
 
 		 201 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  59.7 
 
 		 210 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  60.7 
 
 		 201 aa  257  7e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  60.2 
 
 		 201 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  58.91 
 
 		 202 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  58.13 
 
 		 205 aa  254  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  59.2 
 
 		 201 aa  251  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  60.7 
 
 		 212 aa  251  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  56.86 
 
 		 206 aa  251  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  59.8 
 
 		 209 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  56.16 
 
 		 218 aa  251  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  59.8 
 
 		 209 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  59.8 
 
 		 209 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  58.25 
 
 		 208 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  59.8 
 
 		 209 aa  250  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  58.25 
 
 		 208 aa  250  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  58.33 
 
 		 208 aa  249  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  59.3 
 
 		 209 aa  248  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  57.28 
 
 		 221 aa  248  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  59.3 
 
 		 209 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  57.84 
 
 		 208 aa  248  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  57.29 
 
 		 209 aa  248  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  59.8 
 
 		 210 aa  248  6e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  57.77 
 
 		 208 aa  247  9e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  57.28 
 
 		 208 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  57.5 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  57.84 
 
 		 208 aa  245  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  55.61 
 
 		 208 aa  245  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  55.67 
 
 		 209 aa  243  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  56.93 
 
 		 207 aa  242  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  57.43 
 
 		 221 aa  235  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  54.19 
 
 		 205 aa  228  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  56.28 
 
 		 216 aa  227  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  56.57 
 
 		 203 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  52.74 
 
 		 184 aa  222  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  52.22 
 
 		 209 aa  222  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  53.76 
 
 		 202 aa  207  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  48.77 
 
 		 207 aa  205  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  50.98 
 
 		 202 aa  205  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  51 
 
 		 212 aa  190  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  46.15 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  65.62 
 
 		 140 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  45.23 
 
 		 203 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  46.67 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  46.46 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  46.46 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  43.9 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.16 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  43.94 
 
 		 203 aa  168  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  43.72 
 
 		 194 aa  165  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  43.37 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  43.37 
 
 		 209 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  43.43 
 
 		 203 aa  165  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  43.94 
 
 		 194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  43.72 
 
 		 194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  44.79 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.31 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  44.66 
 
 		 201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  40.93 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  41.46 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  45.93 
 
 		 241 aa  153  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  42.51 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  41.12 
 
 		 230 aa  147  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  41.12 
 
 		 230 aa  147  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  40.39 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  38.35 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  36.59 
 
 		 220 aa  128  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  36.87 
 
 		 292 aa  126  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.92 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  37.17 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  39.39 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3276  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.57 
 
 		 295 aa  122  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  36.89 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.77 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  36.27 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2631  hypothetical protein  40.36 
 
 		 221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.300035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  41.77 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  38.28 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  32.98 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.3 
 
 		 294 aa  116  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.41 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0500  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.15 
 
 		 294 aa  114  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  35.64 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  35.03 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  42.38 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>