More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2245 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2245  histidine kinase  100 
 
 		 382 aa  780    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0052  sensor histidine kinase  43.65 
 
 		 395 aa  322  7e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4252  ATP-binding region ATPase domain protein  42.67 
 
 		 405 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01685  sensor histidine kinase  41.64 
 
 		 387 aa  296  5e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1592  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 384 aa  293  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3618  histidine kinase  41.34 
 
 		 397 aa  288  9e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.261667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0334  sensor histidine kinase  42.43 
 
 		 391 aa  280  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2490  histidine kinase  48.94 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.757093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1450  histidine kinase  39.56 
 
 		 446 aa  246  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  32.29 
 
 		 573 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  31.98 
 
 		 581 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 581 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3957  sensor histidine kinase KinD  29.91 
 
 		 498 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.5608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 390 aa  99.8  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1387  sensor histidine kinase KinD  29.44 
 
 		 498 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1490  sensor histidine kinase KinD  30.37 
 
 		 498 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1449  sensor histidine kinase KinD  29.91 
 
 		 498 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  29.82 
 
 		 581 aa  96.7  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 498 aa  95.5  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1250  histidine kinase  29.44 
 
 		 498 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.792826  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  30.57 
 
 		 611 aa  95.1  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  29.54 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0119  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 571 aa  94.4  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.412791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  30.99 
 
 		 501 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 		 784 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 581 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1225  sensor histidine kinase; sporulation kinase  29.91 
 
 		 498 aa  93.2  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.485232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1227  sensor histidine kinase; sporulation kinase  29.44 
 
 		 498 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1424  sensor histidine kinase KinD  29.44 
 
 		 498 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267919 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.04 
 
 		 598 aa  92  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1838  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 764 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0488  histidine kinase  31.94 
 
 		 250 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 488 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1252  sensor histidine kinase KinD  29.86 
 
 		 498 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1351  sensor histidine kinase KinD  29.86 
 
 		 498 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1190  histidine kinase  31.65 
 
 		 484 aa  91.3  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.496715  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1443  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 		 753 aa  90.9  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.616255  hitchhiker  0.000358642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 394 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  31.76 
 
 		 470 aa  90.1  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 756 aa  90.1  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  31.76 
 
 		 490 aa  89.7  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 		 929 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1417  sensor histidine kinase  33.03 
 
 		 601 aa  89.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4529  sensor histidine kinase  26.72 
 
 		 418 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.8518  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  30.05 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 395 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2579  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 761 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838184  normal  0.345494 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4510  sensor histidine kinase  26.34 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0814506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 575 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 		 753 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4669  sensor histidine kinase  26.72 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 595 aa  87.4  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5029  sensor histidine kinase  26.72 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 494 aa  87.8  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 738 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4895  sensor histidine kinase  26.34 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 399 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4927  sensor histidine kinase  27.68 
 
 		 417 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.82 
 
 		 604 aa  86.7  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0076  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 427 aa  86.7  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000670582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 756 aa  86.3  7e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2591  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 762 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.682378  normal  0.0198144 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 779 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  29.19 
 
 		 595 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  30.05 
 
 		 517 aa  86.3  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3432  sporulation kinase A  31.28 
 
 		 510 aa  86.3  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0123298  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3702  sporulation kinase A  31.28 
 
 		 510 aa  86.3  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3652  sporulation kinase A  31.28 
 
 		 510 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3393  sporulation kinase A  30.34 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.785669  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3344  sporulation kinase A  30.34 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2307  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 506 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 763 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.22 
 
 		 744 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  32 
 
 		 234 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 654 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 595 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3670  sporulation kinase A  30.34 
 
 		 510 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.825905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 595 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1567  sporulation kinase A  30.34 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.800828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 595 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0739  histidine kinase  30.39 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2400  sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 608 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.774596  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3674  sporulation kinase A  30.34 
 
 		 510 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.123371  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 745 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  31.36 
 
 		 604 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 509 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 742 aa  84.7  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 594 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4604  histidine kinase  29.6 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  28.23 
 
 		 595 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  30.21 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  27.75 
 
 		 590 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0903  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 898 aa  84.3  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345455  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 582 aa  84  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  28.71 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3749  sporulation kinase A  30.34 
 
 		 510 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 630 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>