143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0421 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  64.52 
 
 
778 aa  762    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  64.47 
 
 
776 aa  755    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  64.04 
 
 
784 aa  759    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  100 
 
 
837 aa  1632    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  67.33 
 
 
792 aa  787    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  72.22 
 
 
553 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  40.8 
 
 
821 aa  419  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  39.59 
 
 
818 aa  393  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  37.89 
 
 
1187 aa  396  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  37.81 
 
 
1207 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  36.1 
 
 
743 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  39.44 
 
 
717 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  38.08 
 
 
2082 aa  323  7e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  39.66 
 
 
714 aa  309  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  33.04 
 
 
911 aa  307  7e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  54.42 
 
 
376 aa  297  5e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  55.1 
 
 
554 aa  293  8e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  51.09 
 
 
389 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  48.07 
 
 
561 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  49.48 
 
 
560 aa  267  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  47 
 
 
563 aa  260  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  42.55 
 
 
835 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  48.79 
 
 
569 aa  259  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  34.02 
 
 
1222 aa  252  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  46.96 
 
 
579 aa  251  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  45.62 
 
 
551 aa  249  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  47.24 
 
 
555 aa  248  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  47.8 
 
 
477 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  52.6 
 
 
546 aa  243  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  44.81 
 
 
558 aa  240  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  45.74 
 
 
553 aa  238  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  28.77 
 
 
1919 aa  236  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  47.4 
 
 
555 aa  236  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  41.27 
 
 
554 aa  231  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  48.6 
 
 
567 aa  231  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  42.77 
 
 
593 aa  231  6e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  45.7 
 
 
556 aa  230  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  44.74 
 
 
570 aa  226  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  44.03 
 
 
681 aa  222  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  44.62 
 
 
577 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  35.65 
 
 
469 aa  218  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  40.41 
 
 
941 aa  216  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4027  regulator of chromosome condensation RCC1  40.37 
 
 
638 aa  216  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  37.86 
 
 
787 aa  215  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.33 
 
 
417 aa  211  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  37.88 
 
 
1129 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2677  regulator of chromosome condensation RCC1  42.51 
 
 
544 aa  207  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0824266  normal  0.249754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0168  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  37.78 
 
 
817 aa  207  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.638374 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  40.1 
 
 
443 aa  204  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  37.57 
 
 
449 aa  204  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.25 
 
 
706 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  47.21 
 
 
566 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4451  serine/threonine protein kinase  37.65 
 
 
745 aa  197  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  40 
 
 
558 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  39.47 
 
 
1848 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  34.94 
 
 
461 aa  196  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4142  regulator of chromosome condensation RCC1  33.86 
 
 
575 aa  195  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  33.61 
 
 
363 aa  195  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  33.61 
 
 
363 aa  195  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.15 
 
 
1679 aa  193  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  37.33 
 
 
810 aa  193  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  37.47 
 
 
1147 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2856  BNR repeat-containing protein  37.6 
 
 
447 aa  187  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  25.52 
 
 
807 aa  183  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  33.78 
 
 
535 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  39.19 
 
 
602 aa  181  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  32.33 
 
 
461 aa  180  9e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1045  BNR repeat-containing protein  37.99 
 
 
454 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331835  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  37.4 
 
 
403 aa  174  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  41.16 
 
 
618 aa  167  5.9999999999999996e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.28 
 
 
1126 aa  167  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  36.69 
 
 
726 aa  154  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.53 
 
 
921 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3514  BNR repeat-containing protein  33.99 
 
 
396 aa  139  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  37.73 
 
 
737 aa  139  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  24.83 
 
 
728 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  29.66 
 
 
900 aa  135  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_3182  predicted protein  29.97 
 
 
341 aa  131  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3425  regulator of chromosome condensation RCC1  30.53 
 
 
450 aa  127  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  34.43 
 
 
624 aa  125  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0835  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.14 
 
 
454 aa  125  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000342625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.51 
 
 
692 aa  124  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  31.75 
 
 
547 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2961  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  41.45 
 
 
326 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.462703  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  31.55 
 
 
597 aa  120  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  32.7 
 
 
14609 aa  119  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0016  regulator of chromosome condensation, RCC1  50 
 
 
209 aa  108  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_36955  predicted protein  29.92 
 
 
418 aa  106  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.000048809  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1358  hypothetical protein  28.68 
 
 
375 aa  104  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  32.93 
 
 
328 aa  101  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  28.92 
 
 
533 aa  97.8  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1230  regulator of chromosome condensation  26.64 
 
 
558 aa  97.8  7e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  29.53 
 
 
499 aa  96.7  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_48985  predicted protein  27.97 
 
 
547 aa  94.4  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_2338  predicted protein  29.65 
 
 
399 aa  94  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.244715  decreased coverage  0.000248727 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28035  predicted protein  31.48 
 
 
371 aa  94  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00114793  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04720  pim1 protein (poly(a)+ RNA transport protein 2), putative  28.1 
 
 
590 aa  85.5  0.000000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  36.02 
 
 
307 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  28.57 
 
 
643 aa  85.9  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_45032  predicted protein  28.06 
 
 
1312 aa  85.1  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>