More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0563 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0563  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  77.51 
 
 		 209 aa  333  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2180  two component LuxR family transcriptional regulator  73.68 
 
 		 209 aa  321  5e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.876214 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3794  two component LuxR family transcriptional regulator  73.68 
 
 		 209 aa  321  6e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3068  two component transcriptional regulator, LuxR family  73.68 
 
 		 209 aa  321  6e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.44153  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0651  two component LuxR family transcriptional regulator  73.21 
 
 		 209 aa  319  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.713834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1595  two component LuxR family transcriptional regulator  67.94 
 
 		 209 aa  295  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0581  two component LuxR family transcriptional regulator  66.83 
 
 		 210 aa  285  4e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  50.72 
 
 		 210 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  50.72 
 
 		 210 aa  218  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 210 aa  217  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.24 
 
 		 210 aa  216  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.76 
 
 		 210 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0881  two component LuxR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 210 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 210 aa  197  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 210 aa  197  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  49.28 
 
 		 208 aa  197  9e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0922  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 212 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.5 
 
 		 210 aa  192  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.52 
 
 		 218 aa  191  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 211 aa  191  9e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4347  two component LuxR family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 218 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.705126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1508  two component LuxR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2237  two component LuxR family transcriptional regulator  44.5 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3074  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2441  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3055  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327843  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0097  two component LuxR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3052  two component LuxR family transcriptional regulator  50.24 
 
 		 218 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2966  two component LuxR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 218 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288922 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3100  two component LuxR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 218 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6403  two component LuxR family transcriptional regulator  49.76 
 
 		 271 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0209  LuxR family DNA-binding response regulator  50.24 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2133  LuxR family DNA-binding response regulator  49.76 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 215 aa  185  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2955  LuxR family DNA-binding response regulator  49.76 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0425  LuxR family DNA-binding response regulator  49.76 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0536791  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0231  LuxR family DNA-binding response regulator  49.76 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.214964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3391  LuxR family DNA-binding response regulator  49.76 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0243  LuxR family DNA-binding response regulator  49.76 
 
 		 218 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3290  LuxR family DNA-binding response regulator  49.76 
 
 		 455 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 210 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1089  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 210 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1873  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3494  two component LuxR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 226 aa  177  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 210 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  42.58 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  42.58 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  42.58 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  42.58 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  42.58 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  42.58 
 
 		 282 aa  174  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  40.67 
 
 		 215 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 209 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.19 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  38.28 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 215 aa  168  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4792  two component LuxR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.951072 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  38.28 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  166  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  38.76 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7047  two component LuxR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  37.38 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0441  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1235  two component LuxR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0444  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.577588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0410  LuxR family two component transcriptional regulator  40.19 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 210 aa  160  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  35.89 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  38.28 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2078  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0901  two component LuxR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 235 aa  159  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5813  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118405 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  37.32 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  37.32 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  36.84 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  37.32 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  36.84 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>