160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4153 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4153  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  277  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.280027  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4412  hypothetical protein  82.44 
 
 
132 aa  230  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  5.85754e-05  normal  0.649702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3806  hypothetical protein  73.28 
 
 
132 aa  218  2e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3828  hypothetical protein  68.7 
 
 
132 aa  203  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4566  putative thiolase subunit  67.18 
 
 
132 aa  198  2e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00449482  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5500  hypothetical protein  56.82 
 
 
132 aa  165  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2351  hypothetical protein  47.62 
 
 
130 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387375  normal  0.674763 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3114  hypothetical protein  47.24 
 
 
130 aa  145  2e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0274298  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3606  protein of unknown function DUF35  44.96 
 
 
130 aa  138  2e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.215549  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5005  hypothetical protein  47.93 
 
 
129 aa  137  4e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  0.0828633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1758  hypothetical protein  48.31 
 
 
130 aa  133  1e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.799098  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4786  hypothetical protein  52.46 
 
 
144 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259655  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1501  hypothetical protein  42.15 
 
 
133 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5096  hypothetical protein  51.24 
 
 
128 aa  115  1e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5254  hypothetical protein  38.66 
 
 
133 aa  100  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2662  hypothetical protein  41.9 
 
 
136 aa  97.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1602  hypothetical protein  36.22 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5281  hypothetical protein  38.14 
 
 
146 aa  83.2  1e-15  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0860  hypothetical protein  34.96 
 
 
138 aa  80.5  7e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4045  hypothetical protein  35.96 
 
 
141 aa  77  8e-14  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.589309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1880  hypothetical protein  35.61 
 
 
137 aa  76.3  1e-13  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0682045 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5301  hypothetical protein  30.4 
 
 
143 aa  75.1  3e-13  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.653983 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4265  hypothetical protein  31.45 
 
 
146 aa  74.7  4e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16799  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  34.71 
 
 
135 aa  74.3  5e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0235  hypothetical protein  32.8 
 
 
136 aa  73.9  6e-13  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.737012  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2745  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon  31.45 
 
 
135 aa  73.6  9e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0775897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1979  protein of unknown function DUF35  31.5 
 
 
137 aa  73.2  1e-12  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0353441  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5112  hypothetical protein  35.65 
 
 
132 aa  72.8  1e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  9.23569e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3587  hypothetical protein  31.82 
 
 
137 aa  72.4  2e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2010  hypothetical protein  30.89 
 
 
137 aa  72  2e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392361  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2378  hypothetical protein  35.71 
 
 
143 aa  70.9  5e-12  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.301734  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2337  protein of unknown function DUF35  33.33 
 
 
149 aa  70.9  6e-12  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7489  hypothetical protein  31.39 
 
 
139 aa  70.5  7e-12  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.840415  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4493  hypothetical protein  32.54 
 
 
148 aa  70.1  9e-12  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0843  hypothetical protein  38.89 
 
 
145 aa  69.7  1e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1687  hypothetical protein  31.5 
 
 
137 aa  69.7  1e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0475632  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0343  hypothetical protein  35.4 
 
 
119 aa  68.9  2e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619973  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5775  protein of unknown function DUF35  37.11 
 
 
129 aa  68.6  3e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0423668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3402  hypothetical protein  30.16 
 
 
136 aa  68.6  3e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0631046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8760  protein of unknown function DUF35  36.89 
 
 
140 aa  68.6  3e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.108371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1832  hypothetical protein  30.4 
 
 
138 aa  68.2  4e-11  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0184205  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1804  hypothetical protein  31.71 
 
 
140 aa  67.8  5e-11  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4268  hypothetical protein  35.71 
 
 
140 aa  67.4  7e-11  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0510  hypothetical protein  32.2 
 
 
143 aa  66.2  1e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3511  hypothetical protein  36.11 
 
 
131 aa  66.2  1e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6630  hypothetical protein  36.36 
 
 
120 aa  66.2  2e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0233518  normal  0.987358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2101  hypothetical protein  33.61 
 
 
139 aa  65.5  2e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.416637  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1994  hypothetical protein  32.71 
 
 
120 aa  65.1  3e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.253194  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6482  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  65.5  3e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2138  hypothetical protein  33.61 
 
 
321 aa  65.1  3e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2932  hypothetical protein  29.13 
 
 
137 aa  65.5  3e-10  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.241273  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  33.04 
 
 
131 aa  64.7  4e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  33.33 
 
 
548 aa  64.7  4e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5278  hypothetical protein  36.07 
 
 
135 aa  64.7  4e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  31.03 
 
 
550 aa  64.3  5e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  31.03 
 
 
550 aa  64.3  5e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  33.33 
 
 
548 aa  64.7  5e-10  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0032  hypothetical protein  32.26 
 
 
138 aa  63.9  6e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.662095  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2934  hypothetical protein  31.67 
 
 
144 aa  63.9  7e-10  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  31.03 
 
 
550 aa  63.5  8e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0042  hypothetical protein  32.26 
 
 
138 aa  63.5  1e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0051  hypothetical protein  32.26 
 
 
138 aa  63.5  1e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0173713  normal  0.0421472 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2152  hypothetical protein  32.69 
 
 
311 aa  62.8  2e-09  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4179  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  62  3e-09  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0859  hypothetical protein  27.73 
 
 
132 aa  61.6  4e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0302426  normal  0.401608 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1972  nucleic-acid-binding protein containing a Zn-ribbon-like protein  30.17 
 
 
150 aa  60.8  7e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8196  hypothetical protein  30.25 
 
 
319 aa  60.5  8e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4054  hypothetical protein  33.05 
 
 
151 aa  60.1  9e-09  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0163629  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0892  hypothetical protein  30.65 
 
 
142 aa  60.1  1e-08  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.204366  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6844  hypothetical protein  35.51 
 
 
121 aa  59.7  1e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  35.9 
 
 
541 aa  59.7  1e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  29.75 
 
 
137 aa  59.3  2e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0128  hypothetical protein  36.11 
 
 
127 aa  58.9  2e-08  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0146  protein of unknown function DUF35  36.11 
 
 
127 aa  59.3  2e-08  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0178  hypothetical protein  36.11 
 
 
134 aa  58.5  3e-08  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82614  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3541  hypothetical protein  31.2 
 
 
156 aa  57.8  4e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0915855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  32.23 
 
 
135 aa  57.8  5e-08  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3482  protein of unknown function DUF35  30.58 
 
 
319 aa  57.8  6e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0351  hypothetical protein  30.89 
 
 
141 aa  57.4  6e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  5.46433e-07  hitchhiker  6.44081e-06 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0616  hypothetical protein  34.59 
 
 
176 aa  57.4  7e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.11399  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2788  hypothetical protein  27.5 
 
 
132 aa  57  9e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.159844  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0149  hypothetical protein  31.62 
 
 
129 aa  55.8  2e-07  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3225  hypothetical protein  31.13 
 
 
145 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.730825  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3214  hypothetical protein  31.13 
 
 
145 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.907218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3276  hypothetical protein  31.13 
 
 
145 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0528  hypothetical protein  33.98 
 
 
129 aa  55.5  2e-07  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.825077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51200  hypothetical protein  38.68 
 
 
128 aa  55.8  2e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.719355  hitchhiker  5.82925e-06 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4020  hypothetical protein  30.17 
 
 
141 aa  55.1  3e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.909625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3318  hypothetical protein  33.05 
 
 
312 aa  55.5  3e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000206651 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5554  hypothetical protein  29.46 
 
 
157 aa  53.5  8e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2276  hypothetical protein  32.74 
 
 
123 aa  53.5  8e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501265 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3652  hypothetical protein  27.82 
 
 
136 aa  53.5  9e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.92305  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  30.25 
 
 
155 aa  53.5  9e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4072  hypothetical protein  33.08 
 
 
142 aa  53.1  1e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2840  protein of unknown function DUF35  32.77 
 
 
132 aa  52.8  1e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1644  hypothetical protein  26.19 
 
 
152 aa  52  3e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.982412  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1671  hypothetical protein  26.19 
 
 
152 aa  52  3e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5850  hypothetical protein  25.4 
 
 
152 aa  52  3e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0806522  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0530  hypothetical protein  26.19 
 
 
152 aa  52  3e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1695  hypothetical protein  26.19 
 
 
152 aa  52  3e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>