277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0937 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0937  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
175 aa  352  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.397876  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07620  predicted metal-dependent hydrolase  70.76 
 
 
201 aa  240  7.999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.966751  normal  0.648637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2959  hypothetical protein  58.86 
 
 
213 aa  180  9.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0212989  normal  0.321513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3802  protein of unknown function DUF45  61.59 
 
 
191 aa  180  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0827379  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3736  protein of unknown function DUF45  61.01 
 
 
174 aa  179  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7934  protein of unknown function DUF45  58.18 
 
 
180 aa  178  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8351  metal-dependent hydrolase-like protein  57.14 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27520  predicted metal-dependent hydrolase  52.05 
 
 
203 aa  171  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0533  metal-dependent hydrolase  57.8 
 
 
210 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4380  hypothetical protein  56.55 
 
 
178 aa  157  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2465  protein of unknown function DUF45  53.74 
 
 
236 aa  154  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0731519  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0790  protein of unknown function DUF45  57.5 
 
 
184 aa  153  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1523  hypothetical protein  59.39 
 
 
170 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.767416  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1185  protein of unknown function DUF45  51.33 
 
 
258 aa  150  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.149779 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4225  protein of unknown function DUF45  50.64 
 
 
173 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4114  hypothetical protein  51.95 
 
 
172 aa  149  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26654  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3733  hypothetical protein  50.97 
 
 
172 aa  147  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.586168  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0720  protein of unknown function DUF45  48.65 
 
 
206 aa  144  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2891  protein of unknown function DUF45  54.05 
 
 
208 aa  136  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00416901  hitchhiker  0.00700023 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1766  hypothetical protein  49.09 
 
 
241 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2474  protein of unknown function DUF45  48.73 
 
 
211 aa  134  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000651268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2752  hypothetical protein  43.48 
 
 
211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139128  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11430  predicted metal-dependent hydrolase  44.44 
 
 
220 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.715007  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0278  hypothetical protein  41.88 
 
 
164 aa  122  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19100  predicted metal-dependent hydrolase  40.24 
 
 
198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.155698  normal  0.193452 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15040  predicted metal-dependent hydrolase  40.68 
 
 
222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0609  hypothetical protein  31.45 
 
 
179 aa  72  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  42.02 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2267  hypothetical protein  46.34 
 
 
217 aa  64.7  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.083076  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  34.45 
 
 
184 aa  63.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  36.54 
 
 
249 aa  63.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  45.05 
 
 
245 aa  62.4  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  47.3 
 
 
246 aa  61.6  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  44.62 
 
 
241 aa  60.5  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  44.44 
 
 
222 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  42.65 
 
 
236 aa  58.9  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3363  hypothetical protein  50.77 
 
 
249 aa  59.3  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.211491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  43.28 
 
 
247 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  51.92 
 
 
243 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  48.48 
 
 
242 aa  58.9  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  49.21 
 
 
254 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4887  hypothetical protein  47.76 
 
 
243 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.334239  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  38.75 
 
 
251 aa  57.8  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  41.77 
 
 
224 aa  57.8  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1800  protein of unknown function DUF45  37.6 
 
 
240 aa  57.8  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.322708  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  43.4 
 
 
222 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl659  zinc metalloprotease  35.59 
 
 
238 aa  57  0.0000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  32.05 
 
 
230 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  31.3 
 
 
251 aa  57.4  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3889  hypothetical protein  28.49 
 
 
196 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  43.4 
 
 
222 aa  57  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  33.9 
 
 
221 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  44.78 
 
 
244 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  48.21 
 
 
202 aa  56.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  46.15 
 
 
227 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  32.31 
 
 
215 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0430  hypothetical protein  48.44 
 
 
241 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  42.37 
 
 
252 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3952  protein of unknown function DUF45  43.28 
 
 
252 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  25.47 
 
 
243 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0312  protein of unknown function DUF45  38.75 
 
 
106 aa  55.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.137336 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1416  putative metal-dependent hydrolase  45.9 
 
 
268 aa  55.8  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0355  hypothetical protein  43.28 
 
 
279 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  37.5 
 
 
222 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  28.47 
 
 
242 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  41.07 
 
 
245 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  30.51 
 
 
220 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3318  hypothetical protein  38.81 
 
 
196 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  52.94 
 
 
286 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  33.77 
 
 
226 aa  55.1  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  52.94 
 
 
292 aa  55.1  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  37.29 
 
 
221 aa  55.1  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  51.92 
 
 
319 aa  55.1  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  28.81 
 
 
215 aa  54.7  0.0000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  40.32 
 
 
240 aa  54.7  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  42.47 
 
 
224 aa  54.7  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  44.23 
 
 
227 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0970  protein of unknown function DUF45  50 
 
 
111 aa  54.7  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.473345  normal  0.177309 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0064  hypothetical protein  45.45 
 
 
278 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0338  protein of unknown function DUF45  48 
 
 
102 aa  54.7  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.860406 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0842  hypothetical protein  50 
 
 
111 aa  54.7  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  46.15 
 
 
244 aa  54.7  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  40.3 
 
 
253 aa  54.3  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4279  protein of unknown function DUF45  41.79 
 
 
252 aa  54.3  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0125  hypothetical protein  45.45 
 
 
256 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84591  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1837  protein of unknown function DUF45  43.28 
 
 
247 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0259  hypothetical protein  41.89 
 
 
149 aa  54.3  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  40.68 
 
 
240 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  40.3 
 
 
253 aa  53.9  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2293  hypothetical protein  38.75 
 
 
227 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  34.55 
 
 
215 aa  53.9  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0131  hypothetical protein  45.45 
 
 
278 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.249542 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  31.51 
 
 
232 aa  53.9  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  40.3 
 
 
255 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  39.18 
 
 
314 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  44.64 
 
 
242 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  48.15 
 
 
261 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  49.06 
 
 
241 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0142  protein of unknown function DUF45  48.98 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.596952  normal  0.717523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0228  hypothetical protein  44.78 
 
 
278 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.31038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>