More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3641 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  62.49 
 
 
1151 aa  1330    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  68.36 
 
 
1139 aa  1491    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
1138 aa  2297    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  61.14 
 
 
1141 aa  1313    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  57.62 
 
 
1149 aa  1179    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  61.93 
 
 
1148 aa  1330    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  62.84 
 
 
1151 aa  1343    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.42 
 
 
1117 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  32.92 
 
 
1105 aa  522  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  34.92 
 
 
1122 aa  516  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  32.23 
 
 
1048 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  39.85 
 
 
1063 aa  406  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  33.78 
 
 
1134 aa  395  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.59 
 
 
1081 aa  354  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  32.38 
 
 
1093 aa  353  8.999999999999999e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.8 
 
 
1089 aa  353  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.5 
 
 
1080 aa  351  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  30.2 
 
 
1377 aa  345  2e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  28.73 
 
 
1037 aa  332  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 
1403 aa  328  4.0000000000000003e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.74 
 
 
1291 aa  327  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.88 
 
 
1175 aa  323  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.49 
 
 
1055 aa  307  8.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  30.55 
 
 
1065 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  28.67 
 
 
1046 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  30.4 
 
 
1043 aa  302  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  27.96 
 
 
1055 aa  296  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  27.37 
 
 
1160 aa  295  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 
1402 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.98 
 
 
1014 aa  283  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.59 
 
 
1053 aa  280  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  29.85 
 
 
1227 aa  277  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  31.64 
 
 
1050 aa  275  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.64 
 
 
1050 aa  275  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  28.38 
 
 
1123 aa  254  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  29.54 
 
 
1142 aa  251  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  29.08 
 
 
1094 aa  243  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.71 
 
 
1429 aa  234  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.51 
 
 
1360 aa  232  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.45 
 
 
1403 aa  225  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.9 
 
 
1422 aa  224  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  28.21 
 
 
1126 aa  222  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  29.12 
 
 
1198 aa  217  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  27.92 
 
 
1271 aa  206  3e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  24.45 
 
 
1398 aa  200  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.54 
 
 
1023 aa  197  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.53 
 
 
1087 aa  197  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  28.08 
 
 
1027 aa  196  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 
1298 aa  196  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  28.22 
 
 
1027 aa  195  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  28.22 
 
 
1027 aa  195  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  26.81 
 
 
1441 aa  192  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.89 
 
 
1226 aa  191  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  29.54 
 
 
1204 aa  190  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.68 
 
 
1285 aa  189  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.05 
 
 
1295 aa  186  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0816  transcriptional activator domain protein  24.6 
 
 
1133 aa  185  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437222  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.45 
 
 
1096 aa  183  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.03 
 
 
1190 aa  181  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3066  serine/threonine protein kinase  23.67 
 
 
1311 aa  180  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.454085  normal  0.0824446 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  27.25 
 
 
1067 aa  175  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  25.72 
 
 
1358 aa  175  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  24.48 
 
 
1349 aa  164  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  21.3 
 
 
1153 aa  164  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 
1190 aa  161  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4507  serine/threonine protein kinase  24.73 
 
 
1342 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5139  serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 
1349 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5720  serine/threonine protein kinase  24.62 
 
 
1349 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.793186  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4989  serine/threonine protein kinase  24.48 
 
 
1348 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  26.58 
 
 
1264 aa  154  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0514  protein kinase domain-containing protein  24.9 
 
 
1353 aa  154  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0619  protein kinase domain-containing protein  25.03 
 
 
1359 aa  140  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.646002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
665 aa  136  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  25.92 
 
 
1034 aa  135  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
320 aa  135  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
320 aa  135  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  28.37 
 
 
1015 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0020  protein kinase domain-containing protein  25.18 
 
 
1213 aa  131  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0634  putative serine/threonine protein kinase  24.87 
 
 
1359 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0801  protein kinase domain-containing protein  24.87 
 
 
1359 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.423888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2866  protein kinase domain-containing protein  25.18 
 
 
1359 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2217  protein kinase domain-containing protein  25.18 
 
 
1350 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0639983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2490  protein kinase domain-containing protein  25.18 
 
 
1359 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460465  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  27.47 
 
 
1029 aa  130  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3160  serine/threonine protein kinase  27.2 
 
 
956 aa  129  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.1 
 
 
735 aa  128  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  32.95 
 
 
859 aa  127  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  29.55 
 
 
966 aa  125  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
696 aa  124  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2055  ATPase-like protein  25.73 
 
 
1289 aa  124  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.125092  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5333  transcriptional regulator, LuxR family  28.93 
 
 
992 aa  123  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0078  transcriptional activator domain-containing protein  25.55 
 
 
914 aa  123  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323405  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  34.26 
 
 
858 aa  123  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.2 
 
 
805 aa  122  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  33.78 
 
 
864 aa  122  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3733  transcriptional regulator, LuxR family  28.85 
 
 
1007 aa  122  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.2 
 
 
1055 aa  121  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  33.18 
 
 
641 aa  122  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  36.32 
 
 
744 aa  121  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3549  transcriptional regulator, LuxR family  29.48 
 
 
1022 aa  120  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>