More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2457 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  100 
 
 		 303 aa  614  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  87.79 
 
 		 325 aa  518  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  76.3 
 
 		 320 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  75.97 
 
 		 320 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  74.68 
 
 		 321 aa  461  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  71.76 
 
 		 304 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  71.1 
 
 		 304 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  69.21 
 
 		 351 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  68.87 
 
 		 320 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  69.21 
 
 		 351 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  68.87 
 
 		 326 aa  434  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  68.87 
 
 		 304 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  68.21 
 
 		 304 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  69.21 
 
 		 306 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  67.88 
 
 		 373 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  69.21 
 
 		 304 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  69.21 
 
 		 304 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  68.21 
 
 		 344 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  68.21 
 
 		 304 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  68.21 
 
 		 304 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  69.21 
 
 		 304 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  69.21 
 
 		 304 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  71.1 
 
 		 304 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  62.25 
 
 		 355 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  61.59 
 
 		 304 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  61.59 
 
 		 314 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  61 
 
 		 304 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  58.67 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  58.92 
 
 		 342 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  59.16 
 
 		 323 aa  358  7e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  60.47 
 
 		 308 aa  356  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  60.2 
 
 		 327 aa  355  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  57.95 
 
 		 307 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  56.49 
 
 		 314 aa  351  8.999999999999999e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  56.35 
 
 		 313 aa  345  4e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  56.25 
 
 		 312 aa  339  4e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  57.62 
 
 		 322 aa  337  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  60.47 
 
 		 301 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  56.91 
 
 		 315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  52 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  57 
 
 		 310 aa  314  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  55.29 
 
 		 311 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  51.83 
 
 		 309 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  50.83 
 
 		 302 aa  300  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  48.15 
 
 		 312 aa  283  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  50.33 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  50.33 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  49.5 
 
 		 311 aa  278  9e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  45.72 
 
 		 310 aa  266  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  45.72 
 
 		 310 aa  265  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  46.3 
 
 		 311 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  45.72 
 
 		 306 aa  265  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.38 
 
 		 317 aa  265  8e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  47.37 
 
 		 332 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  45.31 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  45.95 
 
 		 293 aa  263  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  46.35 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  47.08 
 
 		 303 aa  261  6.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  44.63 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  43.19 
 
 		 305 aa  256  4e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  44.19 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  45.39 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  42.16 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  46.64 
 
 		 340 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  45.57 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  43.28 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  41.31 
 
 		 305 aa  229  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  42.52 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  41.91 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.71 
 
 		 312 aa  218  8.999999999999998e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  40.32 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  40.07 
 
 		 294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.23 
 
 		 322 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.94 
 
 		 316 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  39.74 
 
 		 282 aa  212  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  39.67 
 
 		 316 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  41.22 
 
 		 279 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  40.65 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.33 
 
 		 279 aa  209  7e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.41 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.67 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.88 
 
 		 320 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.22 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  41.39 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  36.39 
 
 		 308 aa  205  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.5 
 
 		 329 aa  205  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  40.63 
 
 		 315 aa  205  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.58 
 
 		 324 aa  205  7e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.27 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5171  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.99 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  35.26 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.03 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.51 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  38.28 
 
 		 335 aa  202  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.14 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  39.67 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  35.26 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.22 
 
 		 312 aa  202  7e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  35.58 
 
 		 312 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  35.58 
 
 		 312 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>