More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0828 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  95.75 
 
 
424 aa  807    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
424 aa  838    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  70.75 
 
 
429 aa  613  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  68.48 
 
 
430 aa  592  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  56.4 
 
 
425 aa  478  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  58.06 
 
 
434 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  54.63 
 
 
436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  54.27 
 
 
431 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1013  hemolysin  57.35 
 
 
424 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471918  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2673  hypothetical protein  57.35 
 
 
424 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.460279  normal  0.557621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  51.18 
 
 
431 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  53.9 
 
 
433 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  53.55 
 
 
425 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  51.18 
 
 
431 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  50.7 
 
 
436 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  49.14 
 
 
452 aa  391  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  47.29 
 
 
466 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  50.36 
 
 
434 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  45.63 
 
 
446 aa  369  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  45.97 
 
 
436 aa  352  7e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  43.94 
 
 
458 aa  347  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  43.97 
 
 
437 aa  330  2e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5623  protein of unknown function DUF21  47.03 
 
 
403 aa  326  6e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  40.39 
 
 
430 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  40.24 
 
 
440 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  40.68 
 
 
447 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  40.47 
 
 
441 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  41.45 
 
 
439 aa  303  3.0000000000000004e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  40.29 
 
 
442 aa  303  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  40.53 
 
 
443 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  40.53 
 
 
443 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  39.67 
 
 
428 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  36.82 
 
 
439 aa  300  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  39.91 
 
 
436 aa  300  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  40.6 
 
 
439 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  40.6 
 
 
439 aa  298  1e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  39.24 
 
 
436 aa  298  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  39.43 
 
 
432 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  40.33 
 
 
433 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  38.98 
 
 
432 aa  292  8e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  38.69 
 
 
438 aa  292  9e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  41.09 
 
 
444 aa  290  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  37.23 
 
 
464 aa  289  6e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  38.59 
 
 
441 aa  288  9e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  41.45 
 
 
435 aa  288  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  37.74 
 
 
442 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  39.71 
 
 
465 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  40.75 
 
 
442 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  39.34 
 
 
440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  39.58 
 
 
440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  38.68 
 
 
432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  39.11 
 
 
441 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  40 
 
 
435 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  35.54 
 
 
417 aa  281  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  40.24 
 
 
432 aa  281  2e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  38.69 
 
 
437 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  38.8 
 
 
479 aa  279  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  36.17 
 
 
443 aa  278  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  40.34 
 
 
430 aa  278  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  36.5 
 
 
460 aa  277  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  36.5 
 
 
443 aa  276  3e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  37.32 
 
 
443 aa  277  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  37.71 
 
 
436 aa  276  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  34.81 
 
 
407 aa  276  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  37.41 
 
 
448 aa  276  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  37.41 
 
 
452 aa  276  7e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  37.5 
 
 
432 aa  276  7e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  39.72 
 
 
447 aa  275  9e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  37.71 
 
 
437 aa  274  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  35.35 
 
 
454 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  38.59 
 
 
439 aa  266  4e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  36.17 
 
 
441 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  35.97 
 
 
433 aa  266  5.999999999999999e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  40 
 
 
445 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  35.38 
 
 
456 aa  264  2e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  35.05 
 
 
434 aa  264  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  35.2 
 
 
439 aa  264  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  33.66 
 
 
437 aa  263  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  36.3 
 
 
426 aa  263  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  39.71 
 
 
437 aa  263  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  33.65 
 
 
447 aa  259  4e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  33.49 
 
 
441 aa  257  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0092  hypothetical protein  39.35 
 
 
435 aa  251  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  38.33 
 
 
428 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  34.93 
 
 
447 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  34.87 
 
 
429 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  37.32 
 
 
437 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  34.11 
 
 
444 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  34.2 
 
 
453 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  34.5 
 
 
442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  34.35 
 
 
443 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  33.97 
 
 
438 aa  226  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  33.57 
 
 
440 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  34.11 
 
 
443 aa  225  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2477  protein of unknown function DUF21  32.86 
 
 
439 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0798586 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  35.19 
 
 
447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  33.49 
 
 
443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  29.65 
 
 
439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4162  protein of unknown function DUF21  33.49 
 
 
440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>