More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4252 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4252  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 405 aa  832    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2245  histidine kinase  42.67 
 
 		 382 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3618  histidine kinase  41.19 
 
 		 397 aa  306  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.261667 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2490  histidine kinase  51.92 
 
 		 427 aa  299  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.757093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0052  sensor histidine kinase  41.92 
 
 		 395 aa  292  6e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0334  sensor histidine kinase  39.6 
 
 		 391 aa  272  7e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01685  sensor histidine kinase  38.68 
 
 		 387 aa  269  8e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1592  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1450  histidine kinase  46.5 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1190  histidine kinase  30.22 
 
 		 484 aa  98.2  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.496715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1250  histidine kinase  32.08 
 
 		 498 aa  94  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.792826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3957  sensor histidine kinase KinD  32.08 
 
 		 498 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.5608 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1225  sensor histidine kinase; sporulation kinase  31.25 
 
 		 498 aa  92.8  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.485232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1424  sensor histidine kinase KinD  31.25 
 
 		 498 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267919 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1227  sensor histidine kinase; sporulation kinase  31.25 
 
 		 498 aa  92  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1252  sensor histidine kinase KinD  31.38 
 
 		 498 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1351  sensor histidine kinase KinD  31.38 
 
 		 498 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1449  sensor histidine kinase KinD  31.67 
 
 		 498 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  32.68 
 
 		 611 aa  90.5  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1490  sensor histidine kinase KinD  32.08 
 
 		 498 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0937  histidine kinase  29.96 
 
 		 471 aa  89.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1387  sensor histidine kinase KinD  31.67 
 
 		 498 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  29.3 
 
 		 234 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2579  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 761 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838184  normal  0.345494 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  28.96 
 
 		 470 aa  87.4  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1838  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 764 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0311  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.3 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2591  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 762 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.682378  normal  0.0198144 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5651  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 801 aa  84  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.285543 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 729 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1650  histidine kinase  27.07 
 
 		 612 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 753 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3327  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 510 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.26559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  23.02 
 
 		 614 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2889  sensory transduction histidine kinase; sporulation kinase A  27.8 
 
 		 801 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.516791  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 746 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3122  sporulation kinase  28.19 
 
 		 801 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3143  sporulation kinase  27.8 
 
 		 801 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.564779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 756 aa  82.4  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 755 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  27.65 
 
 		 594 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  49.5 
 
 		 1187 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2351  histidine kinase  28.33 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1745  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.18 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  27.71 
 
 		 573 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 738 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 689 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2307  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 506 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 784 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2115  sporulation kinase  28.19 
 
 		 801 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 756 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.56 
 
 		 578 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 595 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 763 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 745 aa  80.5  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  27.23 
 
 		 611 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 		 671 aa  80.1  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 586 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 756 aa  79.7  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1216  histidine kinase  28.22 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 756 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0285475 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.89 
 
 		 679 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  28.24 
 
 		 830 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1987  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 552 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 903 aa  78.2  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  29.33 
 
 		 581 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3393  sporulation kinase A  29.41 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.785669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4604  histidine kinase  27.89 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0969  sensory histidine kinase AtoS  29.61 
 
 		 622 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000351141  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  31.14 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3129  histidine kinase  26.27 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2941  histidine kinase  25.96 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2848  histidine kinase  27.41 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2233  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 552 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0296242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1500  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 560 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 630 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 540 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3670  sporulation kinase A  29.79 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.825905  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0096  histidine kinase  29.91 
 
 		 525 aa  77  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1567  sporulation kinase A  29.83 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.800828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3344  sporulation kinase A  29.41 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.09 
 
 		 539 aa  77  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  32.46 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 498 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 749 aa  77  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3674  sporulation kinase A  29.79 
 
 		 510 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.123371  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.36 
 
 		 779 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  27.88 
 
 		 674 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  46.08 
 
 		 524 aa  76.6  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0903  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 898 aa  77  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345455  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  32.46 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.27 
 
 		 756 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 566 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 666 aa  76.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.518725  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3749  sporulation kinase A  29.83 
 
 		 510 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 654 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.51 
 
 		 744 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>