More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1450 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1450  histidine kinase  100 
 
 		 446 aa  894    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3618  histidine kinase  37.84 
 
 		 397 aa  280  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.261667 
 
 
-
 
NC_002950  PG0052  sensor histidine kinase  47.99 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0334  sensor histidine kinase  33.78 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4252  ATP-binding region ATPase domain protein  37.5 
 
 		 405 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2245  histidine kinase  35.83 
 
 		 382 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01685  sensor histidine kinase  40.94 
 
 		 387 aa  248  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2490  histidine kinase  46.18 
 
 		 427 aa  246  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.757093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1592  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.17 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 594 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  33.46 
 
 		 573 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 367 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 422 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1992  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0903  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 898 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345455  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1292  histidine kinase  32.03 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00188773  hitchhiker  0.0000922476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 885 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 368 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1776  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 710 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.548217  normal  0.563692 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2667  histidine kinase  33.64 
 
 		 486 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  34.76 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  32.19 
 
 		 581 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 581 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0109  histidine kinase  35.35 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000786251 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 		 489 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 		 610 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2040  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 810 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193503  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  31.09 
 
 		 419 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  35.15 
 
 		 300 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 486 aa  99.8  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  34.18 
 
 		 311 aa  99.8  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0096  histidine kinase  35.93 
 
 		 525 aa  99.8  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2122  sensor histidine kinase  30.29 
 
 		 447 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  35.19 
 
 		 630 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  33.33 
 
 		 234 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 522 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27560  signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 597 aa  97.8  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.972218  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  36.62 
 
 		 370 aa  97.4  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 498 aa  97.1  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 674 aa  97.1  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  33.62 
 
 		 611 aa  97.1  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 749 aa  96.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  38.36 
 
 		 423 aa  96.3  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4147  ATP-binding region ATPase domain protein  32.17 
 
 		 1230 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.175374 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 595 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0292  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.183452  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  26.46 
 
 		 594 aa  94.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 498 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 641 aa  94.7  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 725 aa  94  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0067  histidine kinase  34.16 
 
 		 651 aa  94.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 		 1519 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.55 
 
 		 628 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 497 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 300 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 581 aa  93.6  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0656  histidine kinase  30.8 
 
 		 417 aa  93.6  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.572092 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  33.17 
 
 		 614 aa  93.6  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  36.24 
 
 		 595 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2085  ATP-binding region ATPase domain protein  29.88 
 
 		 510 aa  93.2  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.158999  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 497 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  30.97 
 
 		 801 aa  92.8  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 		 627 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.49 
 
 		 672 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0114  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 498 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 492 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  31.28 
 
 		 617 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3020  histidine kinase  31.4 
 
 		 1282 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.883771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0937  histidine kinase  30.43 
 
 		 471 aa  92.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0532  histidine kinase  32.71 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  31.31 
 
 		 595 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3957  sensor histidine kinase KinD  27.38 
 
 		 498 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.5608 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  33.19 
 
 		 673 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2378  histidine kinase  33.18 
 
 		 418 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0564708  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1387  sensor histidine kinase KinD  26.64 
 
 		 498 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 662 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2633  histidine kinase  27.67 
 
 		 566 aa  92.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0957  Signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 355 aa  92.4  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1247  histidine kinase  30.7 
 
 		 546 aa  92  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 480 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 640 aa  91.7  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  29.35 
 
 		 458 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.37 
 
 		 367 aa  91.3  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  29.01 
 
 		 458 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 760 aa  91.7  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 473 aa  91.3  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 444 aa  91.3  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 556 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  31.11 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.38 
 
 		 604 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 714 aa  91.3  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  29.74 
 
 		 581 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 639 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.41 
 
 		 362 aa  91.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  28.52 
 
 		 458 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>