183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1546 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  100 
 
 		 426 aa  807    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  26.72 
 
 		 259 aa  92.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  26.75 
 
 		 258 aa  89  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  25.69 
 
 		 258 aa  88.2  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  27.16 
 
 		 289 aa  89  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  26.59 
 
 		 256 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  26.59 
 
 		 256 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  25.69 
 
 		 267 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  26.59 
 
 		 256 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  26.59 
 
 		 256 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  26.69 
 
 		 274 aa  87.4  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  24.44 
 
 		 303 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  26.59 
 
 		 277 aa  87  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  26.59 
 
 		 277 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  26.59 
 
 		 277 aa  86.7  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  24.44 
 
 		 314 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  24.06 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  24.06 
 
 		 314 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  24.06 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  27.65 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  26.59 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  26.72 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  26.54 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  24.63 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  25 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  26.27 
 
 		 268 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  25 
 
 		 260 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  24.54 
 
 		 266 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  27.39 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  32.48 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  32.48 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  36.17 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  29.34 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  26.94 
 
 		 266 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  36.03 
 
 		 156 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  27.27 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  36.17 
 
 		 155 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  26.15 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  25.26 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  27.03 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  34.75 
 
 		 157 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  34.75 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  35.46 
 
 		 163 aa  73.9  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2957  putative integral membrane protein  29.08 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.646912 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  24.69 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  32.84 
 
 		 161 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  32.14 
 
 		 261 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  34.56 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  30.86 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  34.56 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  27.58 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  24.36 
 
 		 258 aa  69.3  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  30.94 
 
 		 157 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2596  hypothetical protein  30.99 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.517735  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  34.56 
 
 		 155 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  33.82 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  33.82 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  33.82 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  33.82 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  30.99 
 
 		 171 aa  67  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  32.73 
 
 		 159 aa  67  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  34.04 
 
 		 153 aa  67  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  32.09 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  25.51 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2003  hypothetical protein  29.46 
 
 		 150 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477013 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  30.58 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  23.98 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  30.71 
 
 		 174 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  25.82 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  30.99 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  27.16 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  23.87 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  23.58 
 
 		 256 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1710  hypothetical protein  23.79 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000260322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  28.68 
 
 		 253 aa  62  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  30.99 
 
 		 164 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  23.65 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  61.2  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1291  hypothetical protein  30.37 
 
 		 154 aa  61.6  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.762277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  22.51 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  29.1 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  28.28 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  28.28 
 
 		 156 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  23.73 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  23.87 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0908  hypothetical protein  26.16 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000100336  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1965  ThrE family exporter, small subunit  27.61 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3634  conserved hypothetical protein  28.37 
 
 		 157 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5876  hypothetical protein  28.37 
 
 		 157 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4908  hypothetical protein  28.37 
 
 		 155 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  31.94 
 
 		 156 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  24.85 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  23.4 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  30.77 
 
 		 156 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  24.28 
 
 		 253 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  24.86 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>