More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2763 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  93.53 
 
 		 402 aa  686    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 402 aa  778    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  69.83 
 
 		 406 aa  495  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  64.47 
 
 		 401 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  58.91 
 
 		 398 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  52.78 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  56.4 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  62.94 
 
 		 413 aa  381  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  56.99 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  51.41 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  51.41 
 
 		 389 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  60.45 
 
 		 408 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  48.23 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  48.71 
 
 		 405 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  49.35 
 
 		 405 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  49.09 
 
 		 405 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  49.09 
 
 		 405 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  50.41 
 
 		 398 aa  318  9e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  46.92 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  50.78 
 
 		 447 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  48.68 
 
 		 405 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  47.88 
 
 		 404 aa  315  8e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  49.47 
 
 		 398 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  45.73 
 
 		 404 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  48.11 
 
 		 400 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  48.11 
 
 		 400 aa  296  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  48.11 
 
 		 400 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  52.06 
 
 		 401 aa  292  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  47.73 
 
 		 388 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  46.75 
 
 		 405 aa  272  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  38.68 
 
 		 392 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  37.82 
 
 		 406 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  37.82 
 
 		 406 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  37.82 
 
 		 403 aa  266  5e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  49.3 
 
 		 400 aa  265  8e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  44.72 
 
 		 416 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  48.04 
 
 		 399 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  47.27 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  46.87 
 
 		 433 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  47.16 
 
 		 399 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  47.68 
 
 		 399 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  39.55 
 
 		 399 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  51.27 
 
 		 409 aa  245  8e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  45.33 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  40.64 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  41.44 
 
 		 385 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  47.66 
 
 		 431 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  43.17 
 
 		 399 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  44.97 
 
 		 415 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 395 aa  239  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 394 aa  239  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 399 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 403 aa  233  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  48.52 
 
 		 402 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  48.69 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000369004  unclonable  0.0000000000514998 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  46.98 
 
 		 427 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 383 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  48.43 
 
 		 427 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  48.43 
 
 		 427 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000378785  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  40.41 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  41.62 
 
 		 404 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  40.55 
 
 		 415 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 399 aa  222  9e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 399 aa  222  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 399 aa  222  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  43.5 
 
 		 419 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 407 aa  220  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  41.88 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  41.65 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  40.06 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0028  MFS permease  45 
 
 		 422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000623855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3860  major facilitator transporter  45.25 
 
 		 442 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320217  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3799  major facilitator transporter  45.25 
 
 		 433 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000291886  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  40 
 
 		 403 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  41.83 
 
 		 399 aa  211  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 		 410 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  36.76 
 
 		 401 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0556  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.363313 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  39.4 
 
 		 411 aa  211  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0236  major facilitator transporter  48.44 
 
 		 423 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00013187  hitchhiker  0.000000000803869 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  40.28 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  40.28 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  40.28 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  40.28 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  40.28 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  40.28 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  40.28 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0228  major facilitator transporter  48.53 
 
 		 425 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000132249  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  42.7 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  41.85 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  39.56 
 
 		 399 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  40.39 
 
 		 389 aa  203  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 399 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  41.58 
 
 		 398 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  41.58 
 
 		 398 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  41.84 
 
 		 398 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>