More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5890 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  54.09 
 
 		 636 aa  650    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3948  ferrous iron transport protein B  74.1 
 
 		 621 aa  870    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  75.45 
 
 		 621 aa  879    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6110  ferrous iron transport protein B  58.02 
 
 		 625 aa  635    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.218757  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5429  ferrous iron transport B domain-containing protein  82.74 
 
 		 617 aa  974    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00098  ferrous iron transport protein B  64.79 
 
 		 621 aa  790    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.069629  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  57.49 
 
 		 626 aa  663    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4061  ferrous iron transport protein B  74.1 
 
 		 621 aa  870    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  57.67 
 
 		 626 aa  672    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  64.89 
 
 		 647 aa  755    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  56.66 
 
 		 615 aa  677    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  65.29 
 
 		 633 aa  774    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  57.92 
 
 		 626 aa  683    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0064  ferrous iron transport protein B  60.93 
 
 		 628 aa  674    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.956131  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  58.55 
 
 		 637 aa  693    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  58.12 
 
 		 626 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  56.63 
 
 		 626 aa  661    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  100 
 
 		 620 aa  1241    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  64.59 
 
 		 617 aa  767    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  57.37 
 
 		 637 aa  681    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  64.26 
 
 		 617 aa  750    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  66.67 
 
 		 621 aa  813    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  58.82 
 
 		 625 aa  664    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1161  ferrous iron transport protein B  64.98 
 
 		 632 aa  754    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.233706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1471  transport protein B  61.98 
 
 		 629 aa  712    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.684623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1443  ferrous iron transport protein B  68.2 
 
 		 631 aa  756    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0983772  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  52.27 
 
 		 618 aa  600  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  54.88 
 
 		 621 aa  595  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2987  ferrous iron transport protein B  55.56 
 
 		 619 aa  580  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  37.22 
 
 		 711 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  40.05 
 
 		 753 aa  451  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  35.67 
 
 		 700 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  39.26 
 
 		 705 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  37.14 
 
 		 699 aa  422  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  36.56 
 
 		 665 aa  421  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  35.45 
 
 		 696 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  40.06 
 
 		 618 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  35.87 
 
 		 699 aa  393  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  37.01 
 
 		 722 aa  384  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  34.68 
 
 		 587 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2011  GTP-binding protein, HSR1-related  39.64 
 
 		 648 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  34.78 
 
 		 631 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  34.68 
 
 		 587 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  36.17 
 
 		 676 aa  369  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  34.67 
 
 		 665 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  34.26 
 
 		 688 aa  369  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  35.21 
 
 		 631 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  33.77 
 
 		 716 aa  359  8e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  33.93 
 
 		 669 aa  359  9e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  33.63 
 
 		 667 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  48.07 
 
 		 716 aa  354  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  34.92 
 
 		 676 aa  353  4e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  33.82 
 
 		 662 aa  349  8e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  33.68 
 
 		 662 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  33.68 
 
 		 662 aa  348  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  33.53 
 
 		 662 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  33.68 
 
 		 662 aa  346  6e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  33.53 
 
 		 662 aa  345  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  33.09 
 
 		 664 aa  345  2e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  34.25 
 
 		 628 aa  344  2e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  33.53 
 
 		 662 aa  345  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  33.77 
 
 		 668 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1583  ferrous iron transport protein B  31.73 
 
 		 698 aa  343  8e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.983768  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  30.75 
 
 		 711 aa  342  9e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  34.44 
 
 		 649 aa  342  2e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  35.03 
 
 		 712 aa  340  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  32.84 
 
 		 691 aa  339  8e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0966  ferrous iron transport protein B  32.01 
 
 		 669 aa  338  1.9999999999999998e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  34.01 
 
 		 684 aa  336  5.999999999999999e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  33.13 
 
 		 646 aa  335  1e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  31.9 
 
 		 606 aa  330  6e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  33.77 
 
 		 597 aa  329  8e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  30.69 
 
 		 669 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  30.26 
 
 		 669 aa  329  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  32.47 
 
 		 712 aa  324  3e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  32.31 
 
 		 662 aa  324  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  34.05 
 
 		 848 aa  323  6e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  31.32 
 
 		 721 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  32.06 
 
 		 662 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  32.94 
 
 		 662 aa  319  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  31.62 
 
 		 662 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  30.22 
 
 		 753 aa  317  4e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  30.5 
 
 		 749 aa  315  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  31.71 
 
 		 784 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  30.78 
 
 		 647 aa  310  4e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  37.5 
 
 		 712 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0654  ferrous iron transport protein B  36.28 
 
 		 693 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  30.76 
 
 		 740 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  40.54 
 
 		 844 aa  305  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  36.01 
 
 		 778 aa  305  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  32.89 
 
 		 664 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0441  ferrous iron transport protein B  30.06 
 
 		 700 aa  304  3.0000000000000004e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3707  ferrous iron transport protein B  34.9 
 
 		 772 aa  303  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  34.9 
 
 		 772 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3813  ferrous iron transport protein B  34.9 
 
 		 772 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3779  ferrous iron transport protein B  35.14 
 
 		 772 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0304  ferrous iron transport protein B  35.39 
 
 		 773 aa  302  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  30.55 
 
 		 715 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  35.28 
 
 		 711 aa  302  2e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3704  ferrous iron transport protein B  34.9 
 
 		 772 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>