More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2519 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2519  protein of unknown function UPF0079  100 
 
 		 159 aa  318  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2319  hypothetical protein  53.38 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0216  protein of unknown function UPF0079  56.59 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2888  hypothetical protein  52.86 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000829466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1263  protein of unknown function UPF0079  50 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204178  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1097  protein of unknown function UPF0079  59.52 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0399  hypothetical protein  55.38 
 
 		 152 aa  137  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0100312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0244  hypothetical protein  54.2 
 
 		 157 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0258  hypothetical protein  54.2 
 
 		 157 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0230  hypothetical protein  54.2 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0284  conserved hypothetical protein TIGR00150  54.2 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0232  P-loop hydrolase  54.2 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0289  conserved hypothetical protein TIGR00150  53.85 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0243  hypothetical protein  53.08 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0236  hypothetical protein  52.67 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000721135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0308  conserved hypothetical protein TIGR00150  53.44 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0279  hypothetical protein  53.44 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3020  protein of unknown function UPF0079  55.04 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0147  protein of unknown function UPF0079  53.54 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0643293  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1776  hypothetical protein  50 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00431445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2160  hypothetical protein  53.44 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258956 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5035  hypothetical protein  53.08 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2016  hypothetical protein  50 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2422  hypothetical protein  47.01 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2132  hypothetical protein  47.01 
 
 		 154 aa  130  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1005  hypothetical protein  50.68 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000601093  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0799  protein of unknown function UPF0079  48.91 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0604779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2261  hypothetical protein  44.9 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000158801  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3739  protein of unknown function UPF0079  55.83 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.124017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0488  hypothetical protein  52.54 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.381265  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0346  hypothetical protein  51.15 
 
 		 143 aa  124  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0375  hypothetical protein  47.41 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128461  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2364  protein of unknown function UPF0079  54.1 
 
 		 183 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1881  hypothetical protein  46.38 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000937898  hitchhiker  0.0000223198 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1503  hypothetical protein  54.1 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170985  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0483  protein of unknown function UPF0079  47.01 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.790809  normal  0.0607901 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_339  hypothetical protein  45.99 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00581672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0713  hypothetical protein  47.79 
 
 		 187 aa  120  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273172  normal  0.667416 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2855  protein of unknown function UPF0079  47.52 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.314957 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2452  protein of unknown function UPF0079  53.28 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19780  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  46.67 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0805781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0399  protein of unknown function UPF0079  50 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0207503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4283  protein of unknown function UPF0079  40 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4357  hypothetical protein  47.52 
 
 		 189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282412 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1469  hypothetical protein  53.21 
 
 		 143 aa  117  7.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2530  protein of unknown function UPF0079  46.27 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000117314  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0396  hypothetical protein  45.19 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0617  protein of unknown function UPF0079  43.08 
 
 		 150 aa  115  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.202797  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0444  protein of unknown function UPF0079  43.41 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2330  hypothetical protein  50.88 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2169  hypothetical protein  48.03 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.884354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1800  hypothetical protein  47.93 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.009423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01950  conserved hypothetical nucleotide-binding protein TIGR00150  42.22 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1243  protein of unknown function UPF0079  45.26 
 
 		 184 aa  110  8.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6124  protein of unknown function UPF0079  46.62 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0433891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0965  protein of unknown function UPF0079  41.35 
 
 		 156 aa  107  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4975  hypothetical protein  38.3 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1635  protein of unknown function UPF0079  42.54 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0182  protein of unknown function UPF0079  41.41 
 
 		 148 aa  105  3e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0313363  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0100  protein of unknown function UPF0079  42.11 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0009157  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0046  protein of unknown function UPF0079  41.43 
 
 		 174 aa  104  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2531  hypothetical protein  45.83 
 
 		 162 aa  104  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4455  hypothetical protein  46.56 
 
 		 152 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4849  hypothetical protein  45.67 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0927  hypothetical protein  37.68 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.641059 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2089  hypothetical protein  41.03 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.38888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2639  protein of unknown function UPF0079  49.15 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.266416 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2126  hypothetical protein  41.03 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3438  hypothetical protein  48.33 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0159853  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0408  hypothetical protein  36.43 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2955  hypothetical protein  47.52 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263755  normal  0.0249448 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0122  protein of unknown function UPF0079  40.97 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000147481  hitchhiker  0.00840651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0090  protein of unknown function UPF0079  40.15 
 
 		 145 aa  100  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.184225  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0814  protein of unknown function UPF0079  40.91 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2666  hypothetical protein  39.55 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0641125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0134  protein of unknown function UPF0079  40.6 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1390  protein of unknown function UPF0079  43.48 
 
 		 167 aa  98.2  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.004631  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0387  hypothetical protein  52.78 
 
 		 168 aa  97.4  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.919602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0376  hypothetical protein  38.57 
 
 		 147 aa  97.4  7e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1604  protein of unknown function UPF0079  40.16 
 
 		 135 aa  97.1  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1664  hypothetical protein  36.89 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1784  protein of unknown function UPF0079  45.69 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0485483  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3084  protein of unknown function UPF0079  45.26 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.235796 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3050  hypothetical protein  47.46 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.664938  normal  0.025275 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2465  protein of unknown function UPF0079  43.48 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0181492 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1531  ATPase or kinase  37.98 
 
 		 149 aa  96.3  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2408  protein of unknown function UPF0079  43.48 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11800  conserved hypothetical nucleotide-binding protein  47.79 
 
 		 163 aa  95.1  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1522  hypothetical protein  47.18 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.229097  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3245  hypothetical protein  42.86 
 
 		 504 aa  94.7  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.479121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3281  hypothetical protein  40.3 
 
 		 144 aa  94.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1298  protein of unknown function UPF0079  41.43 
 
 		 161 aa  94  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0174  hypothetical protein  49.61 
 
 		 169 aa  94  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00309519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2157  hypothetical protein  42.65 
 
 		 165 aa  93.6  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1228  hypothetical protein  35.61 
 
 		 148 aa  93.6  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1190  ATP/GTP hydrolase  36.8 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0774  hypothetical protein  41.46 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000567369  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0073  protein of unknown function UPF0079  34.07 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1719  hypothetical protein  43.52 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.266415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0118  hypothetical protein  44.26 
 
 		 152 aa  92  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.927124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>