More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4158 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  71.19 
 
 		 549 aa  758    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4158  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 556 aa  1103    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2629  signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 788 aa  214  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0221  anti-sigma-factor antagonist  62.5 
 
 		 366 aa  184  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  54.55 
 
 		 361 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  57.14 
 
 		 361 aa  172  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  44.31 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  44.35 
 
 		 357 aa  167  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2322  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 		 521 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0179  anti-sigma-factor antagonist  56.58 
 
 		 359 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00135922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4153  anti-sigma-factor antagonist  44.93 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.893474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2421  anti-sigma-factor antagonist  33.62 
 
 		 523 aa  153  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  47.59 
 
 		 385 aa  148  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0135  anti-sigma-factor antagonist  46.95 
 
 		 371 aa  147  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2566  anti-sigma-factor antagonist  47.25 
 
 		 362 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1894  anti-sigma-factor antagonist  43.4 
 
 		 344 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0373  anti-sigma-factor antagonist  46.88 
 
 		 365 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  48.41 
 
 		 388 aa  140  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 568 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  47.06 
 
 		 385 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  38.62 
 
 		 559 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0268  anti-sigma-factor antagonist  48.34 
 
 		 363 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0598617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4698  anti-sigma-factor antagonist  48.45 
 
 		 363 aa  134  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5196  anti-sigma-factor antagonist  43.02 
 
 		 365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.476105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3649  anti-sigma-factor antagonist  44.32 
 
 		 361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  47.77 
 
 		 377 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  47.65 
 
 		 372 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4325  anti-sigma-factor antagonist  42.04 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0978917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3609  anti-sigma-factor antagonist  35.74 
 
 		 411 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.196503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3473  anti-sigma-factor antagonist  39.41 
 
 		 422 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.551903  normal  0.0822697 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  48.63 
 
 		 509 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  45.75 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2210  anti-sigma-factor antagonist  30.11 
 
 		 580 aa  125  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2206  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 367 aa  124  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1856  anti-sigma-factor antagonist  44.31 
 
 		 365 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.616563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  45.21 
 
 		 388 aa  118  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  44.53 
 
 		 290 aa  117  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  44.22 
 
 		 357 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  44.9 
 
 		 428 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  37.78 
 
 		 291 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  48.46 
 
 		 430 aa  114  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 		 293 aa  113  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 		 281 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  47.46 
 
 		 667 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2660  anti-sigma-factor antagonist  42.66 
 
 		 359 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  38.15 
 
 		 272 aa  111  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  44.38 
 
 		 439 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  43.05 
 
 		 315 aa  110  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  42.38 
 
 		 306 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  43.66 
 
 		 653 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1485  anti-sigma-factor antagonist  39.41 
 
 		 367 aa  107  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2296  anti-sigma-factor antagonist  35.12 
 
 		 342 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0948081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  46.15 
 
 		 424 aa  107  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  44.03 
 
 		 445 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  40 
 
 		 325 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3476  anti-sigma-factor antagonist  39.78 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.837777  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  46.46 
 
 		 638 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4191  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 		 372 aa  105  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  42.86 
 
 		 275 aa  104  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  42.65 
 
 		 312 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 		 549 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  38.81 
 
 		 315 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  42.06 
 
 		 538 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  36.42 
 
 		 288 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4490  anti-sigma-factor antagonist  25.63 
 
 		 511 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.30603  decreased coverage  0.000741245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  41.13 
 
 		 288 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  42.34 
 
 		 271 aa  100  9e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 295 aa  99.8  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  44.17 
 
 		 271 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0116  anti-sigma-factor antagonist  44.29 
 
 		 357 aa  99.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00357246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  46.36 
 
 		 562 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  37.18 
 
 		 689 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  40.69 
 
 		 653 aa  98.6  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  42.31 
 
 		 694 aa  98.6  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  34.64 
 
 		 370 aa  97.8  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  41.8 
 
 		 295 aa  98.2  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1810  anti-sigma-factor antagonist  35.59 
 
 		 252 aa  97.4  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  43.22 
 
 		 323 aa  97.1  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  44.96 
 
 		 286 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  38.52 
 
 		 279 aa  96.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  41.8 
 
 		 285 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  41.96 
 
 		 286 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4422  putative PAS/PAC sensor protein  40.32 
 
 		 492 aa  96.7  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2793  anti-sigma-factor antagonist  42.24 
 
 		 272 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  35.19 
 
 		 271 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  35.07 
 
 		 510 aa  95.1  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5229  anti-sigma-factor antagonist  44.54 
 
 		 291 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3339  anti-sigma-factor antagonist  44.54 
 
 		 292 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  41.53 
 
 		 288 aa  94.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  41.53 
 
 		 288 aa  94  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  35.43 
 
 		 231 aa  94  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  40.98 
 
 		 284 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  35.29 
 
 		 294 aa  93.6  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1316  anti-sigma-factor antagonist  42.96 
 
 		 284 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 890 aa  93.6  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  40.52 
 
 		 287 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  40 
 
 		 286 aa  92.8  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  39.17 
 
 		 283 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0512  anti-sigma-factor antagonist  43.7 
 
 		 292 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>