More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0449 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 298 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  95.3 
 
 		 298 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  78.86 
 
 		 298 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  70.71 
 
 		 309 aa  434  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  69.36 
 
 		 305 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  69.36 
 
 		 306 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  63.39 
 
 		 310 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1718  LysR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 299 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.239052 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 301 aa  279  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 302 aa  272  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0254  LysR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 296 aa  272  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.193331  normal  0.129991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 310 aa  267  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  44.52 
 
 		 307 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  44.52 
 
 		 307 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  45.58 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0983  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1717  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 313 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5076  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 313 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1356  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2326  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 317 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231935  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1689  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 313 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0120  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1493  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1860  transcriptional regulator, LysR family  44.59 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 302 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  45.24 
 
 		 305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1802  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 316 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0497764  normal  0.412734 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1777  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6302  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  44 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1780  LysR family substrate binding transcriptional regulator  43.09 
 
 		 306 aa  242  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1395  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 301 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.465042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1355  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 304 aa  238  8e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 301 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  41.72 
 
 		 307 aa  235  8e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 333 aa  235  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4145  transcriptional regulator, LysR family  42.14 
 
 		 315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  41.47 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.91 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1704  LysR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.743789  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2603  LysR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 555 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 301 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  43.2 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43240  LysR family transcriptional regulator protein  40.79 
 
 		 302 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 301 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 298 aa  229  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 327 aa  229  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  39.4 
 
 		 305 aa  229  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0246  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 308 aa  228  7e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 301 aa  228  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.53 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  42.71 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3081  transcriptional regulator, LysR family  41.67 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666211  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  40.4 
 
 		 302 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 295 aa  226  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2938  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.97 
 
 		 294 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.623506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 303 aa  224  1e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 322 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1743  carbonate dehydratase  41.44 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0157  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 304 aa  223  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1953  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 304 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2062  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 		 310 aa  221  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  hitchhiker  0.00696993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1070  transcriptional regulator, LysR family  41.1 
 
 		 310 aa  221  9e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651506  decreased coverage  0.00634214 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1994  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4493  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.878724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2356  transcriptional regulator, LysR family  42.37 
 
 		 307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118407  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3280  transcription regulator protein  38.76 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 303 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1234  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.628194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>