More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0119 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 599 aa  1174    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  61 
 
 		 586 aa  655    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3320  DNA repair protein RecN  60.88 
 
 		 587 aa  677    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  87.39 
 
 		 601 aa  1013    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  42.66 
 
 		 577 aa  435  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  39.35 
 
 		 573 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  36.29 
 
 		 566 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  37.39 
 
 		 570 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  38.01 
 
 		 588 aa  387  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 567 aa  384  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  37.42 
 
 		 588 aa  380  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  38.26 
 
 		 579 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  38.31 
 
 		 579 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  38.97 
 
 		 579 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  38.8 
 
 		 573 aa  379  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  38.31 
 
 		 579 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  40 
 
 		 565 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  39.08 
 
 		 574 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  38.24 
 
 		 557 aa  379  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  38.14 
 
 		 579 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  38.14 
 
 		 583 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  38.31 
 
 		 579 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  37.97 
 
 		 579 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  38.14 
 
 		 583 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  37.97 
 
 		 579 aa  375  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  39.02 
 
 		 554 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  38.31 
 
 		 579 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  37.35 
 
 		 588 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  38.95 
 
 		 580 aa  363  4e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  38.51 
 
 		 578 aa  361  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  39.04 
 
 		 555 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  39.45 
 
 		 558 aa  355  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 		 565 aa  353  4e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  42.03 
 
 		 558 aa  353  7e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  34.08 
 
 		 565 aa  351  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  36.72 
 
 		 562 aa  349  9e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1178  DNA repair protein RecN  34.99 
 
 		 559 aa  348  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000946399  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  39.9 
 
 		 560 aa  345  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  38.59 
 
 		 554 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  38.62 
 
 		 553 aa  339  7e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  37.93 
 
 		 560 aa  338  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  38.38 
 
 		 553 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  35.56 
 
 		 565 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  32.25 
 
 		 574 aa  337  5e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  38.08 
 
 		 560 aa  334  3e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0930  ATPase for DNA repair  34.89 
 
 		 555 aa  333  5e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  36.76 
 
 		 556 aa  330  3e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  34.28 
 
 		 561 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1599  DNA repair ATPase  35.83 
 
 		 555 aa  327  3e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  39.25 
 
 		 556 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0501  DNA repair protein RecN  35.42 
 
 		 552 aa  327  5e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.424659  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1179  DNA repair and genetic recombination protein  34.62 
 
 		 556 aa  325  1e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  33.9 
 
 		 562 aa  321  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1031  DNA repair protein RecN  38.89 
 
 		 572 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  37.41 
 
 		 553 aa  317  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  35.1 
 
 		 572 aa  317  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  34.02 
 
 		 558 aa  313  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  36.55 
 
 		 556 aa  310  4e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  35.82 
 
 		 572 aa  310  5.9999999999999995e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1394  DNA repair protein RecN  38.93 
 
 		 551 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  34.6 
 
 		 559 aa  306  7e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  35.56 
 
 		 574 aa  306  8.000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  34.93 
 
 		 559 aa  306  8.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  32.76 
 
 		 559 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  32.76 
 
 		 559 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2236  DNA repair protein RecN  34.05 
 
 		 582 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.48735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  34.86 
 
 		 567 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1301  DNA repair protein RecN  34.09 
 
 		 561 aa  304  4.0000000000000003e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  34.36 
 
 		 605 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  34.66 
 
 		 569 aa  301  2e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  33.5 
 
 		 567 aa  297  3e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  35.23 
 
 		 557 aa  297  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1104  recombination and repair protein  33.28 
 
 		 552 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.562592 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3462  recombination and repair protein  32.99 
 
 		 552 aa  295  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2475  recombination and repair protein  30.22 
 
 		 565 aa  294  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1170  recombination and repair protein  33.28 
 
 		 552 aa  294  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1104  recombination and repair protein  33.1 
 
 		 552 aa  294  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.239344  normal  0.154382 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  34.82 
 
 		 557 aa  294  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0644  DNA repair protein RecN  35.51 
 
 		 592 aa  293  8e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.659362  normal  0.0659728 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3647  DNA repair protein RecN  33.22 
 
 		 575 aa  292  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  35.42 
 
 		 558 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004296  DNA repair protein RecN  31.83 
 
 		 554 aa  292  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.782069  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1612  DNA repair protein RecN  35.26 
 
 		 573 aa  291  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.458504 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01130  recombination and repair protein  31.83 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  33.45 
 
 		 556 aa  291  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1904  DNA repair protein RecN  35.84 
 
 		 564 aa  291  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1043  recombination and repair protein  32.59 
 
 		 552 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2171  DNA repair protein RecN  35.95 
 
 		 575 aa  289  1e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00879264  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.12 
 
 		 555 aa  289  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0426  DNA repair protein RecN  31.79 
 
 		 553 aa  288  2e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  34.86 
 
 		 558 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  35.54 
 
 		 557 aa  286  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.71 
 
 		 557 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  31.64 
 
 		 551 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  35.56 
 
 		 557 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2706  DNA repair protein RecN  30.52 
 
 		 552 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  35.03 
 
 		 558 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  36.64 
 
 		 569 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2032  DNA repair protein RecN  35.95 
 
 		 567 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1245  DNA repair protein RecN  36.75 
 
 		 592 aa  283  9e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.790366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>