More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3196 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3196  ABC transporter related  100 
 
 		 433 aa  881    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  43.52 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  34.64 
 
 		 424 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  40.48 
 
 		 411 aa  242  9e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  40.71 
 
 		 450 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  34.63 
 
 		 423 aa  236  8e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  32.86 
 
 		 420 aa  231  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  37.04 
 
 		 408 aa  232  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  37.76 
 
 		 422 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  39.67 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  34.98 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  33.58 
 
 		 418 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  34.63 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  35.46 
 
 		 428 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  36.11 
 
 		 870 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  34.42 
 
 		 427 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  35.08 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  46.86 
 
 		 253 aa  223  6e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  34.57 
 
 		 439 aa  223  7e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  35.23 
 
 		 420 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  33.83 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  35.8 
 
 		 418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  33.77 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  38.66 
 
 		 415 aa  221  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  33.99 
 
 		 424 aa  220  5e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  47.37 
 
 		 427 aa  219  7e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  50 
 
 		 427 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  35.86 
 
 		 431 aa  219  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  34.2 
 
 		 431 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  37.94 
 
 		 438 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  34.09 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  39.5 
 
 		 429 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  34.43 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  36.53 
 
 		 411 aa  216  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  40.23 
 
 		 433 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  45.12 
 
 		 253 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  33.51 
 
 		 420 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  48.44 
 
 		 254 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  31.19 
 
 		 419 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  42 
 
 		 421 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  33.85 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  38.41 
 
 		 405 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  36.31 
 
 		 429 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  47.53 
 
 		 472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  34.1 
 
 		 410 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  46.55 
 
 		 816 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 		 422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  32.29 
 
 		 418 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  42.91 
 
 		 422 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  37.16 
 
 		 457 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  33.33 
 
 		 436 aa  213  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  46.06 
 
 		 400 aa  213  7.999999999999999e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  46.8 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  32.39 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  42.37 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  47.55 
 
 		 245 aa  210  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  47.64 
 
 		 254 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  47.64 
 
 		 254 aa  210  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  42.08 
 
 		 369 aa  209  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  45.23 
 
 		 421 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  33.86 
 
 		 406 aa  209  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1066  ABC transporter related  30.98 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  44.81 
 
 		 421 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  44.64 
 
 		 456 aa  207  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  44.53 
 
 		 435 aa  206  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  33.18 
 
 		 429 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  43.59 
 
 		 649 aa  206  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  43.83 
 
 		 241 aa  206  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  38.75 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  41.6 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  46.78 
 
 		 254 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  45.34 
 
 		 493 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  45.65 
 
 		 262 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  40.5 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  39.04 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  41.77 
 
 		 247 aa  203  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  47.11 
 
 		 264 aa  202  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  40.82 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  37.5 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  37.09 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  43.85 
 
 		 392 aa  202  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  47.5 
 
 		 247 aa  202  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  34.46 
 
 		 711 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.88 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  43.54 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  31.12 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  44.76 
 
 		 474 aa  201  3e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  44.76 
 
 		 474 aa  201  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  38.54 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2200  ABC transporter related  42.32 
 
 		 498 aa  201  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.206971  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  33.42 
 
 		 449 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  35.2 
 
 		 412 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  33.51 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  40.56 
 
 		 416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  42.15 
 
 		 244 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  32.94 
 
 		 424 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 440 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  32.5 
 
 		 488 aa  199  6e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  37.41 
 
 		 420 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  45.05 
 
 		 420 aa  199  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>