224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4387 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4387  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  249  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.177424  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1808  protein of unknown function DUF45  90.09 
 
 		 111 aa  207  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2686  hypothetical protein  77 
 
 		 103 aa  162  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1669  metal-dependent hydrolase-like  70.45 
 
 		 137 aa  133  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000580277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1094  protein of unknown function DUF45  59.79 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1091  protein of unknown function DUF45  59.04 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00838265  normal  0.159075 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1899  hypothetical protein  59.04 
 
 		 92 aa  104  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3111  metal-dependent hydrolase  53.01 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0228  hypothetical protein  49.4 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1174  hypothetical protein  53.01 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0259  hypothetical protein  48.19 
 
 		 149 aa  90.5  7e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0312  protein of unknown function DUF45  49.41 
 
 		 106 aa  87  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.137336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1569  hypothetical protein  47.73 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.184826  unclonable  0.0000116524 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0338  protein of unknown function DUF45  44.68 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.860406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1155  metal-dependent hydrolase-like  56.96 
 
 		 111 aa  83.6  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.439664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2219  protein of unknown function DUF45  48.19 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2282  protein of unknown function DUF45  48.19 
 
 		 108 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.879838  hitchhiker  0.00256901 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0142  protein of unknown function DUF45  49.4 
 
 		 107 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.596952  normal  0.717523 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0842  hypothetical protein  46.99 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0970  protein of unknown function DUF45  46.99 
 
 		 111 aa  78.2  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.473345  normal  0.177309 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  36.36 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0561  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1069  hypothetical protein  35.44 
 
 		 225 aa  63.9  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.887273  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  37.18 
 
 		 198 aa  63.5  0.0000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1772  hypothetical protein  38.46 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.236777  normal  0.415522 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  32.56 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  38.03 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  39.73 
 
 		 254 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  38.2 
 
 		 202 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  37.04 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  39.02 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  28.4 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  32.93 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  37.04 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  31.03 
 
 		 251 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  37.18 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0609  hypothetical protein  32.99 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  34.21 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  42.19 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  40.3 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  37.18 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0661  zinc protease, putative  43.28 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.792264  normal  0.0577046 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  34.62 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2550  hypothetical protein  36.99 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  24.49 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0804  zinc metalloprotease, putative  36.11 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  29 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  34.57 
 
 		 239 aa  54.3  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  33.82 
 
 		 219 aa  53.9  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1339  hypothetical protein  35.71 
 
 		 243 aa  54.3  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  32.56 
 
 		 240 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  38.33 
 
 		 258 aa  53.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  37.66 
 
 		 261 aa  53.9  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  35.14 
 
 		 242 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  36.99 
 
 		 240 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  27.71 
 
 		 241 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  27.38 
 
 		 221 aa  53.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  42.37 
 
 		 247 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0406  hypothetical protein  31.94 
 
 		 257 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.317112  normal  0.0115722 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  35.9 
 
 		 241 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  24.49 
 
 		 220 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  31.11 
 
 		 262 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1624  hypothetical protein  35.06 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.594523  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  38.46 
 
 		 222 aa  52  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  25.51 
 
 		 215 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  33.33 
 
 		 242 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1800  hypothetical protein  37.31 
 
 		 222 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.404735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  26.83 
 
 		 243 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  40 
 
 		 242 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  35.82 
 
 		 224 aa  51.6  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  32.88 
 
 		 247 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  34.67 
 
 		 253 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0937  protein of unknown function DUF45  39.24 
 
 		 175 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  31.65 
 
 		 238 aa  51.6  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  33.73 
 
 		 239 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  28.95 
 
 		 235 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  33.78 
 
 		 218 aa  50.8  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  30.49 
 
 		 259 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1416  putative metal-dependent hydrolase  33.33 
 
 		 268 aa  50.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  38.33 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  26.88 
 
 		 235 aa  50.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  41.07 
 
 		 254 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  31.4 
 
 		 240 aa  50.8  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  35.62 
 
 		 241 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  35.62 
 
 		 260 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  41.82 
 
 		 222 aa  50.4  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  36.9 
 
 		 247 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  41.82 
 
 		 222 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  32.47 
 
 		 252 aa  50.4  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  40.54 
 
 		 242 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl659  zinc metalloprotease  34.72 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1561  zinc protease, putative  36.92 
 
 		 244 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  37.04 
 
 		 265 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  34.21 
 
 		 242 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  35.9 
 
 		 268 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  31.17 
 
 		 222 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  32.35 
 
 		 246 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4036  hypothetical protein  34.33 
 
 		 234 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  27.91 
 
 		 232 aa  48.9  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>